Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2E6

DTX4, E3 ubiquitin-protein ligase DTX4, humanhuman

Predictions only

Length 619 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DTX4Q9Y2E6 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
DTX4Q9Y2E6 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
DTX4Q9Y2E6 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
DTX4Q9Y2E6 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
DTX4Q9Y2E6 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
DTX4Q9Y2E6 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
DTX4Q9Y2E6 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
DTX4Q9Y2E6 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
DTX4Q9Y2E6 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
DTX4Q9Y2E6 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
DTX4Q9Y2E6 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
DTX4Q9Y2E6 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
DTX4Q9Y2E6 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
DTX4Q9Y2E6 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
DTX4Q9Y2E6 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
DTX4Q9Y2E6 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
DTX4Q9Y2E6 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
DTX4Q9Y2E6 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
DTX4Q9Y2E6 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
DTX4Q9Y2E6 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
DTX4Q9Y2E6 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
DTX4Q9Y2E6 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
DTX4Q9Y2E6 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
DTX4Q9Y2E6 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
DTX4Q9Y2E6 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
DTX4Q9Y2E6 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
DTX4Q9Y2E6 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
DTX4Q9Y2E6 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
DTX4Q9Y2E6 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
DTX4Q9Y2E6 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
DTX4Q9Y2E6 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
DTX4Q9Y2E6 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
DTX4Q9Y2E6 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
DTX4Q9Y2E6 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
DTX4Q9Y2E6 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
DTX4Q9Y2E6 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
DTX4Q9Y2E6 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
DTX4Q9Y2E6 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
DTX4Q9Y2E6 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
DTX4Q9Y2E6 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
DTX4Q9Y2E6 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
DTX4Q9Y2E6 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
DTX4Q9Y2E6 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
DTX4Q9Y2E6 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
DTX4Q9Y2E6 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
DTX4Q9Y2E6 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
DTX4Q9Y2E6 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
DTX4Q9Y2E6 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
DTX4Q9Y2E6 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
DTX4Q9Y2E6 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
DTX4Q9Y2E6 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
DTX4Q9Y2E6 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
DTX4Q9Y2E6 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
DTX4Q9Y2E6 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
DTX4Q9Y2E6 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
DTX4Q9Y2E6 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
DTX4Q9Y2E6 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
DTX4Q9Y2E6 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
DTX4Q9Y2E6 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
DTX4Q9Y2E6 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
DTX4Q9Y2E6 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
DTX4Q9Y2E6 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
DTX4Q9Y2E6 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
DTX4Q9Y2E6 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
DTX4Q9Y2E6 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
DTX4Q9Y2E6 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
DTX4Q9Y2E6 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
DTX4Q9Y2E6 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
DTX4Q9Y2E6 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
DTX4Q9Y2E6 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
DTX4Q9Y2E6 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
DTX4Q9Y2E6 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
DTX4Q9Y2E6 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
DTX4Q9Y2E6 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
DTX4Q9Y2E6 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
DTX4Q9Y2E6 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
DTX4Q9Y2E6 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
DTX4Q9Y2E6 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
DTX4Q9Y2E6 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
DTX4Q9Y2E6 TBX5-203ENST00000405440 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
DTX4Q9Y2E6 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
DTX4Q9Y2E6 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
DTX4Q9Y2E6 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
DTX4Q9Y2E6 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
DTX4Q9Y2E6 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
DTX4Q9Y2E6 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
DTX4Q9Y2E6 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
DTX4Q9Y2E6 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
DTX4Q9Y2E6 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
DTX4Q9Y2E6 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
DTX4Q9Y2E6 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
DTX4Q9Y2E6 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
DTX4Q9Y2E6 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
DTX4Q9Y2E6 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
DTX4Q9Y2E6 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
DTX4Q9Y2E6 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
DTX4Q9Y2E6 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
DTX4Q9Y2E6 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
DTX4Q9Y2E6 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
DTX4Q9Y2E6 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.7 ms