Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPX0

IGSF9B, Protein turtle homolog B, humanhuman

Predictions only

Length 1,349 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGSF9BQ9UPX0 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
IGSF9BQ9UPX0 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
IGSF9BQ9UPX0 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
IGSF9BQ9UPX0 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
IGSF9BQ9UPX0 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
IGSF9BQ9UPX0 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
IGSF9BQ9UPX0 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
IGSF9BQ9UPX0 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
IGSF9BQ9UPX0 MRPL2-201ENST00000230413 899 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
IGSF9BQ9UPX0 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
IGSF9BQ9UPX0 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
IGSF9BQ9UPX0 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
IGSF9BQ9UPX0 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
IGSF9BQ9UPX0 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
IGSF9BQ9UPX0 BAX-206ENST00000415969 540 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
IGSF9BQ9UPX0 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
IGSF9BQ9UPX0 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
IGSF9BQ9UPX0 DUX4L27-201ENST00000554796 1261 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
IGSF9BQ9UPX0 PTPRS-208ENST00000590509 893 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
IGSF9BQ9UPX0 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
IGSF9BQ9UPX0 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
IGSF9BQ9UPX0 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
IGSF9BQ9UPX0 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
IGSF9BQ9UPX0 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
IGSF9BQ9UPX0 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
IGSF9BQ9UPX0 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
IGSF9BQ9UPX0 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
IGSF9BQ9UPX0 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
IGSF9BQ9UPX0 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
IGSF9BQ9UPX0 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
IGSF9BQ9UPX0 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
IGSF9BQ9UPX0 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
IGSF9BQ9UPX0 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
IGSF9BQ9UPX0 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
IGSF9BQ9UPX0 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
IGSF9BQ9UPX0 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
IGSF9BQ9UPX0 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
IGSF9BQ9UPX0 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
IGSF9BQ9UPX0 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
IGSF9BQ9UPX0 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
IGSF9BQ9UPX0 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
IGSF9BQ9UPX0 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
IGSF9BQ9UPX0 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
IGSF9BQ9UPX0 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
IGSF9BQ9UPX0 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
IGSF9BQ9UPX0 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
IGSF9BQ9UPX0 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
IGSF9BQ9UPX0 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
IGSF9BQ9UPX0 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
IGSF9BQ9UPX0 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
IGSF9BQ9UPX0 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
IGSF9BQ9UPX0 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
IGSF9BQ9UPX0 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
IGSF9BQ9UPX0 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
IGSF9BQ9UPX0 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
IGSF9BQ9UPX0 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
IGSF9BQ9UPX0 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
IGSF9BQ9UPX0 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
IGSF9BQ9UPX0 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
IGSF9BQ9UPX0 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
IGSF9BQ9UPX0 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
IGSF9BQ9UPX0 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
IGSF9BQ9UPX0 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
IGSF9BQ9UPX0 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
IGSF9BQ9UPX0 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
IGSF9BQ9UPX0 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
IGSF9BQ9UPX0 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
IGSF9BQ9UPX0 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
IGSF9BQ9UPX0 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
IGSF9BQ9UPX0 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
IGSF9BQ9UPX0 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
IGSF9BQ9UPX0 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
IGSF9BQ9UPX0 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
IGSF9BQ9UPX0 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
IGSF9BQ9UPX0 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
IGSF9BQ9UPX0 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
IGSF9BQ9UPX0 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
IGSF9BQ9UPX0 RBX1-201ENST00000216225 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
IGSF9BQ9UPX0 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
IGSF9BQ9UPX0 AC004865.2-202ENST00000444348 852 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
IGSF9BQ9UPX0 PRICKLE2-AS1-203ENST00000476308 623 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
IGSF9BQ9UPX0 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
IGSF9BQ9UPX0 NRK-203ENST00000536164 908 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
IGSF9BQ9UPX0 LMO7-AS1-202ENST00000568735 467 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
IGSF9BQ9UPX0 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
IGSF9BQ9UPX0 INO80C-206ENST00000586489 594 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
IGSF9BQ9UPX0 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
IGSF9BQ9UPX0 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
IGSF9BQ9UPX0 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
IGSF9BQ9UPX0 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
IGSF9BQ9UPX0 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
IGSF9BQ9UPX0 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
IGSF9BQ9UPX0 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
IGSF9BQ9UPX0 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
IGSF9BQ9UPX0 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
IGSF9BQ9UPX0 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
IGSF9BQ9UPX0 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
IGSF9BQ9UPX0 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
IGSF9BQ9UPX0 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
IGSF9BQ9UPX0 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 179.2 ms