Protein–RNA interactions for Protein: Q9UNS2

COPS3, COP9 signalosome complex subunit 3, humanhuman

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Length 423 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS3Q9UNS2 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
COPS3Q9UNS2 ASF1A-201ENST00000229595 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
COPS3Q9UNS2 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
COPS3Q9UNS2 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
COPS3Q9UNS2 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
COPS3Q9UNS2 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
COPS3Q9UNS2 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
COPS3Q9UNS2 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
COPS3Q9UNS2 SH3BP2-207ENST00000503393 9158 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
COPS3Q9UNS2 ARFGAP1-210ENST00000519273 3176 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
COPS3Q9UNS2 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
COPS3Q9UNS2 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
COPS3Q9UNS2 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
COPS3Q9UNS2 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
COPS3Q9UNS2 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
COPS3Q9UNS2 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC14.83□□□□□ -0.04
COPS3Q9UNS2 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
COPS3Q9UNS2 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
COPS3Q9UNS2 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
COPS3Q9UNS2 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
COPS3Q9UNS2 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
COPS3Q9UNS2 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
COPS3Q9UNS2 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
COPS3Q9UNS2 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
COPS3Q9UNS2 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
COPS3Q9UNS2 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
COPS3Q9UNS2 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
COPS3Q9UNS2 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
COPS3Q9UNS2 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
COPS3Q9UNS2 PLAGL1-206ENST00000416623 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
COPS3Q9UNS2 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
COPS3Q9UNS2 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
COPS3Q9UNS2 OR4D1-202ENST00000641449 4925 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.04
COPS3Q9UNS2 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
COPS3Q9UNS2 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
COPS3Q9UNS2 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
COPS3Q9UNS2 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
COPS3Q9UNS2 MMP25-201ENST00000336577 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
COPS3Q9UNS2 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
COPS3Q9UNS2 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
COPS3Q9UNS2 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
COPS3Q9UNS2 BCAR1-202ENST00000393420 2667 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
COPS3Q9UNS2 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
COPS3Q9UNS2 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
COPS3Q9UNS2 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
COPS3Q9UNS2 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
COPS3Q9UNS2 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
COPS3Q9UNS2 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
COPS3Q9UNS2 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
COPS3Q9UNS2 HELZ2-202ENST00000427522 7827 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
COPS3Q9UNS2 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
COPS3Q9UNS2 VSIG10L-201ENST00000335624 3397 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
COPS3Q9UNS2 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
COPS3Q9UNS2 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
COPS3Q9UNS2 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
COPS3Q9UNS2 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
COPS3Q9UNS2 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
COPS3Q9UNS2 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
COPS3Q9UNS2 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
COPS3Q9UNS2 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
COPS3Q9UNS2 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
COPS3Q9UNS2 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC14.82□□□□□ -0.04
COPS3Q9UNS2 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
COPS3Q9UNS2 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
COPS3Q9UNS2 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
COPS3Q9UNS2 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
COPS3Q9UNS2 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
COPS3Q9UNS2 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
COPS3Q9UNS2 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
COPS3Q9UNS2 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
COPS3Q9UNS2 XPO1-201ENST00000401558 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
COPS3Q9UNS2 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
COPS3Q9UNS2 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
COPS3Q9UNS2 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
COPS3Q9UNS2 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
COPS3Q9UNS2 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
COPS3Q9UNS2 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
COPS3Q9UNS2 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
COPS3Q9UNS2 SPAG1-202ENST00000388798 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
COPS3Q9UNS2 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
COPS3Q9UNS2 DMTN-206ENST00000443491 2415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
COPS3Q9UNS2 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
COPS3Q9UNS2 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
COPS3Q9UNS2 TEAD3-201ENST00000338863 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
COPS3Q9UNS2 ZNF180-202ENST00000391956 3049 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
COPS3Q9UNS2 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
COPS3Q9UNS2 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
COPS3Q9UNS2 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
COPS3Q9UNS2 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
COPS3Q9UNS2 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
COPS3Q9UNS2 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
COPS3Q9UNS2 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
COPS3Q9UNS2 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
COPS3Q9UNS2 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC14.81□□□□□ -0.04
COPS3Q9UNS2 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC14.81□□□□□ -0.04
COPS3Q9UNS2 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
COPS3Q9UNS2 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
COPS3Q9UNS2 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
COPS3Q9UNS2 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
COPS3Q9UNS2 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
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