Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULC6

PADI1, Protein-arginine deiminase type-1, humanhuman

Predictions only

Length 663 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PADI1Q9ULC6 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PADI1Q9ULC6 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PADI1Q9ULC6 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PADI1Q9ULC6 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PADI1Q9ULC6 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PADI1Q9ULC6 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PADI1Q9ULC6 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PADI1Q9ULC6 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PADI1Q9ULC6 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PADI1Q9ULC6 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
PADI1Q9ULC6 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PADI1Q9ULC6 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PADI1Q9ULC6 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PADI1Q9ULC6 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PADI1Q9ULC6 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PADI1Q9ULC6 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PADI1Q9ULC6 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PADI1Q9ULC6 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PADI1Q9ULC6 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PADI1Q9ULC6 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PADI1Q9ULC6 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PADI1Q9ULC6 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PADI1Q9ULC6 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PADI1Q9ULC6 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PADI1Q9ULC6 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PADI1Q9ULC6 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PADI1Q9ULC6 LST1-202ENST00000303757 604 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PADI1Q9ULC6 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PADI1Q9ULC6 RETN-202ENST00000381324 249 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PADI1Q9ULC6 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PADI1Q9ULC6 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PADI1Q9ULC6 AL121753.1-201ENST00000444717 529 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PADI1Q9ULC6 AC138466.1-201ENST00000535242 391 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PADI1Q9ULC6 PTHLH-206ENST00000538310 854 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PADI1Q9ULC6 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PADI1Q9ULC6 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PADI1Q9ULC6 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PADI1Q9ULC6 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PADI1Q9ULC6 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PADI1Q9ULC6 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PADI1Q9ULC6 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PADI1Q9ULC6 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PADI1Q9ULC6 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PADI1Q9ULC6 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
PADI1Q9ULC6 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PADI1Q9ULC6 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PADI1Q9ULC6 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PADI1Q9ULC6 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PADI1Q9ULC6 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PADI1Q9ULC6 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PADI1Q9ULC6 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PADI1Q9ULC6 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PADI1Q9ULC6 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
PADI1Q9ULC6 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
PADI1Q9ULC6 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PADI1Q9ULC6 PDGFA-201ENST00000354513 1308 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PADI1Q9ULC6 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PADI1Q9ULC6 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PADI1Q9ULC6 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PADI1Q9ULC6 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PADI1Q9ULC6 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PADI1Q9ULC6 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PADI1Q9ULC6 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PADI1Q9ULC6 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PADI1Q9ULC6 LAT-202ENST00000360872 1459 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PADI1Q9ULC6 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PADI1Q9ULC6 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PADI1Q9ULC6 NME3-201ENST00000219302 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PADI1Q9ULC6 MRPL53-201ENST00000258105 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PADI1Q9ULC6 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PADI1Q9ULC6 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PADI1Q9ULC6 MB-201ENST00000359787 1170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PADI1Q9ULC6 LCE3E-201ENST00000368789 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PADI1Q9ULC6 DBNDD2-205ENST00000372717 1207 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PADI1Q9ULC6 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PADI1Q9ULC6 FAM159B-201ENST00000389074 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PADI1Q9ULC6 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PADI1Q9ULC6 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PADI1Q9ULC6 LINC00475-203ENST00000417983 703 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PADI1Q9ULC6 TMEM120A-203ENST00000439537 1161 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PADI1Q9ULC6 CRB3P1-201ENST00000449338 276 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
PADI1Q9ULC6 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PADI1Q9ULC6 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PADI1Q9ULC6 PSMD7-204ENST00000567958 692 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PADI1Q9ULC6 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
PADI1Q9ULC6 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
PADI1Q9ULC6 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PADI1Q9ULC6 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PADI1Q9ULC6 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PADI1Q9ULC6 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PADI1Q9ULC6 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PADI1Q9ULC6 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PADI1Q9ULC6 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PADI1Q9ULC6 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PADI1Q9ULC6 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PADI1Q9ULC6 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PADI1Q9ULC6 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PADI1Q9ULC6 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PADI1Q9ULC6 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PADI1Q9ULC6 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms