Protein–RNA interactions for Protein: Q9UL33

TRAPPC2L, Trafficking protein particle complex subunit 2-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC2LQ9UL33 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
TRAPPC2LQ9UL33 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
TRAPPC2LQ9UL33 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
TRAPPC2LQ9UL33 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
TRAPPC2LQ9UL33 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
TRAPPC2LQ9UL33 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
TRAPPC2LQ9UL33 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
TRAPPC2LQ9UL33 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
TRAPPC2LQ9UL33 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
TRAPPC2LQ9UL33 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
TRAPPC2LQ9UL33 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
TRAPPC2LQ9UL33 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
TRAPPC2LQ9UL33 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
TRAPPC2LQ9UL33 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
TRAPPC2LQ9UL33 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
TRAPPC2LQ9UL33 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
TRAPPC2LQ9UL33 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
TRAPPC2LQ9UL33 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
TRAPPC2LQ9UL33 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
TRAPPC2LQ9UL33 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
TRAPPC2LQ9UL33 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
TRAPPC2LQ9UL33 CLASP2-203ENST00000359576 7141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
TRAPPC2LQ9UL33 OPA1-204ENST00000361828 6381 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
TRAPPC2LQ9UL33 TAP2-201ENST00000374897 5684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
TRAPPC2LQ9UL33 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
TRAPPC2LQ9UL33 XK-201ENST00000378616 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
TRAPPC2LQ9UL33 MAP4K5-201ENST00000013125 4354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
TRAPPC2LQ9UL33 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
TRAPPC2LQ9UL33 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
TRAPPC2LQ9UL33 ABLIM3-206ENST00000506113 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
TRAPPC2LQ9UL33 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
TRAPPC2LQ9UL33 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
TRAPPC2LQ9UL33 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
TRAPPC2LQ9UL33 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
TRAPPC2LQ9UL33 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
TRAPPC2LQ9UL33 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
TRAPPC2LQ9UL33 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
TRAPPC2LQ9UL33 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
TRAPPC2LQ9UL33 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
TRAPPC2LQ9UL33 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
TRAPPC2LQ9UL33 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
TRAPPC2LQ9UL33 PAQR8-202ENST00000442253 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
TRAPPC2LQ9UL33 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
TRAPPC2LQ9UL33 IPPK-201ENST00000287996 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
TRAPPC2LQ9UL33 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
TRAPPC2LQ9UL33 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
TRAPPC2LQ9UL33 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
TRAPPC2LQ9UL33 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
TRAPPC2LQ9UL33 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
TRAPPC2LQ9UL33 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
TRAPPC2LQ9UL33 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
TRAPPC2LQ9UL33 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
TRAPPC2LQ9UL33 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
TRAPPC2LQ9UL33 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
TRAPPC2LQ9UL33 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
TRAPPC2LQ9UL33 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
TRAPPC2LQ9UL33 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
TRAPPC2LQ9UL33 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
TRAPPC2LQ9UL33 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
TRAPPC2LQ9UL33 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
TRAPPC2LQ9UL33 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
TRAPPC2LQ9UL33 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
TRAPPC2LQ9UL33 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
TRAPPC2LQ9UL33 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
TRAPPC2LQ9UL33 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
TRAPPC2LQ9UL33 PPP1R26-204ENST00000604351 4640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
TRAPPC2LQ9UL33 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
TRAPPC2LQ9UL33 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
TRAPPC2LQ9UL33 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
TRAPPC2LQ9UL33 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
TRAPPC2LQ9UL33 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
TRAPPC2LQ9UL33 PGBD5-201ENST00000391860 10961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
TRAPPC2LQ9UL33 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
TRAPPC2LQ9UL33 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
TRAPPC2LQ9UL33 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
TRAPPC2LQ9UL33 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
TRAPPC2LQ9UL33 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
TRAPPC2LQ9UL33 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
TRAPPC2LQ9UL33 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
TRAPPC2LQ9UL33 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
TRAPPC2LQ9UL33 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
TRAPPC2LQ9UL33 DDHD2-205ENST00000520272 4532 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
TRAPPC2LQ9UL33 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
TRAPPC2LQ9UL33 ZNF804B-201ENST00000333190 4659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
TRAPPC2LQ9UL33 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
TRAPPC2LQ9UL33 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
TRAPPC2LQ9UL33 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
TRAPPC2LQ9UL33 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
TRAPPC2LQ9UL33 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
TRAPPC2LQ9UL33 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
TRAPPC2LQ9UL33 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
TRAPPC2LQ9UL33 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
TRAPPC2LQ9UL33 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
TRAPPC2LQ9UL33 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
TRAPPC2LQ9UL33 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
TRAPPC2LQ9UL33 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
TRAPPC2LQ9UL33 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
TRAPPC2LQ9UL33 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
TRAPPC2LQ9UL33 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC13.97□□□□□ -0.17
TRAPPC2LQ9UL33 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.6 ms