Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKD2

MRTO4, mRNA turnover protein 4 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 239 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRTO4Q9UKD2 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MRTO4Q9UKD2 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MRTO4Q9UKD2 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
MRTO4Q9UKD2 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MRTO4Q9UKD2 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MRTO4Q9UKD2 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MRTO4Q9UKD2 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MRTO4Q9UKD2 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MRTO4Q9UKD2 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MRTO4Q9UKD2 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MRTO4Q9UKD2 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MRTO4Q9UKD2 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
MRTO4Q9UKD2 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MRTO4Q9UKD2 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MRTO4Q9UKD2 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MRTO4Q9UKD2 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MRTO4Q9UKD2 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MRTO4Q9UKD2 NACAD-202ENST00000490531 4780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MRTO4Q9UKD2 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MRTO4Q9UKD2 KIF3A-202ENST00000378746 6325 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MRTO4Q9UKD2 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MRTO4Q9UKD2 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MRTO4Q9UKD2 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MRTO4Q9UKD2 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MRTO4Q9UKD2 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MRTO4Q9UKD2 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MRTO4Q9UKD2 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MRTO4Q9UKD2 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MRTO4Q9UKD2 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MRTO4Q9UKD2 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MRTO4Q9UKD2 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MRTO4Q9UKD2 PRKX-201ENST00000262848 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MRTO4Q9UKD2 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MRTO4Q9UKD2 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
MRTO4Q9UKD2 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MRTO4Q9UKD2 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MRTO4Q9UKD2 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MRTO4Q9UKD2 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MRTO4Q9UKD2 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MRTO4Q9UKD2 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MRTO4Q9UKD2 PER1-201ENST00000317276 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MRTO4Q9UKD2 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
MRTO4Q9UKD2 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
MRTO4Q9UKD2 PHLDB1-223ENST00000600882 5479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MRTO4Q9UKD2 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MRTO4Q9UKD2 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MRTO4Q9UKD2 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
MRTO4Q9UKD2 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MRTO4Q9UKD2 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MRTO4Q9UKD2 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
MRTO4Q9UKD2 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
MRTO4Q9UKD2 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
MRTO4Q9UKD2 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
MRTO4Q9UKD2 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
MRTO4Q9UKD2 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
MRTO4Q9UKD2 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
MRTO4Q9UKD2 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
MRTO4Q9UKD2 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
MRTO4Q9UKD2 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
MRTO4Q9UKD2 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
MRTO4Q9UKD2 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
MRTO4Q9UKD2 LZTR1-201ENST00000215739 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MRTO4Q9UKD2 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MRTO4Q9UKD2 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MRTO4Q9UKD2 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MRTO4Q9UKD2 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MRTO4Q9UKD2 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
MRTO4Q9UKD2 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
MRTO4Q9UKD2 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MRTO4Q9UKD2 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MRTO4Q9UKD2 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
MRTO4Q9UKD2 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MRTO4Q9UKD2 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
MRTO4Q9UKD2 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
MRTO4Q9UKD2 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
MRTO4Q9UKD2 ELFN2-201ENST00000402918 8361 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
MRTO4Q9UKD2 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
MRTO4Q9UKD2 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
MRTO4Q9UKD2 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
MRTO4Q9UKD2 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
MRTO4Q9UKD2 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
MRTO4Q9UKD2 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
MRTO4Q9UKD2 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
MRTO4Q9UKD2 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
MRTO4Q9UKD2 DYNLL2-201ENST00000579991 6805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
MRTO4Q9UKD2 PAFAH1B1-202ENST00000397195 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
MRTO4Q9UKD2 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
MRTO4Q9UKD2 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
MRTO4Q9UKD2 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
MRTO4Q9UKD2 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
MRTO4Q9UKD2 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
MRTO4Q9UKD2 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
MRTO4Q9UKD2 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
MRTO4Q9UKD2 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
MRTO4Q9UKD2 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
MRTO4Q9UKD2 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
MRTO4Q9UKD2 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
MRTO4Q9UKD2 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
MRTO4Q9UKD2 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
MRTO4Q9UKD2 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42 ms