Protein–RNA interactions for Protein: Q9UG63

ABCF2, ATP-binding cassette sub-family F member 2, humanhuman

Predictions only

Length 623 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCF2Q9UG63 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ABCF2Q9UG63 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
ABCF2Q9UG63 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
ABCF2Q9UG63 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ABCF2Q9UG63 CALY-203ENST00000368558 825 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
ABCF2Q9UG63 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
ABCF2Q9UG63 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ABCF2Q9UG63 AC010507.1-202ENST00000633286 381 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
ABCF2Q9UG63 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ABCF2Q9UG63 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ABCF2Q9UG63 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ABCF2Q9UG63 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ABCF2Q9UG63 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
ABCF2Q9UG63 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
ABCF2Q9UG63 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ABCF2Q9UG63 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ABCF2Q9UG63 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
ABCF2Q9UG63 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ABCF2Q9UG63 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
ABCF2Q9UG63 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ABCF2Q9UG63 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ABCF2Q9UG63 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ABCF2Q9UG63 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ABCF2Q9UG63 POP5-202ENST00000357500 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ABCF2Q9UG63 AL022316.1-201ENST00000428765 572 ntTSL 4 BASIC19.92■□□□□ 0.78
ABCF2Q9UG63 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
ABCF2Q9UG63 PSMB5-204ENST00000460922 729 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
ABCF2Q9UG63 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
ABCF2Q9UG63 NDUFAF2-203ENST00000511107 586 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ABCF2Q9UG63 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
ABCF2Q9UG63 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
ABCF2Q9UG63 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
ABCF2Q9UG63 MIR4745-201ENST00000577608 62 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
ABCF2Q9UG63 MZF1-202ENST00000594108 1110 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ABCF2Q9UG63 AL158211.3-201ENST00000607385 239 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
ABCF2Q9UG63 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ABCF2Q9UG63 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ABCF2Q9UG63 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ABCF2Q9UG63 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
ABCF2Q9UG63 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ABCF2Q9UG63 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ABCF2Q9UG63 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ABCF2Q9UG63 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ABCF2Q9UG63 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ABCF2Q9UG63 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
ABCF2Q9UG63 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ABCF2Q9UG63 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ABCF2Q9UG63 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ABCF2Q9UG63 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ABCF2Q9UG63 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ABCF2Q9UG63 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
ABCF2Q9UG63 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
ABCF2Q9UG63 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
ABCF2Q9UG63 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
ABCF2Q9UG63 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
ABCF2Q9UG63 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
ABCF2Q9UG63 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
ABCF2Q9UG63 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
ABCF2Q9UG63 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
ABCF2Q9UG63 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
ABCF2Q9UG63 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
ABCF2Q9UG63 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
ABCF2Q9UG63 VMA21-202ENST00000370361 693 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
ABCF2Q9UG63 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
ABCF2Q9UG63 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
ABCF2Q9UG63 TSC22D3-213ENST00000506081 956 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
ABCF2Q9UG63 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
ABCF2Q9UG63 RNF24-204ENST00000545616 1128 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
ABCF2Q9UG63 NAA60-208ENST00000570819 833 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
ABCF2Q9UG63 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
ABCF2Q9UG63 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
ABCF2Q9UG63 AJ011932.1-201ENST00000621707 465 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
ABCF2Q9UG63 RCAN3-211ENST00000630217 658 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
ABCF2Q9UG63 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
ABCF2Q9UG63 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
ABCF2Q9UG63 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
ABCF2Q9UG63 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
ABCF2Q9UG63 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
ABCF2Q9UG63 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
ABCF2Q9UG63 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
ABCF2Q9UG63 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
ABCF2Q9UG63 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
ABCF2Q9UG63 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
ABCF2Q9UG63 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
ABCF2Q9UG63 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
ABCF2Q9UG63 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
ABCF2Q9UG63 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
ABCF2Q9UG63 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ABCF2Q9UG63 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
ABCF2Q9UG63 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
ABCF2Q9UG63 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ABCF2Q9UG63 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
ABCF2Q9UG63 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ABCF2Q9UG63 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
ABCF2Q9UG63 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ABCF2Q9UG63 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
ABCF2Q9UG63 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ABCF2Q9UG63 TMEM37-202ENST00000409826 794 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
ABCF2Q9UG63 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
ABCF2Q9UG63 HNRNPA1P40-201ENST00000426371 1278 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38 ms