Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBW8

COPS7A, COP9 signalosome complex subunit 7a, humanhuman

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Length 275 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS7AQ9UBW8 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
COPS7AQ9UBW8 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
COPS7AQ9UBW8 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
COPS7AQ9UBW8 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
COPS7AQ9UBW8 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
COPS7AQ9UBW8 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
COPS7AQ9UBW8 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
COPS7AQ9UBW8 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
COPS7AQ9UBW8 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
COPS7AQ9UBW8 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
COPS7AQ9UBW8 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
COPS7AQ9UBW8 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
COPS7AQ9UBW8 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
COPS7AQ9UBW8 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
COPS7AQ9UBW8 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
COPS7AQ9UBW8 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
COPS7AQ9UBW8 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
COPS7AQ9UBW8 CPEB2-209ENST00000538197 6878 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
COPS7AQ9UBW8 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
COPS7AQ9UBW8 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
COPS7AQ9UBW8 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
COPS7AQ9UBW8 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
COPS7AQ9UBW8 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
COPS7AQ9UBW8 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
COPS7AQ9UBW8 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
COPS7AQ9UBW8 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
COPS7AQ9UBW8 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
COPS7AQ9UBW8 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
COPS7AQ9UBW8 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
COPS7AQ9UBW8 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
COPS7AQ9UBW8 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
COPS7AQ9UBW8 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
COPS7AQ9UBW8 POLR3D-202ENST00000397802 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
COPS7AQ9UBW8 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
COPS7AQ9UBW8 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
COPS7AQ9UBW8 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
COPS7AQ9UBW8 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
COPS7AQ9UBW8 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
COPS7AQ9UBW8 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
COPS7AQ9UBW8 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
COPS7AQ9UBW8 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
COPS7AQ9UBW8 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
COPS7AQ9UBW8 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
COPS7AQ9UBW8 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
COPS7AQ9UBW8 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
COPS7AQ9UBW8 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
COPS7AQ9UBW8 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
COPS7AQ9UBW8 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
COPS7AQ9UBW8 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
COPS7AQ9UBW8 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
COPS7AQ9UBW8 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
COPS7AQ9UBW8 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
COPS7AQ9UBW8 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
COPS7AQ9UBW8 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
COPS7AQ9UBW8 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
COPS7AQ9UBW8 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
COPS7AQ9UBW8 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
COPS7AQ9UBW8 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
COPS7AQ9UBW8 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
COPS7AQ9UBW8 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
COPS7AQ9UBW8 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
COPS7AQ9UBW8 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
COPS7AQ9UBW8 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
COPS7AQ9UBW8 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
COPS7AQ9UBW8 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
COPS7AQ9UBW8 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
COPS7AQ9UBW8 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
COPS7AQ9UBW8 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
COPS7AQ9UBW8 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
COPS7AQ9UBW8 FYCO1-205ENST00000535325 8578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
COPS7AQ9UBW8 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
COPS7AQ9UBW8 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
COPS7AQ9UBW8 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
COPS7AQ9UBW8 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
COPS7AQ9UBW8 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
COPS7AQ9UBW8 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
COPS7AQ9UBW8 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
COPS7AQ9UBW8 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
COPS7AQ9UBW8 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
COPS7AQ9UBW8 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
COPS7AQ9UBW8 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
COPS7AQ9UBW8 ARL5B-201ENST00000377275 7196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
COPS7AQ9UBW8 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
COPS7AQ9UBW8 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
COPS7AQ9UBW8 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
COPS7AQ9UBW8 PHF8-203ENST00000338946 4651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
COPS7AQ9UBW8 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
COPS7AQ9UBW8 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
COPS7AQ9UBW8 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
COPS7AQ9UBW8 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
COPS7AQ9UBW8 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
COPS7AQ9UBW8 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
COPS7AQ9UBW8 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
COPS7AQ9UBW8 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
COPS7AQ9UBW8 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
COPS7AQ9UBW8 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
COPS7AQ9UBW8 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
COPS7AQ9UBW8 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
COPS7AQ9UBW8 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
COPS7AQ9UBW8 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
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