Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBT3

DKK4, Dickkopf-related protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DKK4Q9UBT3 AP005329.1-201ENST00000578800 1035 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
DKK4Q9UBT3 RPS5-209ENST00000601521 1203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
DKK4Q9UBT3 AL022328.3-201ENST00000607943 679 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
DKK4Q9UBT3 AC091271.1-201ENST00000611877 1162 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
DKK4Q9UBT3 AGAP1-213ENST00000619456 1057 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
DKK4Q9UBT3 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
DKK4Q9UBT3 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
DKK4Q9UBT3 MBD1-207ENST00000398488 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
DKK4Q9UBT3 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
DKK4Q9UBT3 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
DKK4Q9UBT3 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
DKK4Q9UBT3 AC012531.2-201ENST00000512206 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
DKK4Q9UBT3 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
DKK4Q9UBT3 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
DKK4Q9UBT3 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
DKK4Q9UBT3 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
DKK4Q9UBT3 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
DKK4Q9UBT3 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
DKK4Q9UBT3 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
DKK4Q9UBT3 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
DKK4Q9UBT3 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
DKK4Q9UBT3 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
DKK4Q9UBT3 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
DKK4Q9UBT3 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
DKK4Q9UBT3 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
DKK4Q9UBT3 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
DKK4Q9UBT3 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
DKK4Q9UBT3 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
DKK4Q9UBT3 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
DKK4Q9UBT3 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
DKK4Q9UBT3 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
DKK4Q9UBT3 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
DKK4Q9UBT3 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
DKK4Q9UBT3 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
DKK4Q9UBT3 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
DKK4Q9UBT3 COX6A2-201ENST00000287490 440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
DKK4Q9UBT3 UBXN1-202ENST00000301935 1153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
DKK4Q9UBT3 SPDYE7P-201ENST00000355920 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
DKK4Q9UBT3 GTF2A2-204ENST00000396063 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
DKK4Q9UBT3 LINC01665-201ENST00000422917 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
DKK4Q9UBT3 AL121983.1-201ENST00000424181 335 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
DKK4Q9UBT3 RPL28-203ENST00000428193 573 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
DKK4Q9UBT3 DGUOK-AS1-202ENST00000439192 563 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
DKK4Q9UBT3 SNHG11-212ENST00000449351 954 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
DKK4Q9UBT3 NKX3-1-202ENST00000523261 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
DKK4Q9UBT3 C11orf98-202ENST00000525675 405 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
DKK4Q9UBT3 RIT1-205ENST00000539040 919 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
DKK4Q9UBT3 CATSPERZ-203ENST00000539943 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
DKK4Q9UBT3 NDUFA4L2-206ENST00000556732 883 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
DKK4Q9UBT3 AL118558.1-202ENST00000557242 451 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
DKK4Q9UBT3 RPL28-207ENST00000558815 616 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
DKK4Q9UBT3 ZNF180-204ENST00000586637 1023 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
DKK4Q9UBT3 FBXL12-211ENST00000591009 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
DKK4Q9UBT3 BRI3BPP1-201ENST00000594224 787 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
DKK4Q9UBT3 UBXN1-218ENST00000616865 1002 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
DKK4Q9UBT3 CR381653.1-201ENST00000622961 812 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
DKK4Q9UBT3 AC008687.7-202ENST00000637404 953 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
DKK4Q9UBT3 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
DKK4Q9UBT3 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
DKK4Q9UBT3 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
DKK4Q9UBT3 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
DKK4Q9UBT3 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
DKK4Q9UBT3 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
DKK4Q9UBT3 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
DKK4Q9UBT3 ABHD18-206ENST00000611882 1493 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
DKK4Q9UBT3 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
DKK4Q9UBT3 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
DKK4Q9UBT3 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
DKK4Q9UBT3 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
DKK4Q9UBT3 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
DKK4Q9UBT3 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
DKK4Q9UBT3 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
DKK4Q9UBT3 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
DKK4Q9UBT3 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
DKK4Q9UBT3 HARS2-202ENST00000448069 1426 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
DKK4Q9UBT3 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
DKK4Q9UBT3 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
DKK4Q9UBT3 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
DKK4Q9UBT3 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
DKK4Q9UBT3 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
DKK4Q9UBT3 Z97205.2-201ENST00000564697 1639 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
DKK4Q9UBT3 EIF4EBP3-201ENST00000310331 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
DKK4Q9UBT3 CSH1-201ENST00000316193 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
DKK4Q9UBT3 AL157373.2-201ENST00000437559 784 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
DKK4Q9UBT3 AC009720.1-201ENST00000511867 586 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
DKK4Q9UBT3 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
DKK4Q9UBT3 COX14-203ENST00000550487 739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
DKK4Q9UBT3 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
DKK4Q9UBT3 RHOXF1P1-202ENST00000635473 501 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
DKK4Q9UBT3 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
DKK4Q9UBT3 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
DKK4Q9UBT3 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
DKK4Q9UBT3 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
DKK4Q9UBT3 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
DKK4Q9UBT3 LINGO1-204ENST00000561030 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
DKK4Q9UBT3 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
DKK4Q9UBT3 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
DKK4Q9UBT3 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
DKK4Q9UBT3 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
DKK4Q9UBT3 AC006504.5-203ENST00000590628 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.7 ms