Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBD3

XCL2, Cytokine SCM-1 beta, humanhuman

Predictions only

Length 114 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XCL2Q9UBD3 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
XCL2Q9UBD3 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
XCL2Q9UBD3 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
XCL2Q9UBD3 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
XCL2Q9UBD3 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
XCL2Q9UBD3 KIF3A-202ENST00000378746 6325 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
XCL2Q9UBD3 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
XCL2Q9UBD3 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC12.3□□□□□ -0.44
XCL2Q9UBD3 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
XCL2Q9UBD3 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
XCL2Q9UBD3 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
XCL2Q9UBD3 NFATC4-204ENST00000424781 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
XCL2Q9UBD3 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
XCL2Q9UBD3 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
XCL2Q9UBD3 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
XCL2Q9UBD3 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
XCL2Q9UBD3 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
XCL2Q9UBD3 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
XCL2Q9UBD3 OTUD3-201ENST00000375120 6397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
XCL2Q9UBD3 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
XCL2Q9UBD3 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
XCL2Q9UBD3 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
XCL2Q9UBD3 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
XCL2Q9UBD3 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
XCL2Q9UBD3 NBEA-208ENST00000629018 10791 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
XCL2Q9UBD3 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
XCL2Q9UBD3 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
XCL2Q9UBD3 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC12.29□□□□□ -0.44
XCL2Q9UBD3 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
XCL2Q9UBD3 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
XCL2Q9UBD3 C18orf25-203ENST00000615052 5462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
XCL2Q9UBD3 FYCO1-205ENST00000535325 8578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
XCL2Q9UBD3 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
XCL2Q9UBD3 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
XCL2Q9UBD3 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
XCL2Q9UBD3 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
XCL2Q9UBD3 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
XCL2Q9UBD3 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
XCL2Q9UBD3 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
XCL2Q9UBD3 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
XCL2Q9UBD3 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
XCL2Q9UBD3 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
XCL2Q9UBD3 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
XCL2Q9UBD3 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC12.29□□□□□ -0.44
XCL2Q9UBD3 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
XCL2Q9UBD3 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
XCL2Q9UBD3 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
XCL2Q9UBD3 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
XCL2Q9UBD3 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC12.29□□□□□ -0.44
XCL2Q9UBD3 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
XCL2Q9UBD3 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
XCL2Q9UBD3 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
XCL2Q9UBD3 SATB2-205ENST00000443023 6194 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
XCL2Q9UBD3 PCSK5-205ENST00000545128 9538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
XCL2Q9UBD3 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC12.29□□□□□ -0.44
XCL2Q9UBD3 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
XCL2Q9UBD3 ADAMTS13-201ENST00000355699 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
XCL2Q9UBD3 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
XCL2Q9UBD3 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
XCL2Q9UBD3 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC12.29□□□□□ -0.44
XCL2Q9UBD3 DNAJC21-202ENST00000382021 6208 ntTSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
XCL2Q9UBD3 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
XCL2Q9UBD3 AHDC1-201ENST00000247087 6334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
XCL2Q9UBD3 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
XCL2Q9UBD3 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
XCL2Q9UBD3 LATS2-201ENST00000382592 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
XCL2Q9UBD3 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
XCL2Q9UBD3 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
XCL2Q9UBD3 KMT2E-201ENST00000257745 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
XCL2Q9UBD3 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
XCL2Q9UBD3 ADAMTS2-201ENST00000251582 6754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
XCL2Q9UBD3 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
XCL2Q9UBD3 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
XCL2Q9UBD3 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
XCL2Q9UBD3 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
XCL2Q9UBD3 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
XCL2Q9UBD3 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
XCL2Q9UBD3 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
XCL2Q9UBD3 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
XCL2Q9UBD3 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
XCL2Q9UBD3 FBN1-205ENST00000560355 4109 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
XCL2Q9UBD3 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
XCL2Q9UBD3 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
XCL2Q9UBD3 KCP-208ENST00000620378 4515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
XCL2Q9UBD3 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
XCL2Q9UBD3 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
XCL2Q9UBD3 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
XCL2Q9UBD3 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
XCL2Q9UBD3 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
XCL2Q9UBD3 EIF4G1-203ENST00000350481 4990 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
XCL2Q9UBD3 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
XCL2Q9UBD3 PLXDC1-201ENST00000315392 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
XCL2Q9UBD3 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
XCL2Q9UBD3 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
XCL2Q9UBD3 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
XCL2Q9UBD3 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
XCL2Q9UBD3 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
XCL2Q9UBD3 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
XCL2Q9UBD3 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
XCL2Q9UBD3 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.3 ms