Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBB9

TFIP11, Tuftelin-interacting protein 11, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 837 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TFIP11Q9UBB9 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TFIP11Q9UBB9 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TFIP11Q9UBB9 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TFIP11Q9UBB9 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TFIP11Q9UBB9 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TFIP11Q9UBB9 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TFIP11Q9UBB9 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TFIP11Q9UBB9 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TFIP11Q9UBB9 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TFIP11Q9UBB9 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TFIP11Q9UBB9 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TFIP11Q9UBB9 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TFIP11Q9UBB9 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TFIP11Q9UBB9 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TFIP11Q9UBB9 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TFIP11Q9UBB9 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TFIP11Q9UBB9 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TFIP11Q9UBB9 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TFIP11Q9UBB9 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TFIP11Q9UBB9 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TFIP11Q9UBB9 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TFIP11Q9UBB9 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TFIP11Q9UBB9 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
TFIP11Q9UBB9 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TFIP11Q9UBB9 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
TFIP11Q9UBB9 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
TFIP11Q9UBB9 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TFIP11Q9UBB9 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TFIP11Q9UBB9 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TFIP11Q9UBB9 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TFIP11Q9UBB9 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TFIP11Q9UBB9 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TFIP11Q9UBB9 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TFIP11Q9UBB9 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TFIP11Q9UBB9 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TFIP11Q9UBB9 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TFIP11Q9UBB9 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TFIP11Q9UBB9 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TFIP11Q9UBB9 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TFIP11Q9UBB9 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TFIP11Q9UBB9 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TFIP11Q9UBB9 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TFIP11Q9UBB9 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TFIP11Q9UBB9 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TFIP11Q9UBB9 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TFIP11Q9UBB9 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TFIP11Q9UBB9 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TFIP11Q9UBB9 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TFIP11Q9UBB9 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TFIP11Q9UBB9 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
TFIP11Q9UBB9 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TFIP11Q9UBB9 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TFIP11Q9UBB9 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TFIP11Q9UBB9 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TFIP11Q9UBB9 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TFIP11Q9UBB9 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TFIP11Q9UBB9 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TFIP11Q9UBB9 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TFIP11Q9UBB9 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TFIP11Q9UBB9 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TFIP11Q9UBB9 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TFIP11Q9UBB9 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TFIP11Q9UBB9 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TFIP11Q9UBB9 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TFIP11Q9UBB9 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TFIP11Q9UBB9 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TFIP11Q9UBB9 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
TFIP11Q9UBB9 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TFIP11Q9UBB9 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TFIP11Q9UBB9 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TFIP11Q9UBB9 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
TFIP11Q9UBB9 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TFIP11Q9UBB9 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TFIP11Q9UBB9 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TFIP11Q9UBB9 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TFIP11Q9UBB9 TSPY26P-202ENST00000565928 3884 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
TFIP11Q9UBB9 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TFIP11Q9UBB9 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TFIP11Q9UBB9 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TFIP11Q9UBB9 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TFIP11Q9UBB9 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TFIP11Q9UBB9 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
TFIP11Q9UBB9 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
TFIP11Q9UBB9 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TFIP11Q9UBB9 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TFIP11Q9UBB9 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TFIP11Q9UBB9 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TFIP11Q9UBB9 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
TFIP11Q9UBB9 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TFIP11Q9UBB9 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TFIP11Q9UBB9 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TFIP11Q9UBB9 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TFIP11Q9UBB9 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TFIP11Q9UBB9 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TFIP11Q9UBB9 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TFIP11Q9UBB9 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TFIP11Q9UBB9 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TFIP11Q9UBB9 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TFIP11Q9UBB9 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TFIP11Q9UBB9 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.1 ms