Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2Q2

FRMD4A, FERM domain-containing protein 4A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,039 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FRMD4AQ9P2Q2 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
FRMD4AQ9P2Q2 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
FRMD4AQ9P2Q2 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
FRMD4AQ9P2Q2 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
FRMD4AQ9P2Q2 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
FRMD4AQ9P2Q2 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
FRMD4AQ9P2Q2 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
FRMD4AQ9P2Q2 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
FRMD4AQ9P2Q2 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
FRMD4AQ9P2Q2 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
FRMD4AQ9P2Q2 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
FRMD4AQ9P2Q2 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
FRMD4AQ9P2Q2 ALG5-201ENST00000239891 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
FRMD4AQ9P2Q2 DGCR5-201ENST00000399539 862 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
FRMD4AQ9P2Q2 TGFA-205ENST00000444975 985 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
FRMD4AQ9P2Q2 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
FRMD4AQ9P2Q2 AC122138.1-201ENST00000508799 646 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
FRMD4AQ9P2Q2 COQ7-202ENST00000544894 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
FRMD4AQ9P2Q2 GCHFR-204ENST00000559445 626 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
FRMD4AQ9P2Q2 AC007216.4-201ENST00000574364 562 ntTSL 4 BASIC19.22■□□□□ 0.67
FRMD4AQ9P2Q2 CHCHD2P3-201ENST00000603038 451 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
FRMD4AQ9P2Q2 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
FRMD4AQ9P2Q2 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
FRMD4AQ9P2Q2 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
FRMD4AQ9P2Q2 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
FRMD4AQ9P2Q2 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
FRMD4AQ9P2Q2 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
FRMD4AQ9P2Q2 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
FRMD4AQ9P2Q2 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
FRMD4AQ9P2Q2 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
FRMD4AQ9P2Q2 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC19.22■□□□□ 0.67
FRMD4AQ9P2Q2 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
FRMD4AQ9P2Q2 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
FRMD4AQ9P2Q2 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
FRMD4AQ9P2Q2 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
FRMD4AQ9P2Q2 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
FRMD4AQ9P2Q2 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
FRMD4AQ9P2Q2 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
FRMD4AQ9P2Q2 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
FRMD4AQ9P2Q2 RPS5-201ENST00000196551 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
FRMD4AQ9P2Q2 NFIC-201ENST00000341919 1573 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
FRMD4AQ9P2Q2 PTPA-220ENST00000436883 532 ntTSL 4 BASIC19.21■□□□□ 0.67
FRMD4AQ9P2Q2 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
FRMD4AQ9P2Q2 KRBOX4-207ENST00000487081 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
FRMD4AQ9P2Q2 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
FRMD4AQ9P2Q2 AC138474.1-201ENST00000586630 523 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
FRMD4AQ9P2Q2 CREB3L2-208ENST00000620715 1053 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
FRMD4AQ9P2Q2 AL358472.5-202ENST00000641448 1267 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
FRMD4AQ9P2Q2 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
FRMD4AQ9P2Q2 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
FRMD4AQ9P2Q2 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
FRMD4AQ9P2Q2 FKBPL-201ENST00000375156 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
FRMD4AQ9P2Q2 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC19.21■□□□□ 0.67
FRMD4AQ9P2Q2 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
FRMD4AQ9P2Q2 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
FRMD4AQ9P2Q2 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
FRMD4AQ9P2Q2 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
FRMD4AQ9P2Q2 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
FRMD4AQ9P2Q2 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
FRMD4AQ9P2Q2 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
FRMD4AQ9P2Q2 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
FRMD4AQ9P2Q2 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
FRMD4AQ9P2Q2 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
FRMD4AQ9P2Q2 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
FRMD4AQ9P2Q2 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
FRMD4AQ9P2Q2 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
FRMD4AQ9P2Q2 ITPR1-AS1-201ENST00000412804 858 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
FRMD4AQ9P2Q2 LINC00473-201ENST00000444465 798 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
FRMD4AQ9P2Q2 ATG10-207ENST00000513443 978 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
FRMD4AQ9P2Q2 AP003068.1-201ENST00000528887 544 ntTSL 4 BASIC19.2■□□□□ 0.66
FRMD4AQ9P2Q2 IGHV3-72-202ENST00000621503 303 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
FRMD4AQ9P2Q2 AL031056.2-201ENST00000637957 1217 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
FRMD4AQ9P2Q2 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
FRMD4AQ9P2Q2 TMEM5-205ENST00000537373 1966 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
FRMD4AQ9P2Q2 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
FRMD4AQ9P2Q2 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
FRMD4AQ9P2Q2 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
FRMD4AQ9P2Q2 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
FRMD4AQ9P2Q2 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
FRMD4AQ9P2Q2 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
FRMD4AQ9P2Q2 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
FRMD4AQ9P2Q2 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
FRMD4AQ9P2Q2 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
FRMD4AQ9P2Q2 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
FRMD4AQ9P2Q2 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
FRMD4AQ9P2Q2 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
FRMD4AQ9P2Q2 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
FRMD4AQ9P2Q2 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
FRMD4AQ9P2Q2 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
FRMD4AQ9P2Q2 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
FRMD4AQ9P2Q2 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
FRMD4AQ9P2Q2 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
FRMD4AQ9P2Q2 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
FRMD4AQ9P2Q2 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
FRMD4AQ9P2Q2 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
FRMD4AQ9P2Q2 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
FRMD4AQ9P2Q2 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
FRMD4AQ9P2Q2 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
FRMD4AQ9P2Q2 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
FRMD4AQ9P2Q2 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.9 ms