Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX76

CMTM6, CKLF-like MARVEL transmembrane domain-containing protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 183 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CMTM6Q9NX76 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CMTM6Q9NX76 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CMTM6Q9NX76 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CMTM6Q9NX76 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
CMTM6Q9NX76 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CMTM6Q9NX76 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CMTM6Q9NX76 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CMTM6Q9NX76 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CMTM6Q9NX76 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CMTM6Q9NX76 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CMTM6Q9NX76 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CMTM6Q9NX76 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CMTM6Q9NX76 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CMTM6Q9NX76 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CMTM6Q9NX76 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CMTM6Q9NX76 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CMTM6Q9NX76 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
CMTM6Q9NX76 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CMTM6Q9NX76 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
CMTM6Q9NX76 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CMTM6Q9NX76 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
CMTM6Q9NX76 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CMTM6Q9NX76 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CMTM6Q9NX76 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CMTM6Q9NX76 ALK-201ENST00000389048 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CMTM6Q9NX76 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CMTM6Q9NX76 COX10-201ENST00000261643 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CMTM6Q9NX76 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CMTM6Q9NX76 C7orf43-207ENST00000457641 2005 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CMTM6Q9NX76 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CMTM6Q9NX76 JRK-209ENST00000612905 9124 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CMTM6Q9NX76 EVPL-201ENST00000301607 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CMTM6Q9NX76 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CMTM6Q9NX76 C3orf67-201ENST00000295966 2650 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CMTM6Q9NX76 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CMTM6Q9NX76 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CMTM6Q9NX76 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CMTM6Q9NX76 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CMTM6Q9NX76 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CMTM6Q9NX76 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CMTM6Q9NX76 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CMTM6Q9NX76 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CMTM6Q9NX76 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CMTM6Q9NX76 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CMTM6Q9NX76 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CMTM6Q9NX76 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CMTM6Q9NX76 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
CMTM6Q9NX76 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CMTM6Q9NX76 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CMTM6Q9NX76 KITLG-202ENST00000347404 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CMTM6Q9NX76 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CMTM6Q9NX76 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CMTM6Q9NX76 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CMTM6Q9NX76 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CMTM6Q9NX76 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CMTM6Q9NX76 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CMTM6Q9NX76 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CMTM6Q9NX76 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CMTM6Q9NX76 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CMTM6Q9NX76 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CMTM6Q9NX76 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
CMTM6Q9NX76 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CMTM6Q9NX76 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CMTM6Q9NX76 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CMTM6Q9NX76 MYH14-210ENST00000601313 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CMTM6Q9NX76 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
CMTM6Q9NX76 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CMTM6Q9NX76 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CMTM6Q9NX76 TNFRSF14-AS1-202ENST00000432521 3608 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CMTM6Q9NX76 ANKRD26-201ENST00000376087 6591 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CMTM6Q9NX76 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
CMTM6Q9NX76 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CMTM6Q9NX76 UBA5-213ENST00000494238 2997 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CMTM6Q9NX76 LINC00884-202ENST00000448892 2680 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CMTM6Q9NX76 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CMTM6Q9NX76 CDH1-202ENST00000422392 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CMTM6Q9NX76 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CMTM6Q9NX76 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CMTM6Q9NX76 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CMTM6Q9NX76 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CMTM6Q9NX76 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CMTM6Q9NX76 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CMTM6Q9NX76 ARL8B-208ENST00000611208 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CMTM6Q9NX76 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CMTM6Q9NX76 NEK11-210ENST00000510769 2149 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CMTM6Q9NX76 ANKHD1-EIF4EBP3-203ENST00000532219 8246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CMTM6Q9NX76 ZNF19-208ENST00000565637 2612 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CMTM6Q9NX76 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CMTM6Q9NX76 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CMTM6Q9NX76 ARHGEF1-219ENST00000599846 3393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CMTM6Q9NX76 POMT1-205ENST00000404875 2821 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CMTM6Q9NX76 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CMTM6Q9NX76 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CMTM6Q9NX76 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CMTM6Q9NX76 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CMTM6Q9NX76 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CMTM6Q9NX76 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CMTM6Q9NX76 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CMTM6Q9NX76 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CMTM6Q9NX76 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.5 ms