Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVR0

KLHL11, Kelch-like protein 11, humanhuman

Predictions only

Length 708 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL11Q9NVR0 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
KLHL11Q9NVR0 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
KLHL11Q9NVR0 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
KLHL11Q9NVR0 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
KLHL11Q9NVR0 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
KLHL11Q9NVR0 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
KLHL11Q9NVR0 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
KLHL11Q9NVR0 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
KLHL11Q9NVR0 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
KLHL11Q9NVR0 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
KLHL11Q9NVR0 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
KLHL11Q9NVR0 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
KLHL11Q9NVR0 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
KLHL11Q9NVR0 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
KLHL11Q9NVR0 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
KLHL11Q9NVR0 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
KLHL11Q9NVR0 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
KLHL11Q9NVR0 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
KLHL11Q9NVR0 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
KLHL11Q9NVR0 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
KLHL11Q9NVR0 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
KLHL11Q9NVR0 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
KLHL11Q9NVR0 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
KLHL11Q9NVR0 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
KLHL11Q9NVR0 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
KLHL11Q9NVR0 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
KLHL11Q9NVR0 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
KLHL11Q9NVR0 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
KLHL11Q9NVR0 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
KLHL11Q9NVR0 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
KLHL11Q9NVR0 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
KLHL11Q9NVR0 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
KLHL11Q9NVR0 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
KLHL11Q9NVR0 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
KLHL11Q9NVR0 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
KLHL11Q9NVR0 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
KLHL11Q9NVR0 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
KLHL11Q9NVR0 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
KLHL11Q9NVR0 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
KLHL11Q9NVR0 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
KLHL11Q9NVR0 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
KLHL11Q9NVR0 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
KLHL11Q9NVR0 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
KLHL11Q9NVR0 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
KLHL11Q9NVR0 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
KLHL11Q9NVR0 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
KLHL11Q9NVR0 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
KLHL11Q9NVR0 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
KLHL11Q9NVR0 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
KLHL11Q9NVR0 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
KLHL11Q9NVR0 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
KLHL11Q9NVR0 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
KLHL11Q9NVR0 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
KLHL11Q9NVR0 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
KLHL11Q9NVR0 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
KLHL11Q9NVR0 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
KLHL11Q9NVR0 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
KLHL11Q9NVR0 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
KLHL11Q9NVR0 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
KLHL11Q9NVR0 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
KLHL11Q9NVR0 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
KLHL11Q9NVR0 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.43■□□□□ 0.38
KLHL11Q9NVR0 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
KLHL11Q9NVR0 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
KLHL11Q9NVR0 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
KLHL11Q9NVR0 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
KLHL11Q9NVR0 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
KLHL11Q9NVR0 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
KLHL11Q9NVR0 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
KLHL11Q9NVR0 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
KLHL11Q9NVR0 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
KLHL11Q9NVR0 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
KLHL11Q9NVR0 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
KLHL11Q9NVR0 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
KLHL11Q9NVR0 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
KLHL11Q9NVR0 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC17.42■□□□□ 0.38
KLHL11Q9NVR0 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
KLHL11Q9NVR0 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
KLHL11Q9NVR0 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
KLHL11Q9NVR0 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
KLHL11Q9NVR0 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
KLHL11Q9NVR0 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
KLHL11Q9NVR0 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
KLHL11Q9NVR0 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
KLHL11Q9NVR0 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
KLHL11Q9NVR0 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
KLHL11Q9NVR0 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
KLHL11Q9NVR0 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
KLHL11Q9NVR0 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
KLHL11Q9NVR0 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
KLHL11Q9NVR0 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
KLHL11Q9NVR0 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
KLHL11Q9NVR0 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
KLHL11Q9NVR0 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
KLHL11Q9NVR0 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
KLHL11Q9NVR0 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
KLHL11Q9NVR0 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
KLHL11Q9NVR0 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
KLHL11Q9NVR0 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
KLHL11Q9NVR0 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.5 ms