Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSP4

CENPM, Centromere protein M, humanhuman

Predictions only

Length 180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPMQ9NSP4 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CENPMQ9NSP4 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CENPMQ9NSP4 KMT2E-201ENST00000257745 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CENPMQ9NSP4 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
CENPMQ9NSP4 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CENPMQ9NSP4 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CENPMQ9NSP4 CCDC6-201ENST00000263102 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CENPMQ9NSP4 NF2-210ENST00000413209 4733 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CENPMQ9NSP4 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
CENPMQ9NSP4 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CENPMQ9NSP4 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CENPMQ9NSP4 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CENPMQ9NSP4 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CENPMQ9NSP4 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CENPMQ9NSP4 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CENPMQ9NSP4 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CENPMQ9NSP4 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CENPMQ9NSP4 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CENPMQ9NSP4 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CENPMQ9NSP4 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CENPMQ9NSP4 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
CENPMQ9NSP4 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CENPMQ9NSP4 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CENPMQ9NSP4 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CENPMQ9NSP4 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CENPMQ9NSP4 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CENPMQ9NSP4 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
CENPMQ9NSP4 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CENPMQ9NSP4 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CENPMQ9NSP4 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CENPMQ9NSP4 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CENPMQ9NSP4 DCTN1-203ENST00000409240 4365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CENPMQ9NSP4 ARVCF-201ENST00000263207 4041 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CENPMQ9NSP4 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CENPMQ9NSP4 DYSF-201ENST00000258104 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CENPMQ9NSP4 DYSF-204ENST00000409582 6790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CENPMQ9NSP4 DYSF-210ENST00000413539 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CENPMQ9NSP4 MBD1-224ENST00000591416 4905 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CENPMQ9NSP4 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CENPMQ9NSP4 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CENPMQ9NSP4 KRAS-202ENST00000311936 5765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CENPMQ9NSP4 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CENPMQ9NSP4 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CENPMQ9NSP4 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
CENPMQ9NSP4 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CENPMQ9NSP4 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CENPMQ9NSP4 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CENPMQ9NSP4 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CENPMQ9NSP4 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CENPMQ9NSP4 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CENPMQ9NSP4 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CENPMQ9NSP4 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CENPMQ9NSP4 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CENPMQ9NSP4 ABLIM3-206ENST00000506113 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CENPMQ9NSP4 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CENPMQ9NSP4 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
CENPMQ9NSP4 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CENPMQ9NSP4 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CENPMQ9NSP4 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CENPMQ9NSP4 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CENPMQ9NSP4 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CENPMQ9NSP4 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CENPMQ9NSP4 BCL2L11-219ENST00000619294 5132 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CENPMQ9NSP4 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CENPMQ9NSP4 DIXDC1-201ENST00000440460 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CENPMQ9NSP4 PPL-205ENST00000590782 5845 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CENPMQ9NSP4 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CENPMQ9NSP4 DIP2A-201ENST00000400274 7023 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CENPMQ9NSP4 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CENPMQ9NSP4 PPP1R26-204ENST00000604351 4640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CENPMQ9NSP4 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CENPMQ9NSP4 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CENPMQ9NSP4 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CENPMQ9NSP4 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CENPMQ9NSP4 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
CENPMQ9NSP4 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CENPMQ9NSP4 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CENPMQ9NSP4 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CENPMQ9NSP4 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
CENPMQ9NSP4 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CENPMQ9NSP4 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CENPMQ9NSP4 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CENPMQ9NSP4 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CENPMQ9NSP4 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CENPMQ9NSP4 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CENPMQ9NSP4 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CENPMQ9NSP4 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
CENPMQ9NSP4 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
CENPMQ9NSP4 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CENPMQ9NSP4 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CENPMQ9NSP4 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CENPMQ9NSP4 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CENPMQ9NSP4 EIF4G1-206ENST00000392537 5229 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CENPMQ9NSP4 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CENPMQ9NSP4 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CENPMQ9NSP4 KDM5C-205ENST00000404049 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CENPMQ9NSP4 C18orf25-206ENST00000619301 5264 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CENPMQ9NSP4 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CENPMQ9NSP4 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CENPMQ9NSP4 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.1 ms