Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPL8

TIMMDC1, Complex I assembly factor TIMMDC1, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 285 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIMMDC1Q9NPL8 XK-201ENST00000378616 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TIMMDC1Q9NPL8 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TIMMDC1Q9NPL8 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TIMMDC1Q9NPL8 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
TIMMDC1Q9NPL8 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TIMMDC1Q9NPL8 CYP4X1-201ENST00000371901 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TIMMDC1Q9NPL8 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TIMMDC1Q9NPL8 PPP1R26-206ENST00000605660 4502 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TIMMDC1Q9NPL8 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TIMMDC1Q9NPL8 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TIMMDC1Q9NPL8 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TIMMDC1Q9NPL8 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TIMMDC1Q9NPL8 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TIMMDC1Q9NPL8 POM121-203ENST00000434423 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TIMMDC1Q9NPL8 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TIMMDC1Q9NPL8 SLCO5A1-201ENST00000260126 9076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TIMMDC1Q9NPL8 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TIMMDC1Q9NPL8 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TIMMDC1Q9NPL8 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TIMMDC1Q9NPL8 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TIMMDC1Q9NPL8 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TIMMDC1Q9NPL8 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TIMMDC1Q9NPL8 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TIMMDC1Q9NPL8 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TIMMDC1Q9NPL8 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TIMMDC1Q9NPL8 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
TIMMDC1Q9NPL8 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
TIMMDC1Q9NPL8 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TIMMDC1Q9NPL8 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TIMMDC1Q9NPL8 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TIMMDC1Q9NPL8 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TIMMDC1Q9NPL8 NBEA-201ENST00000310336 10794 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TIMMDC1Q9NPL8 NBEA-208ENST00000629018 10791 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
TIMMDC1Q9NPL8 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TIMMDC1Q9NPL8 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TIMMDC1Q9NPL8 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TIMMDC1Q9NPL8 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TIMMDC1Q9NPL8 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
TIMMDC1Q9NPL8 ZFPM2-201ENST00000407775 4700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TIMMDC1Q9NPL8 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TIMMDC1Q9NPL8 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TIMMDC1Q9NPL8 CRK-201ENST00000300574 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TIMMDC1Q9NPL8 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TIMMDC1Q9NPL8 GRIK5-204ENST00000593562 3308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
TIMMDC1Q9NPL8 AC012313.3-202ENST00000599109 3322 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
TIMMDC1Q9NPL8 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
TIMMDC1Q9NPL8 SYBU-206ENST00000424158 3007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TIMMDC1Q9NPL8 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TIMMDC1Q9NPL8 SCAMP2-201ENST00000268099 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TIMMDC1Q9NPL8 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
TIMMDC1Q9NPL8 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
TIMMDC1Q9NPL8 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TIMMDC1Q9NPL8 ARFGAP1-210ENST00000519273 3176 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TIMMDC1Q9NPL8 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TIMMDC1Q9NPL8 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TIMMDC1Q9NPL8 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TIMMDC1Q9NPL8 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TIMMDC1Q9NPL8 SPOCK1-202ENST00000394945 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TIMMDC1Q9NPL8 APAF1-201ENST00000333991 4539 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TIMMDC1Q9NPL8 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TIMMDC1Q9NPL8 KIFC3-205ENST00000540079 2781 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TIMMDC1Q9NPL8 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TIMMDC1Q9NPL8 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TIMMDC1Q9NPL8 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TIMMDC1Q9NPL8 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TIMMDC1Q9NPL8 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TIMMDC1Q9NPL8 CLCN2-202ENST00000344937 3187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TIMMDC1Q9NPL8 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TIMMDC1Q9NPL8 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TIMMDC1Q9NPL8 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TIMMDC1Q9NPL8 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TIMMDC1Q9NPL8 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TIMMDC1Q9NPL8 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TIMMDC1Q9NPL8 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TIMMDC1Q9NPL8 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TIMMDC1Q9NPL8 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TIMMDC1Q9NPL8 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
TIMMDC1Q9NPL8 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TIMMDC1Q9NPL8 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
TIMMDC1Q9NPL8 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TIMMDC1Q9NPL8 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
TIMMDC1Q9NPL8 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TIMMDC1Q9NPL8 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TIMMDC1Q9NPL8 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TIMMDC1Q9NPL8 TAS1R1-201ENST00000333172 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TIMMDC1Q9NPL8 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TIMMDC1Q9NPL8 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TIMMDC1Q9NPL8 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TIMMDC1Q9NPL8 MGEA5-201ENST00000357797 3263 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TIMMDC1Q9NPL8 KCNQ2-204ENST00000359125 3253 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TIMMDC1Q9NPL8 IL6ST-209ENST00000502326 3007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TIMMDC1Q9NPL8 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TIMMDC1Q9NPL8 GRID2IP-201ENST00000435185 3215 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TIMMDC1Q9NPL8 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TIMMDC1Q9NPL8 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
TIMMDC1Q9NPL8 PRPS1-204ENST00000372435 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TIMMDC1Q9NPL8 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TIMMDC1Q9NPL8 TRIM67-202ENST00000444294 9320 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TIMMDC1Q9NPL8 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
TIMMDC1Q9NPL8 R3HDM2-201ENST00000347140 4331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.7 ms