Protein–RNA interactions for Protein: Q9HC77

CENPJ, Centromere protein J, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPJQ9HC77 CHMP4A-204ENST00000530996 967 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CENPJQ9HC77 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CENPJQ9HC77 AC040162.1-202ENST00000573493 573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CENPJQ9HC77 TPGS2-215ENST00000590842 1239 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CENPJQ9HC77 AC010619.1-201ENST00000599536 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CENPJQ9HC77 AC239800.4-201ENST00000603712 296 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
CENPJQ9HC77 AC004840.1-201ENST00000636359 365 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
CENPJQ9HC77 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CENPJQ9HC77 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CENPJQ9HC77 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CENPJQ9HC77 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CENPJQ9HC77 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CENPJQ9HC77 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CENPJQ9HC77 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CENPJQ9HC77 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CENPJQ9HC77 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CENPJQ9HC77 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CENPJQ9HC77 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CENPJQ9HC77 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CENPJQ9HC77 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CENPJQ9HC77 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CENPJQ9HC77 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CENPJQ9HC77 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CENPJQ9HC77 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CENPJQ9HC77 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CENPJQ9HC77 CALY-202ENST00000368555 783 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CENPJQ9HC77 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CENPJQ9HC77 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CENPJQ9HC77 PSMB9-208ENST00000395330 792 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CENPJQ9HC77 RBAKDN-201ENST00000498308 514 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CENPJQ9HC77 ZNF890P-202ENST00000530367 1156 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
CENPJQ9HC77 AL512361.1-201ENST00000554200 418 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
CENPJQ9HC77 ELOF1-205ENST00000589171 743 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CENPJQ9HC77 AC012645.4-201ENST00000610691 1061 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
CENPJQ9HC77 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CENPJQ9HC77 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CENPJQ9HC77 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CENPJQ9HC77 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CENPJQ9HC77 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CENPJQ9HC77 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CENPJQ9HC77 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CENPJQ9HC77 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CENPJQ9HC77 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CENPJQ9HC77 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CENPJQ9HC77 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CENPJQ9HC77 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CENPJQ9HC77 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CENPJQ9HC77 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CENPJQ9HC77 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CENPJQ9HC77 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CENPJQ9HC77 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
CENPJQ9HC77 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CENPJQ9HC77 NME3-201ENST00000219302 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CENPJQ9HC77 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CENPJQ9HC77 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CENPJQ9HC77 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CENPJQ9HC77 STOM-203ENST00000538954 1257 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CENPJQ9HC77 AC099482.1-201ENST00000563471 481 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CENPJQ9HC77 AC010336.2-201ENST00000564226 506 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
CENPJQ9HC77 COX11-202ENST00000571584 1108 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CENPJQ9HC77 MYMX-202ENST00000576476 682 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CENPJQ9HC77 SPDYE22P-201ENST00000582158 798 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
CENPJQ9HC77 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CENPJQ9HC77 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CENPJQ9HC77 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CENPJQ9HC77 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CENPJQ9HC77 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
CENPJQ9HC77 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CENPJQ9HC77 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CENPJQ9HC77 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CENPJQ9HC77 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CENPJQ9HC77 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CENPJQ9HC77 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CENPJQ9HC77 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CENPJQ9HC77 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
CENPJQ9HC77 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
CENPJQ9HC77 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
CENPJQ9HC77 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
CENPJQ9HC77 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
CENPJQ9HC77 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CENPJQ9HC77 AL391069.3-201ENST00000455503 618 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CENPJQ9HC77 RBM7-207ENST00000544582 692 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CENPJQ9HC77 AC005225.4-201ENST00000557330 545 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
CENPJQ9HC77 ZNF710-AS1-201ENST00000558334 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CENPJQ9HC77 PRR29-204ENST00000577953 565 ntTSL 4 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CENPJQ9HC77 SSH2-210ENST00000582084 560 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CENPJQ9HC77 AC012615.6-204ENST00000587741 477 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CENPJQ9HC77 HDDC2-203ENST00000608284 538 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CENPJQ9HC77 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CENPJQ9HC77 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CENPJQ9HC77 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CENPJQ9HC77 CDIP1-206ENST00000563507 1463 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CENPJQ9HC77 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CENPJQ9HC77 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CENPJQ9HC77 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CENPJQ9HC77 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CENPJQ9HC77 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CENPJQ9HC77 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CENPJQ9HC77 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CENPJQ9HC77 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.3 ms