Protein–RNA interactions for Protein: Q9H6B4

CLMP, CXADR-like membrane protein, humanhuman

Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLMPQ9H6B4 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CLMPQ9H6B4 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
CLMPQ9H6B4 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CLMPQ9H6B4 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CLMPQ9H6B4 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CLMPQ9H6B4 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CLMPQ9H6B4 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CLMPQ9H6B4 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CLMPQ9H6B4 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CLMPQ9H6B4 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CLMPQ9H6B4 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CLMPQ9H6B4 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CLMPQ9H6B4 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CLMPQ9H6B4 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CLMPQ9H6B4 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CLMPQ9H6B4 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CLMPQ9H6B4 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CLMPQ9H6B4 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CLMPQ9H6B4 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CLMPQ9H6B4 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CLMPQ9H6B4 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
CLMPQ9H6B4 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CLMPQ9H6B4 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CLMPQ9H6B4 ATG10-207ENST00000513443 978 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CLMPQ9H6B4 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CLMPQ9H6B4 AQP6-203ENST00000551733 849 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CLMPQ9H6B4 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CLMPQ9H6B4 AC011491.2-201ENST00000599584 447 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CLMPQ9H6B4 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
CLMPQ9H6B4 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CLMPQ9H6B4 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CLMPQ9H6B4 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CLMPQ9H6B4 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CLMPQ9H6B4 TM2D3-207ENST00000559107 1353 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CLMPQ9H6B4 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CLMPQ9H6B4 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CLMPQ9H6B4 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CLMPQ9H6B4 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CLMPQ9H6B4 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CLMPQ9H6B4 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CLMPQ9H6B4 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CLMPQ9H6B4 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CLMPQ9H6B4 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CLMPQ9H6B4 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CLMPQ9H6B4 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CLMPQ9H6B4 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CLMPQ9H6B4 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CLMPQ9H6B4 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CLMPQ9H6B4 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
CLMPQ9H6B4 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CLMPQ9H6B4 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CLMPQ9H6B4 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CLMPQ9H6B4 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CLMPQ9H6B4 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
CLMPQ9H6B4 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CLMPQ9H6B4 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CLMPQ9H6B4 HEBP2-202ENST00000448741 661 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CLMPQ9H6B4 AC093214.1-201ENST00000511688 1107 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
CLMPQ9H6B4 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CLMPQ9H6B4 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CLMPQ9H6B4 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CLMPQ9H6B4 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CLMPQ9H6B4 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CLMPQ9H6B4 ZDHHC11-209ENST00000511539 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CLMPQ9H6B4 ZDHHC11B-204ENST00000622126 1301 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CLMPQ9H6B4 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CLMPQ9H6B4 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CLMPQ9H6B4 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CLMPQ9H6B4 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CLMPQ9H6B4 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CLMPQ9H6B4 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CLMPQ9H6B4 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CLMPQ9H6B4 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CLMPQ9H6B4 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CLMPQ9H6B4 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CLMPQ9H6B4 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CLMPQ9H6B4 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CLMPQ9H6B4 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CLMPQ9H6B4 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CLMPQ9H6B4 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CLMPQ9H6B4 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CLMPQ9H6B4 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CLMPQ9H6B4 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CLMPQ9H6B4 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CLMPQ9H6B4 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CLMPQ9H6B4 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CLMPQ9H6B4 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CLMPQ9H6B4 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CLMPQ9H6B4 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CLMPQ9H6B4 TMEM41A-201ENST00000296254 1060 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CLMPQ9H6B4 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CLMPQ9H6B4 GPR148-201ENST00000309926 1267 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CLMPQ9H6B4 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CLMPQ9H6B4 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CLMPQ9H6B4 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CLMPQ9H6B4 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CLMPQ9H6B4 AL022068.1-202ENST00000432171 794 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CLMPQ9H6B4 OARD1-208ENST00000469104 704 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CLMPQ9H6B4 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CLMPQ9H6B4 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.7 ms