Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZQ3

COMMD5, COMM domain-containing protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COMMD5Q9GZQ3 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
COMMD5Q9GZQ3 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
COMMD5Q9GZQ3 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
COMMD5Q9GZQ3 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
COMMD5Q9GZQ3 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
COMMD5Q9GZQ3 FAM122A-201ENST00000394264 4575 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
COMMD5Q9GZQ3 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
COMMD5Q9GZQ3 AHCYL2-202ENST00000446544 5026 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
COMMD5Q9GZQ3 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
COMMD5Q9GZQ3 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
COMMD5Q9GZQ3 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
COMMD5Q9GZQ3 HGNC:18790-202ENST00000421177 4172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
COMMD5Q9GZQ3 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
COMMD5Q9GZQ3 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
COMMD5Q9GZQ3 TRAPPC8-201ENST00000283351 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
COMMD5Q9GZQ3 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
COMMD5Q9GZQ3 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
COMMD5Q9GZQ3 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
COMMD5Q9GZQ3 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
COMMD5Q9GZQ3 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
COMMD5Q9GZQ3 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
COMMD5Q9GZQ3 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
COMMD5Q9GZQ3 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
COMMD5Q9GZQ3 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC13.46□□□□□ -0.25
COMMD5Q9GZQ3 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
COMMD5Q9GZQ3 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
COMMD5Q9GZQ3 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
COMMD5Q9GZQ3 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
COMMD5Q9GZQ3 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
COMMD5Q9GZQ3 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
COMMD5Q9GZQ3 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
COMMD5Q9GZQ3 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
COMMD5Q9GZQ3 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
COMMD5Q9GZQ3 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
COMMD5Q9GZQ3 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
COMMD5Q9GZQ3 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
COMMD5Q9GZQ3 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
COMMD5Q9GZQ3 AC021683.3-202ENST00000592572 4440 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
COMMD5Q9GZQ3 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
COMMD5Q9GZQ3 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
COMMD5Q9GZQ3 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
COMMD5Q9GZQ3 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
COMMD5Q9GZQ3 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.26
COMMD5Q9GZQ3 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
COMMD5Q9GZQ3 POU5F1B-201ENST00000465342 5360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.26
COMMD5Q9GZQ3 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
COMMD5Q9GZQ3 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC13.46□□□□□ -0.26
COMMD5Q9GZQ3 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
COMMD5Q9GZQ3 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
COMMD5Q9GZQ3 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
COMMD5Q9GZQ3 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
COMMD5Q9GZQ3 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
COMMD5Q9GZQ3 KCP-208ENST00000620378 4515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
COMMD5Q9GZQ3 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
COMMD5Q9GZQ3 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
COMMD5Q9GZQ3 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
COMMD5Q9GZQ3 ABCC10-201ENST00000244533 5088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
COMMD5Q9GZQ3 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
COMMD5Q9GZQ3 ECE1-204ENST00000415912 5099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
COMMD5Q9GZQ3 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
COMMD5Q9GZQ3 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
COMMD5Q9GZQ3 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
COMMD5Q9GZQ3 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
COMMD5Q9GZQ3 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
COMMD5Q9GZQ3 FUNDC2-201ENST00000369498 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
COMMD5Q9GZQ3 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
COMMD5Q9GZQ3 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
COMMD5Q9GZQ3 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
COMMD5Q9GZQ3 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
COMMD5Q9GZQ3 GOLGA7B-201ENST00000370602 6447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
COMMD5Q9GZQ3 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
COMMD5Q9GZQ3 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
COMMD5Q9GZQ3 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
COMMD5Q9GZQ3 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC13.45□□□□□ -0.26
COMMD5Q9GZQ3 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
COMMD5Q9GZQ3 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
COMMD5Q9GZQ3 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
COMMD5Q9GZQ3 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
COMMD5Q9GZQ3 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
COMMD5Q9GZQ3 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
COMMD5Q9GZQ3 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
COMMD5Q9GZQ3 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
COMMD5Q9GZQ3 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
COMMD5Q9GZQ3 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC13.45□□□□□ -0.26
COMMD5Q9GZQ3 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
COMMD5Q9GZQ3 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
COMMD5Q9GZQ3 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
COMMD5Q9GZQ3 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
COMMD5Q9GZQ3 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
COMMD5Q9GZQ3 MROH1-207ENST00000528919 5234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
COMMD5Q9GZQ3 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
COMMD5Q9GZQ3 COL11A2-202ENST00000361917 6104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
COMMD5Q9GZQ3 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
COMMD5Q9GZQ3 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
COMMD5Q9GZQ3 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
COMMD5Q9GZQ3 TTC28-AS1-207ENST00000428584 5859 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
COMMD5Q9GZQ3 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
COMMD5Q9GZQ3 CNTNAP3-202ENST00000358144 4885 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
COMMD5Q9GZQ3 PITPNM3-201ENST00000262483 7086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
COMMD5Q9GZQ3 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.9 ms