Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0C6

CIPC, CLOCK-interacting pacemaker, humanhuman

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Length 399 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CIPCQ9C0C6 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CIPCQ9C0C6 S100A14-206ENST00000476873 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CIPCQ9C0C6 SLC50A1-209ENST00000484157 886 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CIPCQ9C0C6 AC105233.2-201ENST00000523697 349 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
CIPCQ9C0C6 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CIPCQ9C0C6 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CIPCQ9C0C6 AF228730.5-201ENST00000530288 346 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
CIPCQ9C0C6 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CIPCQ9C0C6 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CIPCQ9C0C6 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
CIPCQ9C0C6 MIR3197-201ENST00000582241 73 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
CIPCQ9C0C6 RAB3D-202ENST00000589655 924 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CIPCQ9C0C6 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CIPCQ9C0C6 CLN3-246ENST00000636228 1224 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CIPCQ9C0C6 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CIPCQ9C0C6 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CIPCQ9C0C6 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CIPCQ9C0C6 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CIPCQ9C0C6 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CIPCQ9C0C6 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CIPCQ9C0C6 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CIPCQ9C0C6 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CIPCQ9C0C6 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CIPCQ9C0C6 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CIPCQ9C0C6 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
CIPCQ9C0C6 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CIPCQ9C0C6 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CIPCQ9C0C6 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CIPCQ9C0C6 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CIPCQ9C0C6 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CIPCQ9C0C6 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
CIPCQ9C0C6 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CIPCQ9C0C6 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
CIPCQ9C0C6 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CIPCQ9C0C6 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CIPCQ9C0C6 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CIPCQ9C0C6 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CIPCQ9C0C6 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CIPCQ9C0C6 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CIPCQ9C0C6 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CIPCQ9C0C6 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CIPCQ9C0C6 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CIPCQ9C0C6 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CIPCQ9C0C6 BCRP1-201ENST00000444246 691 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
CIPCQ9C0C6 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CIPCQ9C0C6 Z97055.2-201ENST00000563715 859 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CIPCQ9C0C6 FSTL3-202ENST00000588773 746 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CIPCQ9C0C6 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CIPCQ9C0C6 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CIPCQ9C0C6 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CIPCQ9C0C6 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CIPCQ9C0C6 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CIPCQ9C0C6 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CIPCQ9C0C6 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CIPCQ9C0C6 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CIPCQ9C0C6 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CIPCQ9C0C6 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CIPCQ9C0C6 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CIPCQ9C0C6 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CIPCQ9C0C6 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CIPCQ9C0C6 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
CIPCQ9C0C6 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CIPCQ9C0C6 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CIPCQ9C0C6 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CIPCQ9C0C6 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CIPCQ9C0C6 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CIPCQ9C0C6 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
CIPCQ9C0C6 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CIPCQ9C0C6 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CIPCQ9C0C6 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CIPCQ9C0C6 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CIPCQ9C0C6 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CIPCQ9C0C6 BAD-202ENST00000394531 631 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CIPCQ9C0C6 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CIPCQ9C0C6 AC026202.2-201ENST00000439325 672 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CIPCQ9C0C6 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
CIPCQ9C0C6 AC064807.1-203ENST00000520357 575 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CIPCQ9C0C6 IGHV3-42-201ENST00000520410 361 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
CIPCQ9C0C6 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
CIPCQ9C0C6 BAD-207ENST00000544785 525 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CIPCQ9C0C6 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CIPCQ9C0C6 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CIPCQ9C0C6 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CIPCQ9C0C6 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CIPCQ9C0C6 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CIPCQ9C0C6 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CIPCQ9C0C6 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CIPCQ9C0C6 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CIPCQ9C0C6 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CIPCQ9C0C6 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CIPCQ9C0C6 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CIPCQ9C0C6 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CIPCQ9C0C6 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CIPCQ9C0C6 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CIPCQ9C0C6 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CIPCQ9C0C6 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CIPCQ9C0C6 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CIPCQ9C0C6 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.3
CIPCQ9C0C6 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
CIPCQ9C0C6 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
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