Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYV2

TRIM54, Tripartite motif-containing protein 54, humanhuman

Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM54Q9BYV2 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TRIM54Q9BYV2 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TRIM54Q9BYV2 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TRIM54Q9BYV2 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TRIM54Q9BYV2 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TRIM54Q9BYV2 DPP6-203ENST00000404039 4798 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
TRIM54Q9BYV2 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
TRIM54Q9BYV2 PSD4-201ENST00000245796 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TRIM54Q9BYV2 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TRIM54Q9BYV2 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TRIM54Q9BYV2 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TRIM54Q9BYV2 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TRIM54Q9BYV2 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TRIM54Q9BYV2 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TRIM54Q9BYV2 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TRIM54Q9BYV2 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TRIM54Q9BYV2 KIF3A-202ENST00000378746 6325 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TRIM54Q9BYV2 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TRIM54Q9BYV2 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TRIM54Q9BYV2 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TRIM54Q9BYV2 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TRIM54Q9BYV2 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TRIM54Q9BYV2 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TRIM54Q9BYV2 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TRIM54Q9BYV2 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TRIM54Q9BYV2 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TRIM54Q9BYV2 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TRIM54Q9BYV2 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TRIM54Q9BYV2 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TRIM54Q9BYV2 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TRIM54Q9BYV2 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TRIM54Q9BYV2 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TRIM54Q9BYV2 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TRIM54Q9BYV2 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
TRIM54Q9BYV2 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
TRIM54Q9BYV2 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TRIM54Q9BYV2 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
TRIM54Q9BYV2 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TRIM54Q9BYV2 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TRIM54Q9BYV2 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
TRIM54Q9BYV2 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TRIM54Q9BYV2 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TRIM54Q9BYV2 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
TRIM54Q9BYV2 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TRIM54Q9BYV2 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TRIM54Q9BYV2 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TRIM54Q9BYV2 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TRIM54Q9BYV2 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TRIM54Q9BYV2 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TRIM54Q9BYV2 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TRIM54Q9BYV2 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TRIM54Q9BYV2 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TRIM54Q9BYV2 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TRIM54Q9BYV2 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TRIM54Q9BYV2 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TRIM54Q9BYV2 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TRIM54Q9BYV2 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TRIM54Q9BYV2 TC2N-201ENST00000340892 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TRIM54Q9BYV2 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TRIM54Q9BYV2 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TRIM54Q9BYV2 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TRIM54Q9BYV2 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TRIM54Q9BYV2 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TRIM54Q9BYV2 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TRIM54Q9BYV2 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TRIM54Q9BYV2 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TRIM54Q9BYV2 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TRIM54Q9BYV2 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TRIM54Q9BYV2 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TRIM54Q9BYV2 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRIM54Q9BYV2 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRIM54Q9BYV2 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRIM54Q9BYV2 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRIM54Q9BYV2 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRIM54Q9BYV2 PITPNM2-208ENST00000542749 6660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRIM54Q9BYV2 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRIM54Q9BYV2 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRIM54Q9BYV2 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRIM54Q9BYV2 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRIM54Q9BYV2 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRIM54Q9BYV2 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRIM54Q9BYV2 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRIM54Q9BYV2 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRIM54Q9BYV2 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
TRIM54Q9BYV2 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRIM54Q9BYV2 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRIM54Q9BYV2 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRIM54Q9BYV2 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRIM54Q9BYV2 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRIM54Q9BYV2 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRIM54Q9BYV2 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRIM54Q9BYV2 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRIM54Q9BYV2 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRIM54Q9BYV2 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRIM54Q9BYV2 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
TRIM54Q9BYV2 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRIM54Q9BYV2 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRIM54Q9BYV2 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRIM54Q9BYV2 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRIM54Q9BYV2 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33 ms