Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYJ9

YTHDF1, YTH domain-containing family protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
YTHDF1Q9BYJ9 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
YTHDF1Q9BYJ9 SYAP1-201ENST00000380155 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
YTHDF1Q9BYJ9 PGR-210ENST00000619228 3038 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
YTHDF1Q9BYJ9 NUTM2D-202ENST00000412718 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
YTHDF1Q9BYJ9 TUBB3-206ENST00000554444 1978 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
YTHDF1Q9BYJ9 SLC25A33-201ENST00000302692 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
YTHDF1Q9BYJ9 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
YTHDF1Q9BYJ9 AP4E1-201ENST00000261842 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
YTHDF1Q9BYJ9 DLX6-202ENST00000518156 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
YTHDF1Q9BYJ9 HNRNPF-201ENST00000337970 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
YTHDF1Q9BYJ9 TCP11L1-201ENST00000334274 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
YTHDF1Q9BYJ9 BPTF-202ENST00000321892 11292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
YTHDF1Q9BYJ9 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
YTHDF1Q9BYJ9 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
YTHDF1Q9BYJ9 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
YTHDF1Q9BYJ9 NR1H3-235ENST00000616973 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
YTHDF1Q9BYJ9 NBEAL2-205ENST00000450053 8827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
YTHDF1Q9BYJ9 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
YTHDF1Q9BYJ9 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
YTHDF1Q9BYJ9 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
YTHDF1Q9BYJ9 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
YTHDF1Q9BYJ9 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
YTHDF1Q9BYJ9 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
YTHDF1Q9BYJ9 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC15.12■□□□□ 0.01
YTHDF1Q9BYJ9 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC15.12■□□□□ 0.01
YTHDF1Q9BYJ9 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
YTHDF1Q9BYJ9 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
YTHDF1Q9BYJ9 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
YTHDF1Q9BYJ9 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
YTHDF1Q9BYJ9 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
YTHDF1Q9BYJ9 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
YTHDF1Q9BYJ9 ATP2C1-224ENST00000533801 3690 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
YTHDF1Q9BYJ9 NOS1AP-205ENST00000493151 5559 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
YTHDF1Q9BYJ9 HTR7-201ENST00000277874 3028 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
YTHDF1Q9BYJ9 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
YTHDF1Q9BYJ9 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
YTHDF1Q9BYJ9 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
YTHDF1Q9BYJ9 SLC4A2-202ENST00000413384 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
YTHDF1Q9BYJ9 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
YTHDF1Q9BYJ9 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
YTHDF1Q9BYJ9 LRRTM1-201ENST00000295057 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
YTHDF1Q9BYJ9 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
YTHDF1Q9BYJ9 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
YTHDF1Q9BYJ9 AC232323.1-201ENST00000540724 2099 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
YTHDF1Q9BYJ9 REXO1L5P-201ENST00000622260 2098 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
YTHDF1Q9BYJ9 GOLGA7B-201ENST00000370602 6447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
YTHDF1Q9BYJ9 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
YTHDF1Q9BYJ9 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
YTHDF1Q9BYJ9 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
YTHDF1Q9BYJ9 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
YTHDF1Q9BYJ9 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
YTHDF1Q9BYJ9 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
YTHDF1Q9BYJ9 TBC1D3P5-202ENST00000581469 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
YTHDF1Q9BYJ9 ARFGAP2-202ENST00000426335 2937 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
YTHDF1Q9BYJ9 EXOC6B-209ENST00000634650 2583 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
YTHDF1Q9BYJ9 NUP62-212ENST00000597723 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
YTHDF1Q9BYJ9 BCAR1-207ENST00000538440 3192 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
YTHDF1Q9BYJ9 HYAL1-209ENST00000618175 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
YTHDF1Q9BYJ9 CEP78-203ENST00000376598 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
YTHDF1Q9BYJ9 BCL11A-201ENST00000335712 5942 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
YTHDF1Q9BYJ9 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
YTHDF1Q9BYJ9 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
YTHDF1Q9BYJ9 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
YTHDF1Q9BYJ9 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC15.11■□□□□ 0.01
YTHDF1Q9BYJ9 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
YTHDF1Q9BYJ9 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
YTHDF1Q9BYJ9 SLCO6A1-205ENST00000506729 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
YTHDF1Q9BYJ9 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
YTHDF1Q9BYJ9 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
YTHDF1Q9BYJ9 MAGEA2B-202ENST00000370293 1714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
YTHDF1Q9BYJ9 CUX1-211ENST00000546411 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
YTHDF1Q9BYJ9 TBRG4-215ENST00000494076 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
YTHDF1Q9BYJ9 CHST3-201ENST00000373115 6970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
YTHDF1Q9BYJ9 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
YTHDF1Q9BYJ9 KCNG3-202ENST00000394973 3656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
YTHDF1Q9BYJ9 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
YTHDF1Q9BYJ9 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
YTHDF1Q9BYJ9 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
YTHDF1Q9BYJ9 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
YTHDF1Q9BYJ9 AC013726.1-201ENST00000563747 2285 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
YTHDF1Q9BYJ9 PCDHB8-201ENST00000239444 2740 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
YTHDF1Q9BYJ9 KANK2-207ENST00000589894 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
YTHDF1Q9BYJ9 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
YTHDF1Q9BYJ9 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
YTHDF1Q9BYJ9 SSFA2-205ENST00000431877 5150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
YTHDF1Q9BYJ9 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
YTHDF1Q9BYJ9 CCDC22-201ENST00000376227 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
YTHDF1Q9BYJ9 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
YTHDF1Q9BYJ9 ARHGEF26-AS1-204ENST00000491862 2598 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
YTHDF1Q9BYJ9 C14orf180-203ENST00000557649 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
YTHDF1Q9BYJ9 CBLN4-201ENST00000064571 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
YTHDF1Q9BYJ9 DISC1-209ENST00000439617 7059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
YTHDF1Q9BYJ9 KDM3A-201ENST00000312912 4886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
YTHDF1Q9BYJ9 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
YTHDF1Q9BYJ9 RECQL5-202ENST00000340830 1749 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
YTHDF1Q9BYJ9 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
YTHDF1Q9BYJ9 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
YTHDF1Q9BYJ9 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
YTHDF1Q9BYJ9 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
YTHDF1Q9BYJ9 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms