Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY12

SCAPER, S phase cyclin A-associated protein in the endoplasmic reticulum, humanhuman

Predictions only

Length 1,400 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAPERQ9BY12 AC244517.4-201ENST00000624549 580 ntTSL 4 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SCAPERQ9BY12 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SCAPERQ9BY12 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
SCAPERQ9BY12 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SCAPERQ9BY12 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SCAPERQ9BY12 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SCAPERQ9BY12 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SCAPERQ9BY12 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SCAPERQ9BY12 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SCAPERQ9BY12 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SCAPERQ9BY12 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SCAPERQ9BY12 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SCAPERQ9BY12 RFC5-204ENST00000454402 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SCAPERQ9BY12 CSHL1-203ENST00000346606 659 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SCAPERQ9BY12 UROS-203ENST00000368786 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SCAPERQ9BY12 NME4-207ENST00000450036 985 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SCAPERQ9BY12 AC106786.2-201ENST00000506859 561 ntTSL 4 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SCAPERQ9BY12 AP001453.3-201ENST00000545800 853 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SCAPERQ9BY12 AC010491.1-202ENST00000567048 528 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SCAPERQ9BY12 CD300LG-205ENST00000586233 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SCAPERQ9BY12 AC011497.1-201ENST00000596781 561 ntTSL 4 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SCAPERQ9BY12 AC243960.2-201ENST00000600996 747 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
SCAPERQ9BY12 AC097634.3-201ENST00000613067 820 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SCAPERQ9BY12 C9orf50-202ENST00000619117 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SCAPERQ9BY12 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SCAPERQ9BY12 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
SCAPERQ9BY12 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SCAPERQ9BY12 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SCAPERQ9BY12 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SCAPERQ9BY12 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SCAPERQ9BY12 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SCAPERQ9BY12 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
SCAPERQ9BY12 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
SCAPERQ9BY12 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
SCAPERQ9BY12 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
SCAPERQ9BY12 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
SCAPERQ9BY12 RHCE-205ENST00000349438 1235 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
SCAPERQ9BY12 GPAA1P2-201ENST00000417923 928 ntBASIC24.45■■□□□ 1.51
SCAPERQ9BY12 ACYP1-206ENST00000555694 565 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.51
SCAPERQ9BY12 C2orf69P2-201ENST00000562032 1123 ntBASIC24.45■■□□□ 1.51
SCAPERQ9BY12 ARL16-210ENST00000574938 751 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
SCAPERQ9BY12 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC24.45■■□□□ 1.51
SCAPERQ9BY12 YPEL2-205ENST00000585166 881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
SCAPERQ9BY12 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
SCAPERQ9BY12 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SCAPERQ9BY12 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SCAPERQ9BY12 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SCAPERQ9BY12 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
SCAPERQ9BY12 RHD-204ENST00000417538 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SCAPERQ9BY12 LOX-206ENST00000639739 1626 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SCAPERQ9BY12 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SCAPERQ9BY12 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SCAPERQ9BY12 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SCAPERQ9BY12 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SCAPERQ9BY12 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SCAPERQ9BY12 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SCAPERQ9BY12 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SCAPERQ9BY12 MGST3-203ENST00000367885 680 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SCAPERQ9BY12 AC243836.1-201ENST00000416696 438 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SCAPERQ9BY12 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SCAPERQ9BY12 DRGX-202ENST00000434016 955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SCAPERQ9BY12 RAB34-210ENST00000436730 863 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SCAPERQ9BY12 AC106886.2-201ENST00000483578 883 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SCAPERQ9BY12 AC018653.3-202ENST00000538062 735 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SCAPERQ9BY12 AL118558.1-202ENST00000557242 451 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SCAPERQ9BY12 SCGB1C2-201ENST00000595228 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SCAPERQ9BY12 ZNF83-215ENST00000600714 810 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SCAPERQ9BY12 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SCAPERQ9BY12 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
SCAPERQ9BY12 ZNF890P-201ENST00000422060 1352 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SCAPERQ9BY12 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SCAPERQ9BY12 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SCAPERQ9BY12 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SCAPERQ9BY12 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SCAPERQ9BY12 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SCAPERQ9BY12 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SCAPERQ9BY12 MPPE1-201ENST00000309976 1636 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SCAPERQ9BY12 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SCAPERQ9BY12 AC009686.1-201ENST00000522494 364 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SCAPERQ9BY12 PLEKHB1-206ENST00000535129 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SCAPERQ9BY12 AC129510.1-201ENST00000579979 555 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SCAPERQ9BY12 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
SCAPERQ9BY12 LINC00623-205ENST00000621058 767 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SCAPERQ9BY12 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SCAPERQ9BY12 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SCAPERQ9BY12 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SCAPERQ9BY12 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SCAPERQ9BY12 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SCAPERQ9BY12 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SCAPERQ9BY12 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SCAPERQ9BY12 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SCAPERQ9BY12 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SCAPERQ9BY12 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SCAPERQ9BY12 RPL13A-201ENST00000391857 1181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SCAPERQ9BY12 PEMT-203ENST00000395782 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SCAPERQ9BY12 AL845321.1-202ENST00000432011 786 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SCAPERQ9BY12 FXR1-221ENST00000491674 365 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SCAPERQ9BY12 AC087741.1-202ENST00000573346 801 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SCAPERQ9BY12 LITAF-218ENST00000576036 603 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SCAPERQ9BY12 AC009542.2-202ENST00000619004 1067 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48 ms