Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXW4

MAP1LC3C, Microtubule-associated proteins 1A/1B light chain 3C, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAP1LC3CQ9BXW4 SLC4A7-213ENST00000454389 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
MAP1LC3CQ9BXW4 AICDA-201ENST00000229335 2819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
MAP1LC3CQ9BXW4 ZNF557-201ENST00000252840 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
MAP1LC3CQ9BXW4 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
MAP1LC3CQ9BXW4 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC12.08□□□□□ -0.48
MAP1LC3CQ9BXW4 AC007191.1-201ENST00000623179 2995 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
MAP1LC3CQ9BXW4 AFF3-201ENST00000317233 8135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
MAP1LC3CQ9BXW4 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
MAP1LC3CQ9BXW4 COL8A2-201ENST00000303143 4447 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
MAP1LC3CQ9BXW4 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
MAP1LC3CQ9BXW4 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
MAP1LC3CQ9BXW4 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
MAP1LC3CQ9BXW4 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
MAP1LC3CQ9BXW4 DDX31-204ENST00000372159 4577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
MAP1LC3CQ9BXW4 WBP4-201ENST00000379487 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
MAP1LC3CQ9BXW4 ITGB2-206ENST00000397852 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
MAP1LC3CQ9BXW4 TSPOAP1-201ENST00000268893 7483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
MAP1LC3CQ9BXW4 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
MAP1LC3CQ9BXW4 CELF4-223ENST00000603232 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
MAP1LC3CQ9BXW4 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
MAP1LC3CQ9BXW4 PAX8-AS1-204ENST00000436293 2687 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
MAP1LC3CQ9BXW4 AC138904.3-201ENST00000635780 2681 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
MAP1LC3CQ9BXW4 OGFOD3-201ENST00000313056 4287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
MAP1LC3CQ9BXW4 ATP2B3-202ENST00000349466 4280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
MAP1LC3CQ9BXW4 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
MAP1LC3CQ9BXW4 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
MAP1LC3CQ9BXW4 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
MAP1LC3CQ9BXW4 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
MAP1LC3CQ9BXW4 ATXN10-202ENST00000381061 3135 ntTSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
MAP1LC3CQ9BXW4 LFNG-202ENST00000338732 1968 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
MAP1LC3CQ9BXW4 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
MAP1LC3CQ9BXW4 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
MAP1LC3CQ9BXW4 UVSSA-206ENST00000507531 2597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
MAP1LC3CQ9BXW4 PERM1-201ENST00000341290 3035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
MAP1LC3CQ9BXW4 KIFC3-207ENST00000543930 3018 ntTSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
MAP1LC3CQ9BXW4 NELFA-202ENST00000382882 3343 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
MAP1LC3CQ9BXW4 B3GALNT1-203ENST00000392781 3606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
MAP1LC3CQ9BXW4 DBF4-201ENST00000265728 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
MAP1LC3CQ9BXW4 PPFIA4-204ENST00000447715 6349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
MAP1LC3CQ9BXW4 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
MAP1LC3CQ9BXW4 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
MAP1LC3CQ9BXW4 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
MAP1LC3CQ9BXW4 FBXL19-201ENST00000338343 3965 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
MAP1LC3CQ9BXW4 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
MAP1LC3CQ9BXW4 AFDN-205ENST00000392108 6812 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
MAP1LC3CQ9BXW4 BAIAP3-202ENST00000397488 4583 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
MAP1LC3CQ9BXW4 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
MAP1LC3CQ9BXW4 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
MAP1LC3CQ9BXW4 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
MAP1LC3CQ9BXW4 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
MAP1LC3CQ9BXW4 CEP131-203ENST00000450824 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
MAP1LC3CQ9BXW4 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
MAP1LC3CQ9BXW4 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
MAP1LC3CQ9BXW4 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
MAP1LC3CQ9BXW4 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
MAP1LC3CQ9BXW4 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
MAP1LC3CQ9BXW4 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
MAP1LC3CQ9BXW4 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC12.07□□□□□ -0.48
MAP1LC3CQ9BXW4 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
MAP1LC3CQ9BXW4 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
MAP1LC3CQ9BXW4 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
MAP1LC3CQ9BXW4 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
MAP1LC3CQ9BXW4 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
MAP1LC3CQ9BXW4 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
MAP1LC3CQ9BXW4 CRYBG2-201ENST00000308182 5245 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
MAP1LC3CQ9BXW4 CCDC180-210ENST00000529487 5242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
MAP1LC3CQ9BXW4 SACM1L-201ENST00000389061 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
MAP1LC3CQ9BXW4 DMTN-205ENST00000432128 2508 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
MAP1LC3CQ9BXW4 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
MAP1LC3CQ9BXW4 ZC2HC1C-201ENST00000238686 2249 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
MAP1LC3CQ9BXW4 ARHGAP6-204ENST00000380718 3632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
MAP1LC3CQ9BXW4 CNTN2-201ENST00000331830 7999 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
MAP1LC3CQ9BXW4 ITGAM-202ENST00000544665 4718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
MAP1LC3CQ9BXW4 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
MAP1LC3CQ9BXW4 ZNF586-201ENST00000391702 2265 ntTSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
MAP1LC3CQ9BXW4 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
MAP1LC3CQ9BXW4 NRXN1-207ENST00000404971 7578 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
MAP1LC3CQ9BXW4 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
MAP1LC3CQ9BXW4 AC136621.1-201ENST00000624017 2304 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
MAP1LC3CQ9BXW4 PFAS-201ENST00000314666 5371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
MAP1LC3CQ9BXW4 THEMIS2-202ENST00000373921 2687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
MAP1LC3CQ9BXW4 E2F7-202ENST00000416496 5297 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
MAP1LC3CQ9BXW4 AP004608.1-203ENST00000528482 3679 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
MAP1LC3CQ9BXW4 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
MAP1LC3CQ9BXW4 OXTR-201ENST00000316793 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
MAP1LC3CQ9BXW4 COL4A1-201ENST00000375820 6532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
MAP1LC3CQ9BXW4 GID4-201ENST00000268719 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
MAP1LC3CQ9BXW4 EPB41L3-201ENST00000341928 4706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
MAP1LC3CQ9BXW4 PCDHGB1-202ENST00000611598 2592 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
MAP1LC3CQ9BXW4 GLIDR-202ENST00000625350 2588 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
MAP1LC3CQ9BXW4 EP400-203ENST00000333577 3092 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
MAP1LC3CQ9BXW4 ATCAY-201ENST00000450849 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
MAP1LC3CQ9BXW4 KLC4-204ENST00000453940 1945 ntTSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
MAP1LC3CQ9BXW4 ATP6V0A1-204ENST00000537728 2774 ntTSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
MAP1LC3CQ9BXW4 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
MAP1LC3CQ9BXW4 GRM5-AS1-201ENST00000526448 4821 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
MAP1LC3CQ9BXW4 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
MAP1LC3CQ9BXW4 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
MAP1LC3CQ9BXW4 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
MAP1LC3CQ9BXW4 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms