Protein–RNA interactions for Protein: Q9BWW8

APOL6, Apolipoprotein L6, humanhuman

Predictions only

Length 343 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOL6Q9BWW8 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
APOL6Q9BWW8 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
APOL6Q9BWW8 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
APOL6Q9BWW8 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
APOL6Q9BWW8 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
APOL6Q9BWW8 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
APOL6Q9BWW8 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
APOL6Q9BWW8 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
APOL6Q9BWW8 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
APOL6Q9BWW8 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
APOL6Q9BWW8 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
APOL6Q9BWW8 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
APOL6Q9BWW8 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
APOL6Q9BWW8 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
APOL6Q9BWW8 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
APOL6Q9BWW8 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
APOL6Q9BWW8 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
APOL6Q9BWW8 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
APOL6Q9BWW8 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
APOL6Q9BWW8 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
APOL6Q9BWW8 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
APOL6Q9BWW8 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
APOL6Q9BWW8 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
APOL6Q9BWW8 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
APOL6Q9BWW8 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC18■□□□□ 0.47
APOL6Q9BWW8 TMEM191A-202ENST00000419950 663 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
APOL6Q9BWW8 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
APOL6Q9BWW8 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC18■□□□□ 0.47
APOL6Q9BWW8 AC093214.1-201ENST00000511688 1107 ntBASIC18■□□□□ 0.47
APOL6Q9BWW8 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC18■□□□□ 0.47
APOL6Q9BWW8 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
APOL6Q9BWW8 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
APOL6Q9BWW8 AL512356.2-201ENST00000546955 174 ntBASIC18■□□□□ 0.47
APOL6Q9BWW8 RAB3D-202ENST00000589655 924 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
APOL6Q9BWW8 CLN3-246ENST00000636228 1224 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
APOL6Q9BWW8 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
APOL6Q9BWW8 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
APOL6Q9BWW8 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
APOL6Q9BWW8 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
APOL6Q9BWW8 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
APOL6Q9BWW8 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
APOL6Q9BWW8 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC18■□□□□ 0.47
APOL6Q9BWW8 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
APOL6Q9BWW8 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
APOL6Q9BWW8 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
APOL6Q9BWW8 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
APOL6Q9BWW8 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
APOL6Q9BWW8 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
APOL6Q9BWW8 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
APOL6Q9BWW8 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
APOL6Q9BWW8 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
APOL6Q9BWW8 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
APOL6Q9BWW8 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
APOL6Q9BWW8 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
APOL6Q9BWW8 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
APOL6Q9BWW8 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
APOL6Q9BWW8 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
APOL6Q9BWW8 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
APOL6Q9BWW8 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC17.99■□□□□ 0.47
APOL6Q9BWW8 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
APOL6Q9BWW8 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
APOL6Q9BWW8 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
APOL6Q9BWW8 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
APOL6Q9BWW8 MIR943-201ENST00000401286 94 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
APOL6Q9BWW8 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
APOL6Q9BWW8 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
APOL6Q9BWW8 AC021188.1-201ENST00000421534 740 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
APOL6Q9BWW8 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
APOL6Q9BWW8 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
APOL6Q9BWW8 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
APOL6Q9BWW8 AC105233.2-201ENST00000523697 349 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
APOL6Q9BWW8 AF228730.5-201ENST00000530288 346 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
APOL6Q9BWW8 LAT-209ENST00000564277 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
APOL6Q9BWW8 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC17.99■□□□□ 0.47
APOL6Q9BWW8 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC17.99■□□□□ 0.47
APOL6Q9BWW8 AL390955.2-201ENST00000603032 514 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
APOL6Q9BWW8 LINC02084-201ENST00000606069 1096 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
APOL6Q9BWW8 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC17.99■□□□□ 0.47
APOL6Q9BWW8 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
APOL6Q9BWW8 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
APOL6Q9BWW8 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
APOL6Q9BWW8 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
APOL6Q9BWW8 DEPTOR-203ENST00000523492 1397 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
APOL6Q9BWW8 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
APOL6Q9BWW8 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
APOL6Q9BWW8 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
APOL6Q9BWW8 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
APOL6Q9BWW8 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
APOL6Q9BWW8 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
APOL6Q9BWW8 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
APOL6Q9BWW8 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
APOL6Q9BWW8 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
APOL6Q9BWW8 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
APOL6Q9BWW8 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
APOL6Q9BWW8 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
APOL6Q9BWW8 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
APOL6Q9BWW8 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
APOL6Q9BWW8 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
APOL6Q9BWW8 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
APOL6Q9BWW8 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
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