Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSF4

TIMM29, Mitochondrial import inner membrane translocase subunit Tim29, humanhuman

Predictions only

Length 260 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIMM29Q9BSF4 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TIMM29Q9BSF4 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TIMM29Q9BSF4 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TIMM29Q9BSF4 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TIMM29Q9BSF4 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TIMM29Q9BSF4 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TIMM29Q9BSF4 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TIMM29Q9BSF4 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TIMM29Q9BSF4 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TIMM29Q9BSF4 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TIMM29Q9BSF4 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TIMM29Q9BSF4 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TIMM29Q9BSF4 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TIMM29Q9BSF4 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TIMM29Q9BSF4 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TIMM29Q9BSF4 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TIMM29Q9BSF4 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TIMM29Q9BSF4 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TIMM29Q9BSF4 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
TIMM29Q9BSF4 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TIMM29Q9BSF4 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TIMM29Q9BSF4 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TIMM29Q9BSF4 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TIMM29Q9BSF4 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TIMM29Q9BSF4 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TIMM29Q9BSF4 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TIMM29Q9BSF4 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TIMM29Q9BSF4 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TIMM29Q9BSF4 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TIMM29Q9BSF4 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TIMM29Q9BSF4 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TIMM29Q9BSF4 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TIMM29Q9BSF4 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TIMM29Q9BSF4 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TIMM29Q9BSF4 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TIMM29Q9BSF4 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TIMM29Q9BSF4 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TIMM29Q9BSF4 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TIMM29Q9BSF4 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TIMM29Q9BSF4 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TIMM29Q9BSF4 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TIMM29Q9BSF4 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TIMM29Q9BSF4 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TIMM29Q9BSF4 FAM72B-205ENST00000471903 676 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TIMM29Q9BSF4 CYMP-203ENST00000474680 1263 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
TIMM29Q9BSF4 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TIMM29Q9BSF4 FSTL3-202ENST00000588773 746 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TIMM29Q9BSF4 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
TIMM29Q9BSF4 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TIMM29Q9BSF4 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TIMM29Q9BSF4 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TIMM29Q9BSF4 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TIMM29Q9BSF4 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TIMM29Q9BSF4 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TIMM29Q9BSF4 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TIMM29Q9BSF4 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TIMM29Q9BSF4 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TIMM29Q9BSF4 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TIMM29Q9BSF4 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TIMM29Q9BSF4 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TIMM29Q9BSF4 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TIMM29Q9BSF4 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TIMM29Q9BSF4 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TIMM29Q9BSF4 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TIMM29Q9BSF4 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TIMM29Q9BSF4 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TIMM29Q9BSF4 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
TIMM29Q9BSF4 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TIMM29Q9BSF4 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TIMM29Q9BSF4 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TIMM29Q9BSF4 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TIMM29Q9BSF4 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TIMM29Q9BSF4 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TIMM29Q9BSF4 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TIMM29Q9BSF4 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TIMM29Q9BSF4 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TIMM29Q9BSF4 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TIMM29Q9BSF4 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
TIMM29Q9BSF4 ERAS-201ENST00000338270 1266 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TIMM29Q9BSF4 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TIMM29Q9BSF4 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TIMM29Q9BSF4 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TIMM29Q9BSF4 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TIMM29Q9BSF4 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
TIMM29Q9BSF4 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TIMM29Q9BSF4 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
TIMM29Q9BSF4 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
TIMM29Q9BSF4 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
TIMM29Q9BSF4 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TIMM29Q9BSF4 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TIMM29Q9BSF4 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TIMM29Q9BSF4 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TIMM29Q9BSF4 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TIMM29Q9BSF4 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
TIMM29Q9BSF4 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TIMM29Q9BSF4 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TIMM29Q9BSF4 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TIMM29Q9BSF4 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TIMM29Q9BSF4 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TIMM29Q9BSF4 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 90.4 ms