Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQD1

PMCHL2, Putative pro-MCH-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 86 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMCHL2Q9BQD1 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
PMCHL2Q9BQD1 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC12.02□□□□□ -0.49
PMCHL2Q9BQD1 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
PMCHL2Q9BQD1 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
PMCHL2Q9BQD1 ATP6V1H-201ENST00000355221 2365 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
PMCHL2Q9BQD1 ATP2B3-201ENST00000263519 6420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
PMCHL2Q9BQD1 BRD1-205ENST00000457780 4997 ntTSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
PMCHL2Q9BQD1 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
PMCHL2Q9BQD1 RTF1-201ENST00000389629 5021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
PMCHL2Q9BQD1 B4GALT3-213ENST00000622395 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
PMCHL2Q9BQD1 KCNH4-201ENST00000264661 3920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
PMCHL2Q9BQD1 FBXO41-201ENST00000295133 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
PMCHL2Q9BQD1 NR3C1-201ENST00000231509 3556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
PMCHL2Q9BQD1 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
PMCHL2Q9BQD1 TOR2A-202ENST00000373281 2477 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
PMCHL2Q9BQD1 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
PMCHL2Q9BQD1 DMTN-205ENST00000432128 2508 ntTSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
PMCHL2Q9BQD1 AMACR-203ENST00000382072 2919 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
PMCHL2Q9BQD1 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
PMCHL2Q9BQD1 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
PMCHL2Q9BQD1 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
PMCHL2Q9BQD1 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
PMCHL2Q9BQD1 LINC01184-204ENST00000501702 2977 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
PMCHL2Q9BQD1 LRRFIP1-204ENST00000392000 3365 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
PMCHL2Q9BQD1 LHX1-201ENST00000614239 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
PMCHL2Q9BQD1 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
PMCHL2Q9BQD1 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC12.02□□□□□ -0.49
PMCHL2Q9BQD1 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC12.02□□□□□ -0.49
PMCHL2Q9BQD1 MOCS3-201ENST00000244051 5106 ntAPPRIS P1 BASIC12.02□□□□□ -0.49
PMCHL2Q9BQD1 LPO-210ENST00000582328 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
PMCHL2Q9BQD1 MYADM-205ENST00000391771 3111 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.02□□□□□ -0.49
PMCHL2Q9BQD1 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
PMCHL2Q9BQD1 HEPACAM-201ENST00000298251 3602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
PMCHL2Q9BQD1 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
PMCHL2Q9BQD1 CELF4-223ENST00000603232 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
PMCHL2Q9BQD1 GRIP2-204ENST00000619221 7977 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
PMCHL2Q9BQD1 DEPDC5-203ENST00000400242 2395 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
PMCHL2Q9BQD1 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
PMCHL2Q9BQD1 NBPF26-208ENST00000620612 4602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
PMCHL2Q9BQD1 BRCC3-201ENST00000330045 2496 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
PMCHL2Q9BQD1 IRS1-201ENST00000305123 9705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
PMCHL2Q9BQD1 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
PMCHL2Q9BQD1 YY1AP1-201ENST00000295566 2626 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
PMCHL2Q9BQD1 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
PMCHL2Q9BQD1 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
PMCHL2Q9BQD1 FBXL19-204ENST00000471231 3641 ntTSL 2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
PMCHL2Q9BQD1 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
PMCHL2Q9BQD1 THEMIS2-202ENST00000373921 2687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
PMCHL2Q9BQD1 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
PMCHL2Q9BQD1 STC1-202ENST00000524323 1748 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
PMCHL2Q9BQD1 CA12-202ENST00000344366 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
PMCHL2Q9BQD1 TAB1-201ENST00000216160 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
PMCHL2Q9BQD1 TNFRSF11A-206ENST00000617039 3756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
PMCHL2Q9BQD1 NUTM2E-201ENST00000429984 3292 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
PMCHL2Q9BQD1 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
PMCHL2Q9BQD1 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
PMCHL2Q9BQD1 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
PMCHL2Q9BQD1 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
PMCHL2Q9BQD1 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC12.01□□□□□ -0.49
PMCHL2Q9BQD1 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
PMCHL2Q9BQD1 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
PMCHL2Q9BQD1 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC12.01□□□□□ -0.49
PMCHL2Q9BQD1 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC12.01□□□□□ -0.49
PMCHL2Q9BQD1 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
PMCHL2Q9BQD1 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
PMCHL2Q9BQD1 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
PMCHL2Q9BQD1 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
PMCHL2Q9BQD1 CFLAR-206ENST00000395148 4415 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
PMCHL2Q9BQD1 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
PMCHL2Q9BQD1 SPOCK3-201ENST00000357154 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
PMCHL2Q9BQD1 PHF19-203ENST00000419155 3525 ntTSL 2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
PMCHL2Q9BQD1 LTB4R-203ENST00000396789 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
PMCHL2Q9BQD1 PDRG1-201ENST00000202017 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
PMCHL2Q9BQD1 C17orf107-201ENST00000381365 3199 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
PMCHL2Q9BQD1 BAK1-201ENST00000360661 2132 ntTSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
PMCHL2Q9BQD1 AGPAT3-205ENST00000398063 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
PMCHL2Q9BQD1 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
PMCHL2Q9BQD1 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
PMCHL2Q9BQD1 OPA1-205ENST00000361908 6439 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
PMCHL2Q9BQD1 SPG11-210ENST00000558319 6426 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
PMCHL2Q9BQD1 C22orf34-204ENST00000414287 2197 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
PMCHL2Q9BQD1 COL6A2-202ENST00000310645 3446 ntTSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
PMCHL2Q9BQD1 TFE3-201ENST00000315869 3415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
PMCHL2Q9BQD1 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
PMCHL2Q9BQD1 DNAJC27-207ENST00000534855 4831 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
PMCHL2Q9BQD1 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
PMCHL2Q9BQD1 ARIH2-205ENST00000449376 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
PMCHL2Q9BQD1 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
PMCHL2Q9BQD1 CAPN7-201ENST00000253693 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
PMCHL2Q9BQD1 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
PMCHL2Q9BQD1 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
PMCHL2Q9BQD1 EBLN3P-202ENST00000625445 4520 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
PMCHL2Q9BQD1 RPS6KC1-201ENST00000366959 5454 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
PMCHL2Q9BQD1 RPS6KC1-202ENST00000366960 5490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
PMCHL2Q9BQD1 H6PD-203ENST00000602477 5590 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
PMCHL2Q9BQD1 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
PMCHL2Q9BQD1 KBTBD12-202ENST00000405109 5727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
PMCHL2Q9BQD1 CYB5D2-201ENST00000301391 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
PMCHL2Q9BQD1 VPS9D1-201ENST00000389386 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
PMCHL2Q9BQD1 HOXA3-201ENST00000317201 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81 ms