Protein–RNA interactions for Protein: Q99708

RBBP8, DNA endonuclease RBBP8, humanhuman

Predictions only

Length 897 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBBP8Q99708 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RBBP8Q99708 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RBBP8Q99708 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RBBP8Q99708 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RBBP8Q99708 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RBBP8Q99708 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RBBP8Q99708 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RBBP8Q99708 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RBBP8Q99708 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RBBP8Q99708 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RBBP8Q99708 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RBBP8Q99708 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RBBP8Q99708 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RBBP8Q99708 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RBBP8Q99708 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RBBP8Q99708 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
RBBP8Q99708 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
RBBP8Q99708 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
RBBP8Q99708 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
RBBP8Q99708 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
RBBP8Q99708 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
RBBP8Q99708 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RBBP8Q99708 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RBBP8Q99708 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RBBP8Q99708 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
RBBP8Q99708 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RBBP8Q99708 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
RBBP8Q99708 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RBBP8Q99708 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
RBBP8Q99708 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RBBP8Q99708 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
RBBP8Q99708 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
RBBP8Q99708 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RBBP8Q99708 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
RBBP8Q99708 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
RBBP8Q99708 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RBBP8Q99708 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RBBP8Q99708 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RBBP8Q99708 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
RBBP8Q99708 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
RBBP8Q99708 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
RBBP8Q99708 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.24
RBBP8Q99708 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RBBP8Q99708 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
RBBP8Q99708 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RBBP8Q99708 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RBBP8Q99708 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RBBP8Q99708 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RBBP8Q99708 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RBBP8Q99708 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RBBP8Q99708 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RBBP8Q99708 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RBBP8Q99708 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RBBP8Q99708 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RBBP8Q99708 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RBBP8Q99708 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RBBP8Q99708 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RBBP8Q99708 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RBBP8Q99708 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RBBP8Q99708 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RBBP8Q99708 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RBBP8Q99708 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RBBP8Q99708 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RBBP8Q99708 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RBBP8Q99708 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RBBP8Q99708 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RBBP8Q99708 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
RBBP8Q99708 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RBBP8Q99708 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RBBP8Q99708 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RBBP8Q99708 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RBBP8Q99708 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RBBP8Q99708 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RBBP8Q99708 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RBBP8Q99708 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RBBP8Q99708 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RBBP8Q99708 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RBBP8Q99708 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RBBP8Q99708 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RBBP8Q99708 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RBBP8Q99708 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RBBP8Q99708 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RBBP8Q99708 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RBBP8Q99708 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RBBP8Q99708 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RBBP8Q99708 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RBBP8Q99708 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RBBP8Q99708 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RBBP8Q99708 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RBBP8Q99708 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RBBP8Q99708 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RBBP8Q99708 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RBBP8Q99708 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RBBP8Q99708 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RBBP8Q99708 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
RBBP8Q99708 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RBBP8Q99708 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RBBP8Q99708 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RBBP8Q99708 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RBBP8Q99708 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.7 ms