Protein–RNA interactions for Protein: Q99697

PITX2, Pituitary homeobox 2, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITX2Q99697 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PITX2Q99697 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PITX2Q99697 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PITX2Q99697 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PITX2Q99697 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PITX2Q99697 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
PITX2Q99697 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
PITX2Q99697 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PITX2Q99697 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PITX2Q99697 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PITX2Q99697 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PITX2Q99697 ZXDC-202ENST00000389709 3405 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PITX2Q99697 RABGAP1L-201ENST00000251507 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PITX2Q99697 C3orf67-201ENST00000295966 2650 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PITX2Q99697 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PITX2Q99697 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PITX2Q99697 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
PITX2Q99697 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PITX2Q99697 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
PITX2Q99697 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PITX2Q99697 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PITX2Q99697 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
PITX2Q99697 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PITX2Q99697 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PITX2Q99697 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PITX2Q99697 TSPY26P-202ENST00000565928 3884 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
PITX2Q99697 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PITX2Q99697 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
PITX2Q99697 AC087164.1-202ENST00000583062 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PITX2Q99697 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PITX2Q99697 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PITX2Q99697 SLC7A4-201ENST00000382932 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PITX2Q99697 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PITX2Q99697 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PITX2Q99697 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PITX2Q99697 LDLR-204ENST00000545707 2429 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PITX2Q99697 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PITX2Q99697 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PITX2Q99697 CDH1-202ENST00000422392 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PITX2Q99697 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PITX2Q99697 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PITX2Q99697 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PITX2Q99697 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PITX2Q99697 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PITX2Q99697 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PITX2Q99697 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PITX2Q99697 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PITX2Q99697 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PITX2Q99697 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
PITX2Q99697 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
PITX2Q99697 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
PITX2Q99697 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PITX2Q99697 TBX5-203ENST00000405440 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PITX2Q99697 ARSE-206ENST00000545496 2506 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PITX2Q99697 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PITX2Q99697 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PITX2Q99697 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PITX2Q99697 MFSD5-202ENST00000534842 2038 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PITX2Q99697 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PITX2Q99697 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PITX2Q99697 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PITX2Q99697 AQP1-201ENST00000311813 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PITX2Q99697 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PITX2Q99697 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PITX2Q99697 HNRNPA1-202ENST00000340913 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PITX2Q99697 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PITX2Q99697 ARHGAP9-201ENST00000393791 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PITX2Q99697 EGLN3-201ENST00000250457 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PITX2Q99697 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PITX2Q99697 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PITX2Q99697 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PITX2Q99697 GHDC-203ENST00000428494 2518 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PITX2Q99697 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
PITX2Q99697 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PITX2Q99697 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PITX2Q99697 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PITX2Q99697 AL136379.1-201ENST00000623471 2642 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
PITX2Q99697 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PITX2Q99697 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PITX2Q99697 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PITX2Q99697 TBC1D17-202ENST00000535102 2025 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PITX2Q99697 SULT1C4-201ENST00000272452 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PITX2Q99697 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PITX2Q99697 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PITX2Q99697 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PITX2Q99697 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PITX2Q99697 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PITX2Q99697 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PITX2Q99697 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PITX2Q99697 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
PITX2Q99697 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
PITX2Q99697 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
PITX2Q99697 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PITX2Q99697 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
PITX2Q99697 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
PITX2Q99697 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
PITX2Q99697 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PITX2Q99697 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
PITX2Q99697 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
PITX2Q99697 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms