Protein–RNA interactions for Protein: Q99536

VAT1, Synaptic vesicle membrane protein VAT-1 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAT1Q99536 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
VAT1Q99536 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC16.84■□□□□ 0.29
VAT1Q99536 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
VAT1Q99536 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
VAT1Q99536 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
VAT1Q99536 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
VAT1Q99536 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
VAT1Q99536 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
VAT1Q99536 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
VAT1Q99536 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
VAT1Q99536 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
VAT1Q99536 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
VAT1Q99536 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
VAT1Q99536 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
VAT1Q99536 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
VAT1Q99536 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
VAT1Q99536 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
VAT1Q99536 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
VAT1Q99536 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
VAT1Q99536 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
VAT1Q99536 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
VAT1Q99536 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
VAT1Q99536 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
VAT1Q99536 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
VAT1Q99536 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
VAT1Q99536 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
VAT1Q99536 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
VAT1Q99536 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
VAT1Q99536 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
VAT1Q99536 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
VAT1Q99536 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
VAT1Q99536 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
VAT1Q99536 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
VAT1Q99536 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
VAT1Q99536 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
VAT1Q99536 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
VAT1Q99536 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
VAT1Q99536 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.29
VAT1Q99536 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
VAT1Q99536 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
VAT1Q99536 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
VAT1Q99536 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
VAT1Q99536 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
VAT1Q99536 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
VAT1Q99536 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
VAT1Q99536 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
VAT1Q99536 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
VAT1Q99536 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
VAT1Q99536 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
VAT1Q99536 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
VAT1Q99536 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
VAT1Q99536 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
VAT1Q99536 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
VAT1Q99536 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
VAT1Q99536 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
VAT1Q99536 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
VAT1Q99536 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
VAT1Q99536 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
VAT1Q99536 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
VAT1Q99536 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
VAT1Q99536 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.83■□□□□ 0.28
VAT1Q99536 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
VAT1Q99536 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
VAT1Q99536 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
VAT1Q99536 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
VAT1Q99536 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
VAT1Q99536 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
VAT1Q99536 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
VAT1Q99536 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
VAT1Q99536 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
VAT1Q99536 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
VAT1Q99536 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
VAT1Q99536 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
VAT1Q99536 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
VAT1Q99536 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
VAT1Q99536 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
VAT1Q99536 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
VAT1Q99536 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
VAT1Q99536 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
VAT1Q99536 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
VAT1Q99536 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
VAT1Q99536 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
VAT1Q99536 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
VAT1Q99536 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
VAT1Q99536 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
VAT1Q99536 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
VAT1Q99536 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
VAT1Q99536 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
VAT1Q99536 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
VAT1Q99536 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
VAT1Q99536 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
VAT1Q99536 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
VAT1Q99536 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
VAT1Q99536 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
VAT1Q99536 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
VAT1Q99536 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
VAT1Q99536 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
VAT1Q99536 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
VAT1Q99536 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
VAT1Q99536 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms