Protein–RNA interactions for Protein: Q96S38

RPS6KC1, Ribosomal protein S6 kinase delta-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,066 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS6KC1Q96S38 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RPS6KC1Q96S38 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
RPS6KC1Q96S38 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
RPS6KC1Q96S38 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RPS6KC1Q96S38 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RPS6KC1Q96S38 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RPS6KC1Q96S38 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RPS6KC1Q96S38 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RPS6KC1Q96S38 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RPS6KC1Q96S38 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
RPS6KC1Q96S38 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
RPS6KC1Q96S38 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RPS6KC1Q96S38 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
RPS6KC1Q96S38 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RPS6KC1Q96S38 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
RPS6KC1Q96S38 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RPS6KC1Q96S38 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RPS6KC1Q96S38 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RPS6KC1Q96S38 AC018685.2-201ENST00000414065 547 ntTSL 4 BASIC18.15■□□□□ 0.5
RPS6KC1Q96S38 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
RPS6KC1Q96S38 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
RPS6KC1Q96S38 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
RPS6KC1Q96S38 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RPS6KC1Q96S38 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
RPS6KC1Q96S38 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
RPS6KC1Q96S38 AC243562.1-201ENST00000560672 389 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
RPS6KC1Q96S38 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
RPS6KC1Q96S38 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
RPS6KC1Q96S38 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
RPS6KC1Q96S38 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
RPS6KC1Q96S38 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
RPS6KC1Q96S38 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RPS6KC1Q96S38 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RPS6KC1Q96S38 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RPS6KC1Q96S38 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
RPS6KC1Q96S38 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RPS6KC1Q96S38 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
RPS6KC1Q96S38 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
RPS6KC1Q96S38 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
RPS6KC1Q96S38 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RPS6KC1Q96S38 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RPS6KC1Q96S38 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RPS6KC1Q96S38 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
RPS6KC1Q96S38 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
RPS6KC1Q96S38 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
RPS6KC1Q96S38 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
RPS6KC1Q96S38 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
RPS6KC1Q96S38 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
RPS6KC1Q96S38 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
RPS6KC1Q96S38 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RPS6KC1Q96S38 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
RPS6KC1Q96S38 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RPS6KC1Q96S38 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RPS6KC1Q96S38 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
RPS6KC1Q96S38 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RPS6KC1Q96S38 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
RPS6KC1Q96S38 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
RPS6KC1Q96S38 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
RPS6KC1Q96S38 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
RPS6KC1Q96S38 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
RPS6KC1Q96S38 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
RPS6KC1Q96S38 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
RPS6KC1Q96S38 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
RPS6KC1Q96S38 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
RPS6KC1Q96S38 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
RPS6KC1Q96S38 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
RPS6KC1Q96S38 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
RPS6KC1Q96S38 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RPS6KC1Q96S38 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RPS6KC1Q96S38 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
RPS6KC1Q96S38 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RPS6KC1Q96S38 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RPS6KC1Q96S38 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RPS6KC1Q96S38 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RPS6KC1Q96S38 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
RPS6KC1Q96S38 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RPS6KC1Q96S38 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
RPS6KC1Q96S38 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC18.14■□□□□ 0.49
RPS6KC1Q96S38 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RPS6KC1Q96S38 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RPS6KC1Q96S38 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
RPS6KC1Q96S38 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
RPS6KC1Q96S38 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RPS6KC1Q96S38 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
RPS6KC1Q96S38 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RPS6KC1Q96S38 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RPS6KC1Q96S38 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RPS6KC1Q96S38 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RPS6KC1Q96S38 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RPS6KC1Q96S38 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RPS6KC1Q96S38 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RPS6KC1Q96S38 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RPS6KC1Q96S38 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RPS6KC1Q96S38 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RPS6KC1Q96S38 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RPS6KC1Q96S38 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
RPS6KC1Q96S38 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RPS6KC1Q96S38 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RPS6KC1Q96S38 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RPS6KC1Q96S38 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms