Protein–RNA interactions for Protein: Q96QF0

RAB3IP, Rab-3A-interacting protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 476 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB3IPQ96QF0 NR3C1-203ENST00000394464 6795 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RAB3IPQ96QF0 LRRTM1-201ENST00000295057 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RAB3IPQ96QF0 AC136621.1-201ENST00000624017 2304 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
RAB3IPQ96QF0 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RAB3IPQ96QF0 DKFZP434H168-201ENST00000567381 1905 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
RAB3IPQ96QF0 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RAB3IPQ96QF0 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RAB3IPQ96QF0 SSTR2-201ENST00000357585 7683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RAB3IPQ96QF0 UBR2-201ENST00000372899 7857 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RAB3IPQ96QF0 UBR2-202ENST00000372901 7857 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RAB3IPQ96QF0 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
RAB3IPQ96QF0 SHC1-204ENST00000368450 3059 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RAB3IPQ96QF0 SHC1-205ENST00000368453 3062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RAB3IPQ96QF0 UNC5B-202ENST00000373192 6451 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RAB3IPQ96QF0 ABCA7-203ENST00000435683 6211 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RAB3IPQ96QF0 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RAB3IPQ96QF0 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RAB3IPQ96QF0 ZFP41-203ENST00000520584 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RAB3IPQ96QF0 GTPBP1-201ENST00000216044 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RAB3IPQ96QF0 GSN-203ENST00000373808 2664 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RAB3IPQ96QF0 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RAB3IPQ96QF0 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RAB3IPQ96QF0 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RAB3IPQ96QF0 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
RAB3IPQ96QF0 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RAB3IPQ96QF0 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
RAB3IPQ96QF0 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RAB3IPQ96QF0 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RAB3IPQ96QF0 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RAB3IPQ96QF0 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RAB3IPQ96QF0 MAPK7-202ENST00000308406 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RAB3IPQ96QF0 ZBTB32-202ENST00000392197 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RAB3IPQ96QF0 CYP1B1-205ENST00000610745 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RAB3IPQ96QF0 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RAB3IPQ96QF0 FLAD1-201ENST00000292180 2160 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RAB3IPQ96QF0 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RAB3IPQ96QF0 RPP14-202ENST00000445193 7985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RAB3IPQ96QF0 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RAB3IPQ96QF0 IL9R-202ENST00000369423 2032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
RAB3IPQ96QF0 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
RAB3IPQ96QF0 PLEKHG3-202ENST00000394691 4397 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
RAB3IPQ96QF0 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
RAB3IPQ96QF0 HNRNPU-201ENST00000283179 3120 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
RAB3IPQ96QF0 KLHL33-203ENST00000637228 5404 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RAB3IPQ96QF0 SLC41A1-201ENST00000367137 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RAB3IPQ96QF0 AC020658.6-201ENST00000623564 1870 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
RAB3IPQ96QF0 MBD1-212ENST00000585672 2532 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RAB3IPQ96QF0 LFNG-202ENST00000338732 1968 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RAB3IPQ96QF0 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RAB3IPQ96QF0 NYAP1-201ENST00000300179 3581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RAB3IPQ96QF0 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
RAB3IPQ96QF0 TMEM41B-204ENST00000528080 3968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RAB3IPQ96QF0 TFB2M-201ENST00000366514 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RAB3IPQ96QF0 TTC22-202ENST00000371276 3345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RAB3IPQ96QF0 RBM47-203ENST00000381795 4473 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RAB3IPQ96QF0 OSMR-201ENST00000274276 5539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RAB3IPQ96QF0 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RAB3IPQ96QF0 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RAB3IPQ96QF0 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RAB3IPQ96QF0 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RAB3IPQ96QF0 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RAB3IPQ96QF0 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RAB3IPQ96QF0 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RAB3IPQ96QF0 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RAB3IPQ96QF0 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RAB3IPQ96QF0 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RAB3IPQ96QF0 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RAB3IPQ96QF0 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
RAB3IPQ96QF0 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RAB3IPQ96QF0 RRP1B-201ENST00000340648 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RAB3IPQ96QF0 M6PR-202ENST00000536844 2305 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RAB3IPQ96QF0 PCED1B-202ENST00000546455 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RAB3IPQ96QF0 PCDHB8-201ENST00000239444 2740 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RAB3IPQ96QF0 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RAB3IPQ96QF0 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RAB3IPQ96QF0 SLC40A1-201ENST00000261024 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RAB3IPQ96QF0 GRID2IP-202ENST00000452113 3428 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RAB3IPQ96QF0 USP43-202ENST00000570475 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RAB3IPQ96QF0 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RAB3IPQ96QF0 SIGLEC11-202ENST00000426971 2479 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RAB3IPQ96QF0 SMARCA2-214ENST00000450198 5602 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RAB3IPQ96QF0 RALGPS2-204ENST00000367635 5834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RAB3IPQ96QF0 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RAB3IPQ96QF0 RIPK1-201ENST00000259808 4160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RAB3IPQ96QF0 PRDM15-201ENST00000269844 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RAB3IPQ96QF0 SLC35C2-204ENST00000372230 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RAB3IPQ96QF0 ASIC4-202ENST00000358078 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RAB3IPQ96QF0 ARPP19-202ENST00000561650 3245 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RAB3IPQ96QF0 CAMSAP3-202ENST00000446248 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RAB3IPQ96QF0 CNOT9-208ENST00000542068 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RAB3IPQ96QF0 VWA7-201ENST00000375688 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RAB3IPQ96QF0 RNFT2-203ENST00000392549 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RAB3IPQ96QF0 UVSSA-206ENST00000507531 2597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RAB3IPQ96QF0 EXOC6B-209ENST00000634650 2583 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RAB3IPQ96QF0 CTNS-202ENST00000381870 2470 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RAB3IPQ96QF0 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RAB3IPQ96QF0 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RAB3IPQ96QF0 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RAB3IPQ96QF0 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RAB3IPQ96QF0 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms