Protein–RNA interactions for Protein: Q96BF3

TMIGD2, Transmembrane and immunoglobulin domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMIGD2Q96BF3 ACIN1-203ENST00000357481 2563 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TMIGD2Q96BF3 UBE2J1-201ENST00000435041 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TMIGD2Q96BF3 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TMIGD2Q96BF3 NEIL2-201ENST00000284503 2671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TMIGD2Q96BF3 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TMIGD2Q96BF3 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TMIGD2Q96BF3 PLEKHA4-201ENST00000263265 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TMIGD2Q96BF3 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TMIGD2Q96BF3 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TMIGD2Q96BF3 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TMIGD2Q96BF3 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TMIGD2Q96BF3 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
TMIGD2Q96BF3 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
TMIGD2Q96BF3 RUNDC3B-202ENST00000338056 4099 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
TMIGD2Q96BF3 TMC6-216ENST00000590602 5268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
TMIGD2Q96BF3 ZNF557-201ENST00000252840 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
TMIGD2Q96BF3 PAX8-AS1-204ENST00000436293 2687 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
TMIGD2Q96BF3 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
TMIGD2Q96BF3 MOCS1-201ENST00000340692 2747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
TMIGD2Q96BF3 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
TMIGD2Q96BF3 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TMIGD2Q96BF3 ZMYND15-202ENST00000433935 2411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TMIGD2Q96BF3 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TMIGD2Q96BF3 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TMIGD2Q96BF3 AC004805.1-201ENST00000577662 1616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TMIGD2Q96BF3 ZBTB32-202ENST00000392197 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TMIGD2Q96BF3 ATP2A3-204ENST00000397035 4182 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TMIGD2Q96BF3 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TMIGD2Q96BF3 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TMIGD2Q96BF3 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TMIGD2Q96BF3 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TMIGD2Q96BF3 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TMIGD2Q96BF3 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TMIGD2Q96BF3 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TMIGD2Q96BF3 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
TMIGD2Q96BF3 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TMIGD2Q96BF3 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TMIGD2Q96BF3 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TMIGD2Q96BF3 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TMIGD2Q96BF3 AL109954.1-202ENST00000564051 2148 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
TMIGD2Q96BF3 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TMIGD2Q96BF3 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TMIGD2Q96BF3 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TMIGD2Q96BF3 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TMIGD2Q96BF3 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TMIGD2Q96BF3 POU5F1-204ENST00000471529 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TMIGD2Q96BF3 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TMIGD2Q96BF3 FLAD1-201ENST00000292180 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TMIGD2Q96BF3 CCHCR1-201ENST00000376266 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TMIGD2Q96BF3 PPP1R26P4-201ENST00000619065 3527 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
TMIGD2Q96BF3 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TMIGD2Q96BF3 RBM12-201ENST00000359646 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TMIGD2Q96BF3 UGDH-201ENST00000316423 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TMIGD2Q96BF3 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TMIGD2Q96BF3 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TMIGD2Q96BF3 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TMIGD2Q96BF3 AC005840.4-201ENST00000541242 2494 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
TMIGD2Q96BF3 FMNL1-206ENST00000587489 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TMIGD2Q96BF3 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TMIGD2Q96BF3 AC007191.1-201ENST00000623179 2995 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
TMIGD2Q96BF3 SPIDR-201ENST00000297423 3988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TMIGD2Q96BF3 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TMIGD2Q96BF3 IGSF1-204ENST00000370903 4594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TMIGD2Q96BF3 PTBP1-203ENST00000356948 3598 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TMIGD2Q96BF3 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TMIGD2Q96BF3 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TMIGD2Q96BF3 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TMIGD2Q96BF3 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TMIGD2Q96BF3 TRAF3-202ENST00000351691 2239 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TMIGD2Q96BF3 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TMIGD2Q96BF3 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TMIGD2Q96BF3 SPHK2-202ENST00000340932 2492 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TMIGD2Q96BF3 AC079781.5-202ENST00000641784 3743 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
TMIGD2Q96BF3 KCNN2-201ENST00000264773 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TMIGD2Q96BF3 RGS3-201ENST00000317613 2542 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TMIGD2Q96BF3 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TMIGD2Q96BF3 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TMIGD2Q96BF3 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TMIGD2Q96BF3 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TMIGD2Q96BF3 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TMIGD2Q96BF3 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TMIGD2Q96BF3 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TMIGD2Q96BF3 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TMIGD2Q96BF3 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TMIGD2Q96BF3 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TMIGD2Q96BF3 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TMIGD2Q96BF3 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TMIGD2Q96BF3 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
TMIGD2Q96BF3 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TMIGD2Q96BF3 CELF4-223ENST00000603232 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TMIGD2Q96BF3 GPR137C-201ENST00000321662 3888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TMIGD2Q96BF3 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TMIGD2Q96BF3 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TMIGD2Q96BF3 CLEC18C-210ENST00000569347 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TMIGD2Q96BF3 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
TMIGD2Q96BF3 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
TMIGD2Q96BF3 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
TMIGD2Q96BF3 SLC52A3-201ENST00000217254 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TMIGD2Q96BF3 UHRF1-204ENST00000616255 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TMIGD2Q96BF3 LINC00528-201ENST00000600723 2160 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.7 ms