Protein–RNA interactions for Protein: Q969T4

UBE2E3, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 E3, humanhuman

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Length 207 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2E3Q969T4 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
UBE2E3Q969T4 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
UBE2E3Q969T4 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
UBE2E3Q969T4 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
UBE2E3Q969T4 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
UBE2E3Q969T4 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
UBE2E3Q969T4 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
UBE2E3Q969T4 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
UBE2E3Q969T4 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
UBE2E3Q969T4 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
UBE2E3Q969T4 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
UBE2E3Q969T4 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
UBE2E3Q969T4 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
UBE2E3Q969T4 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
UBE2E3Q969T4 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
UBE2E3Q969T4 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
UBE2E3Q969T4 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
UBE2E3Q969T4 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
UBE2E3Q969T4 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
UBE2E3Q969T4 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
UBE2E3Q969T4 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
UBE2E3Q969T4 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
UBE2E3Q969T4 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
UBE2E3Q969T4 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
UBE2E3Q969T4 NEDD4-202ENST00000435532 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
UBE2E3Q969T4 LRP10-201ENST00000359591 6886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
UBE2E3Q969T4 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
UBE2E3Q969T4 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
UBE2E3Q969T4 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
UBE2E3Q969T4 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
UBE2E3Q969T4 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
UBE2E3Q969T4 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
UBE2E3Q969T4 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
UBE2E3Q969T4 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
UBE2E3Q969T4 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
UBE2E3Q969T4 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
UBE2E3Q969T4 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
UBE2E3Q969T4 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
UBE2E3Q969T4 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
UBE2E3Q969T4 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
UBE2E3Q969T4 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
UBE2E3Q969T4 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
UBE2E3Q969T4 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
UBE2E3Q969T4 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
UBE2E3Q969T4 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
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UBE2E3Q969T4 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
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UBE2E3Q969T4 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
UBE2E3Q969T4 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
UBE2E3Q969T4 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
UBE2E3Q969T4 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
UBE2E3Q969T4 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
UBE2E3Q969T4 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
UBE2E3Q969T4 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
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UBE2E3Q969T4 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
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UBE2E3Q969T4 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
UBE2E3Q969T4 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
UBE2E3Q969T4 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
UBE2E3Q969T4 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
UBE2E3Q969T4 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
UBE2E3Q969T4 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
UBE2E3Q969T4 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
UBE2E3Q969T4 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
UBE2E3Q969T4 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
UBE2E3Q969T4 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
UBE2E3Q969T4 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
UBE2E3Q969T4 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
UBE2E3Q969T4 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
UBE2E3Q969T4 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
UBE2E3Q969T4 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
UBE2E3Q969T4 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
UBE2E3Q969T4 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
UBE2E3Q969T4 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
UBE2E3Q969T4 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
UBE2E3Q969T4 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
UBE2E3Q969T4 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
UBE2E3Q969T4 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
UBE2E3Q969T4 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
UBE2E3Q969T4 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
UBE2E3Q969T4 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
UBE2E3Q969T4 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
UBE2E3Q969T4 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
UBE2E3Q969T4 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
UBE2E3Q969T4 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
UBE2E3Q969T4 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
UBE2E3Q969T4 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
UBE2E3Q969T4 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
UBE2E3Q969T4 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
UBE2E3Q969T4 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
UBE2E3Q969T4 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
UBE2E3Q969T4 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
UBE2E3Q969T4 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
UBE2E3Q969T4 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
UBE2E3Q969T4 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
UBE2E3Q969T4 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC15.91■□□□□ 0.14
UBE2E3Q969T4 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
UBE2E3Q969T4 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
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