Protein–RNA interactions for Protein: Q8NHG7

SVIP, Small VCP/p97-interacting protein, humanhuman

Predictions only

Length 77 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SVIPQ8NHG7 KRT20-201ENST00000167588 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
SVIPQ8NHG7 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
SVIPQ8NHG7 ATP2C2-201ENST00000262429 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
SVIPQ8NHG7 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
SVIPQ8NHG7 NCF4-202ENST00000397147 1641 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
SVIPQ8NHG7 RERE-201ENST00000337907 8026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
SVIPQ8NHG7 PAPOLA-201ENST00000216277 4519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
SVIPQ8NHG7 HYOU1-220ENST00000617285 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
SVIPQ8NHG7 AR-203ENST00000396044 10221 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
SVIPQ8NHG7 FGFR1-202ENST00000335922 4157 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
SVIPQ8NHG7 EEF1AKMT3-202ENST00000333012 2762 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
SVIPQ8NHG7 SMC4-202ENST00000357388 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
SVIPQ8NHG7 EXOSC10-201ENST00000304457 2721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
SVIPQ8NHG7 KCNK10-202ENST00000319231 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
SVIPQ8NHG7 TAF6-201ENST00000344095 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
SVIPQ8NHG7 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
SVIPQ8NHG7 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
SVIPQ8NHG7 AC079062.1-202ENST00000581011 2636 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
SVIPQ8NHG7 SYMPK-214ENST00000599814 6537 ntTSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
SVIPQ8NHG7 AC110800.1-201ENST00000505498 441 ntTSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
SVIPQ8NHG7 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
SVIPQ8NHG7 TOM1L2-202ENST00000379504 2418 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
SVIPQ8NHG7 TMEM123-202ENST00000398136 3579 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
SVIPQ8NHG7 AGAP5-201ENST00000374094 2394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
SVIPQ8NHG7 GTF2IP13-202ENST00000609439 10247 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
SVIPQ8NHG7 CHTF18-205ENST00000455171 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
SVIPQ8NHG7 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
SVIPQ8NHG7 SLC7A8-204ENST00000422941 3018 ntTSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
SVIPQ8NHG7 GSPT1-206ENST00000563468 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
SVIPQ8NHG7 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
SVIPQ8NHG7 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
SVIPQ8NHG7 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
SVIPQ8NHG7 PER3-209ENST00000614998 6261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
SVIPQ8NHG7 ADAMTSL1-205ENST00000380548 8030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
SVIPQ8NHG7 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
SVIPQ8NHG7 GUF1-201ENST00000281543 4449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
SVIPQ8NHG7 M1AP-209ENST00000536235 2531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
SVIPQ8NHG7 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
SVIPQ8NHG7 DNAI2-205ENST00000579490 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
SVIPQ8NHG7 BCAR1-203ENST00000393422 4064 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
SVIPQ8NHG7 KSR1-204ENST00000398988 7237 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
SVIPQ8NHG7 TMEM25-204ENST00000359862 2395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
SVIPQ8NHG7 NSD2-205ENST00000382892 7706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
SVIPQ8NHG7 ISY1-203ENST00000393295 3842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
SVIPQ8NHG7 CCDC32-202ENST00000416810 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
SVIPQ8NHG7 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
SVIPQ8NHG7 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
SVIPQ8NHG7 GRID2IP-203ENST00000457091 3636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
SVIPQ8NHG7 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
SVIPQ8NHG7 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
SVIPQ8NHG7 SPATA2-202ENST00000422556 4138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
SVIPQ8NHG7 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
SVIPQ8NHG7 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
SVIPQ8NHG7 TOMM40L-202ENST00000367988 2708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
SVIPQ8NHG7 DSCAML1-203ENST00000527706 6099 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
SVIPQ8NHG7 CRELD1-202ENST00000383811 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
SVIPQ8NHG7 ENKUR-202ENST00000376363 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
SVIPQ8NHG7 DDX31-204ENST00000372159 4577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
SVIPQ8NHG7 FAM209A-201ENST00000371328 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
SVIPQ8NHG7 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
SVIPQ8NHG7 ADAMTSL2-202ENST00000393060 3725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
SVIPQ8NHG7 RBP3-201ENST00000584701 4276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
SVIPQ8NHG7 ANKRD34A-201ENST00000606888 3613 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
SVIPQ8NHG7 ADD1-204ENST00000398123 2361 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
SVIPQ8NHG7 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
SVIPQ8NHG7 LINC02245-201ENST00000449259 2928 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
SVIPQ8NHG7 COLGALT2-202ENST00000367520 2325 ntTSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
SVIPQ8NHG7 LIMK2-202ENST00000333611 3462 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
SVIPQ8NHG7 SHC1-202ENST00000368445 3472 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
SVIPQ8NHG7 AL353616.1-201ENST00000436315 2860 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
SVIPQ8NHG7 DPYSL5-207ENST00000614712 5128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
SVIPQ8NHG7 ADCY7-201ENST00000254235 6138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
SVIPQ8NHG7 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
SVIPQ8NHG7 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
SVIPQ8NHG7 ARHGEF1-203ENST00000354532 3243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
SVIPQ8NHG7 ALAD-201ENST00000409155 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
SVIPQ8NHG7 ABCA17P-202ENST00000469908 4188 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
SVIPQ8NHG7 EIF3CL-201ENST00000380876 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
SVIPQ8NHG7 SLC39A13-204ENST00000524928 3553 ntTSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
SVIPQ8NHG7 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
SVIPQ8NHG7 AC010624.1-201ENST00000527209 1525 ntTSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
SVIPQ8NHG7 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
SVIPQ8NHG7 CARS-201ENST00000278224 2491 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
SVIPQ8NHG7 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
SVIPQ8NHG7 PXDN-201ENST00000252804 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
SVIPQ8NHG7 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
SVIPQ8NHG7 FYN-203ENST00000368667 2416 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
SVIPQ8NHG7 COX10-AS1-202ENST00000449363 1944 ntTSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
SVIPQ8NHG7 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
SVIPQ8NHG7 NOSTRIN-203ENST00000397209 1437 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
SVIPQ8NHG7 THOC5-204ENST00000397873 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
SVIPQ8NHG7 WTIP-202ENST00000590071 13665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
SVIPQ8NHG7 NRP1-202ENST00000374816 2804 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
SVIPQ8NHG7 RPS6KC1-207ENST00000543470 4227 ntTSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
SVIPQ8NHG7 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
SVIPQ8NHG7 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
SVIPQ8NHG7 AC010997.4-201ENST00000609200 1890 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
SVIPQ8NHG7 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
SVIPQ8NHG7 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
SVIPQ8NHG7 DUS4L-201ENST00000265720 2220 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 138.9 ms