Protein–RNA interactions for Protein: Q8NBF1

GLIS1, Zinc finger protein GLIS1, humanhuman

Predictions only

Length 620 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GLIS1Q8NBF1 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GLIS1Q8NBF1 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GLIS1Q8NBF1 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GLIS1Q8NBF1 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
GLIS1Q8NBF1 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GLIS1Q8NBF1 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
GLIS1Q8NBF1 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
GLIS1Q8NBF1 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GLIS1Q8NBF1 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
GLIS1Q8NBF1 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC17■□□□□ 0.31
GLIS1Q8NBF1 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
GLIS1Q8NBF1 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GLIS1Q8NBF1 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC17■□□□□ 0.31
GLIS1Q8NBF1 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
GLIS1Q8NBF1 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
GLIS1Q8NBF1 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC17■□□□□ 0.31
GLIS1Q8NBF1 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
GLIS1Q8NBF1 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC17■□□□□ 0.31
GLIS1Q8NBF1 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
GLIS1Q8NBF1 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC17■□□□□ 0.31
GLIS1Q8NBF1 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
GLIS1Q8NBF1 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
GLIS1Q8NBF1 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC17■□□□□ 0.31
GLIS1Q8NBF1 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
GLIS1Q8NBF1 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
GLIS1Q8NBF1 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
GLIS1Q8NBF1 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GLIS1Q8NBF1 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
GLIS1Q8NBF1 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GLIS1Q8NBF1 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GLIS1Q8NBF1 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
GLIS1Q8NBF1 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
GLIS1Q8NBF1 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
GLIS1Q8NBF1 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
GLIS1Q8NBF1 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GLIS1Q8NBF1 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
GLIS1Q8NBF1 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GLIS1Q8NBF1 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GLIS1Q8NBF1 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GLIS1Q8NBF1 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GLIS1Q8NBF1 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GLIS1Q8NBF1 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GLIS1Q8NBF1 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GLIS1Q8NBF1 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GLIS1Q8NBF1 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GLIS1Q8NBF1 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GLIS1Q8NBF1 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GLIS1Q8NBF1 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GLIS1Q8NBF1 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
GLIS1Q8NBF1 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
GLIS1Q8NBF1 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GLIS1Q8NBF1 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GLIS1Q8NBF1 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GLIS1Q8NBF1 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GLIS1Q8NBF1 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
GLIS1Q8NBF1 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
GLIS1Q8NBF1 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GLIS1Q8NBF1 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GLIS1Q8NBF1 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
GLIS1Q8NBF1 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GLIS1Q8NBF1 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GLIS1Q8NBF1 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GLIS1Q8NBF1 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GLIS1Q8NBF1 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GLIS1Q8NBF1 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GLIS1Q8NBF1 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GLIS1Q8NBF1 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GLIS1Q8NBF1 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GLIS1Q8NBF1 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GLIS1Q8NBF1 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GLIS1Q8NBF1 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GLIS1Q8NBF1 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GLIS1Q8NBF1 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GLIS1Q8NBF1 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GLIS1Q8NBF1 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GLIS1Q8NBF1 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GLIS1Q8NBF1 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GLIS1Q8NBF1 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GLIS1Q8NBF1 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
GLIS1Q8NBF1 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
GLIS1Q8NBF1 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GLIS1Q8NBF1 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GLIS1Q8NBF1 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
GLIS1Q8NBF1 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GLIS1Q8NBF1 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GLIS1Q8NBF1 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GLIS1Q8NBF1 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GLIS1Q8NBF1 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GLIS1Q8NBF1 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GLIS1Q8NBF1 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GLIS1Q8NBF1 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GLIS1Q8NBF1 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GLIS1Q8NBF1 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GLIS1Q8NBF1 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GLIS1Q8NBF1 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GLIS1Q8NBF1 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GLIS1Q8NBF1 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GLIS1Q8NBF1 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GLIS1Q8NBF1 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GLIS1Q8NBF1 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms