Protein–RNA interactions for Protein: Q8N1N4

KRT78, Keratin, type II cytoskeletal 78, humanhuman

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Length 520 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT78Q8N1N4 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
KRT78Q8N1N4 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
KRT78Q8N1N4 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
KRT78Q8N1N4 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
KRT78Q8N1N4 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
KRT78Q8N1N4 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
KRT78Q8N1N4 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
KRT78Q8N1N4 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
KRT78Q8N1N4 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
KRT78Q8N1N4 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
KRT78Q8N1N4 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
KRT78Q8N1N4 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
KRT78Q8N1N4 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
KRT78Q8N1N4 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
KRT78Q8N1N4 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
KRT78Q8N1N4 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
KRT78Q8N1N4 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
KRT78Q8N1N4 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
KRT78Q8N1N4 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
KRT78Q8N1N4 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
KRT78Q8N1N4 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
KRT78Q8N1N4 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
KRT78Q8N1N4 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
KRT78Q8N1N4 GNS-201ENST00000258145 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
KRT78Q8N1N4 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
KRT78Q8N1N4 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
KRT78Q8N1N4 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
KRT78Q8N1N4 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
KRT78Q8N1N4 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
KRT78Q8N1N4 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
KRT78Q8N1N4 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
KRT78Q8N1N4 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
KRT78Q8N1N4 ZHX1-201ENST00000297857 5200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
KRT78Q8N1N4 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
KRT78Q8N1N4 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
KRT78Q8N1N4 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
KRT78Q8N1N4 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC16■□□□□ 0.15
KRT78Q8N1N4 ZNF84-202ENST00000392319 7020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
KRT78Q8N1N4 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
KRT78Q8N1N4 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
KRT78Q8N1N4 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
KRT78Q8N1N4 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
KRT78Q8N1N4 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
KRT78Q8N1N4 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
KRT78Q8N1N4 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
KRT78Q8N1N4 TTC6-206ENST00000553443 5833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
KRT78Q8N1N4 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
KRT78Q8N1N4 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
KRT78Q8N1N4 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
KRT78Q8N1N4 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
KRT78Q8N1N4 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
KRT78Q8N1N4 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
KRT78Q8N1N4 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC16■□□□□ 0.15
KRT78Q8N1N4 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
KRT78Q8N1N4 TNR-201ENST00000263525 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
KRT78Q8N1N4 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
KRT78Q8N1N4 TAP2-205ENST00000620123 5676 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
KRT78Q8N1N4 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
KRT78Q8N1N4 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
KRT78Q8N1N4 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
KRT78Q8N1N4 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
KRT78Q8N1N4 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
KRT78Q8N1N4 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
KRT78Q8N1N4 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
KRT78Q8N1N4 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
KRT78Q8N1N4 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
KRT78Q8N1N4 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
KRT78Q8N1N4 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
KRT78Q8N1N4 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
KRT78Q8N1N4 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
KRT78Q8N1N4 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
KRT78Q8N1N4 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
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KRT78Q8N1N4 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
KRT78Q8N1N4 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
KRT78Q8N1N4 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
KRT78Q8N1N4 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
KRT78Q8N1N4 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
KRT78Q8N1N4 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
KRT78Q8N1N4 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
KRT78Q8N1N4 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
KRT78Q8N1N4 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
KRT78Q8N1N4 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
KRT78Q8N1N4 RCN2-203ENST00000394885 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
KRT78Q8N1N4 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
KRT78Q8N1N4 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
KRT78Q8N1N4 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
KRT78Q8N1N4 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
KRT78Q8N1N4 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
KRT78Q8N1N4 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
KRT78Q8N1N4 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
KRT78Q8N1N4 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
KRT78Q8N1N4 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
KRT78Q8N1N4 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
KRT78Q8N1N4 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
KRT78Q8N1N4 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
KRT78Q8N1N4 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
KRT78Q8N1N4 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
KRT78Q8N1N4 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
KRT78Q8N1N4 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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