Protein–RNA interactions for Protein: Q86W25

NLRP13, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 13, humanhuman

Predictions only

Length 1,043 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLRP13Q86W25 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NLRP13Q86W25 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NLRP13Q86W25 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NLRP13Q86W25 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NLRP13Q86W25 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NLRP13Q86W25 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NLRP13Q86W25 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NLRP13Q86W25 LCE3E-201ENST00000368789 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NLRP13Q86W25 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NLRP13Q86W25 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NLRP13Q86W25 AP001471.1-201ENST00000454245 672 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NLRP13Q86W25 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NLRP13Q86W25 AC114956.2-201ENST00000512498 572 ntTSL 4 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NLRP13Q86W25 PTHLH-206ENST00000538310 854 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NLRP13Q86W25 ZNF324B-203ENST00000594214 564 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NLRP13Q86W25 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NLRP13Q86W25 AC100757.3-201ENST00000622361 1406 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
NLRP13Q86W25 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NLRP13Q86W25 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NLRP13Q86W25 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NLRP13Q86W25 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NLRP13Q86W25 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NLRP13Q86W25 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NLRP13Q86W25 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NLRP13Q86W25 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NLRP13Q86W25 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NLRP13Q86W25 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NLRP13Q86W25 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NLRP13Q86W25 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NLRP13Q86W25 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NLRP13Q86W25 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NLRP13Q86W25 CYSRT1-201ENST00000409414 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NLRP13Q86W25 TSSK5P-201ENST00000423978 907 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
NLRP13Q86W25 AC142381.1-201ENST00000426099 345 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
NLRP13Q86W25 FYCO1-203ENST00000438446 1072 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NLRP13Q86W25 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NLRP13Q86W25 LINC01160-202ENST00000450155 894 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NLRP13Q86W25 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NLRP13Q86W25 UBE2H-204ENST00000473814 535 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NLRP13Q86W25 AC027307.3-201ENST00000594262 1100 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
NLRP13Q86W25 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
NLRP13Q86W25 IER3IP1-202ENST00000639845 832 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NLRP13Q86W25 AL358472.5-202ENST00000641448 1267 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
NLRP13Q86W25 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NLRP13Q86W25 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NLRP13Q86W25 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NLRP13Q86W25 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NLRP13Q86W25 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NLRP13Q86W25 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NLRP13Q86W25 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NLRP13Q86W25 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NLRP13Q86W25 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NLRP13Q86W25 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NLRP13Q86W25 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NLRP13Q86W25 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.23
NLRP13Q86W25 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.23
NLRP13Q86W25 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NLRP13Q86W25 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NLRP13Q86W25 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NLRP13Q86W25 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NLRP13Q86W25 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NLRP13Q86W25 JTB-201ENST00000271843 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NLRP13Q86W25 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
NLRP13Q86W25 AC106872.10-201ENST00000503778 747 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NLRP13Q86W25 CHMP4A-204ENST00000530996 967 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NLRP13Q86W25 CR383656.12-201ENST00000549567 513 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
NLRP13Q86W25 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NLRP13Q86W25 SPDYE22P-201ENST00000582158 798 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
NLRP13Q86W25 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NLRP13Q86W25 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NLRP13Q86W25 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NLRP13Q86W25 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NLRP13Q86W25 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NLRP13Q86W25 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NLRP13Q86W25 TDG-209ENST00000544861 1387 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NLRP13Q86W25 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NLRP13Q86W25 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NLRP13Q86W25 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NLRP13Q86W25 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NLRP13Q86W25 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NLRP13Q86W25 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NLRP13Q86W25 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NLRP13Q86W25 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NLRP13Q86W25 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NLRP13Q86W25 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NLRP13Q86W25 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NLRP13Q86W25 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NLRP13Q86W25 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NLRP13Q86W25 LAT-202ENST00000360872 1459 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NLRP13Q86W25 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NLRP13Q86W25 CHIA-203ENST00000353665 1214 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NLRP13Q86W25 WFDC3-204ENST00000372632 704 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NLRP13Q86W25 PIN1P1-201ENST00000412108 996 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
NLRP13Q86W25 LINC01818-201ENST00000437118 368 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NLRP13Q86W25 AC106772.1-201ENST00000506629 591 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NLRP13Q86W25 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NLRP13Q86W25 TOMM5-205ENST00000544379 635 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NLRP13Q86W25 RIC8B-209ENST00000549643 571 ntTSL 4 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NLRP13Q86W25 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
NLRP13Q86W25 AC116003.1-201ENST00000578340 536 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.4 ms