Protein–RNA interactions for Protein: Q86TJ5

ZNF554, Zinc finger protein 554, humanhuman

Predictions only

Length 538 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF554Q86TJ5 ALDH4A1-206ENST00000538839 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
ZNF554Q86TJ5 AMMECR1-203ENST00000372059 3052 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
ZNF554Q86TJ5 RAF1-201ENST00000251849 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ZNF554Q86TJ5 COL6A2-201ENST00000300527 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ZNF554Q86TJ5 SACM1L-201ENST00000389061 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ZNF554Q86TJ5 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ZNF554Q86TJ5 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ZNF554Q86TJ5 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
ZNF554Q86TJ5 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC15.05■□□□□ -0
ZNF554Q86TJ5 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
ZNF554Q86TJ5 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
ZNF554Q86TJ5 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
ZNF554Q86TJ5 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
ZNF554Q86TJ5 DYSF-201ENST00000258104 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ZNF554Q86TJ5 DYSF-204ENST00000409582 6790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ZNF554Q86TJ5 DYSF-210ENST00000413539 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ZNF554Q86TJ5 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC15.05■□□□□ -0
ZNF554Q86TJ5 WASHC2C-208ENST00000537517 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
ZNF554Q86TJ5 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ZNF554Q86TJ5 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
ZNF554Q86TJ5 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ZNF554Q86TJ5 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ZNF554Q86TJ5 TTC28-AS1-219ENST00000454741 5064 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ZNF554Q86TJ5 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
ZNF554Q86TJ5 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ZNF554Q86TJ5 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
ZNF554Q86TJ5 OSMR-201ENST00000274276 5539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ZNF554Q86TJ5 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
ZNF554Q86TJ5 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ZNF554Q86TJ5 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
ZNF554Q86TJ5 TATDN3-202ENST00000366974 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ZNF554Q86TJ5 TLE4-204ENST00000376537 2793 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ZNF554Q86TJ5 CDS2-203ENST00000460006 9298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ZNF554Q86TJ5 LHX1-201ENST00000614239 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ZNF554Q86TJ5 PALD1-201ENST00000263563 4555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ZNF554Q86TJ5 DUSP28-202ENST00000405954 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ZNF554Q86TJ5 CEP63-212ENST00000513612 2903 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
ZNF554Q86TJ5 TRIM71-201ENST00000383763 8685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ZNF554Q86TJ5 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ZNF554Q86TJ5 TMEM50A-201ENST00000374358 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ZNF554Q86TJ5 SCYL1-201ENST00000270176 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ZNF554Q86TJ5 ECE1-201ENST00000264205 2381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ZNF554Q86TJ5 SCAMP4-202ENST00000409472 2394 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
ZNF554Q86TJ5 OPA1-208ENST00000392438 6340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ZNF554Q86TJ5 TBC1D17-202ENST00000535102 2025 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
ZNF554Q86TJ5 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
ZNF554Q86TJ5 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
ZNF554Q86TJ5 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ZNF554Q86TJ5 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ZNF554Q86TJ5 C12orf49-201ENST00000261318 8404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ZNF554Q86TJ5 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
ZNF554Q86TJ5 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
ZNF554Q86TJ5 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
ZNF554Q86TJ5 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC15.04■□□□□ -0
ZNF554Q86TJ5 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ZNF554Q86TJ5 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
ZNF554Q86TJ5 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC15.04■□□□□ -0
ZNF554Q86TJ5 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
ZNF554Q86TJ5 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
ZNF554Q86TJ5 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
ZNF554Q86TJ5 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
ZNF554Q86TJ5 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
ZNF554Q86TJ5 ACSL1-202ENST00000454703 3636 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
ZNF554Q86TJ5 CGB7-203ENST00000597853 3386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
ZNF554Q86TJ5 GSK3B-201ENST00000264235 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ZNF554Q86TJ5 SLC38A9-202ENST00000396865 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ZNF554Q86TJ5 DEPTOR-201ENST00000286234 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ZNF554Q86TJ5 ELFN2-207ENST00000613079 8360 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
ZNF554Q86TJ5 KIF21A-202ENST00000361961 6601 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ZNF554Q86TJ5 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ZNF554Q86TJ5 MAGEA8-204ENST00000535454 2112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
ZNF554Q86TJ5 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ZNF554Q86TJ5 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
ZNF554Q86TJ5 IPPK-201ENST00000287996 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ZNF554Q86TJ5 BICDL1-201ENST00000397558 3055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
ZNF554Q86TJ5 NXPH1-201ENST00000405863 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ZNF554Q86TJ5 COL9A2-202ENST00000372748 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ZNF554Q86TJ5 SAFB-205ENST00000588852 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ZNF554Q86TJ5 UBXN2B-201ENST00000399598 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ZNF554Q86TJ5 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
ZNF554Q86TJ5 MAN1B1-202ENST00000371589 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ZNF554Q86TJ5 LCOR-202ENST00000356016 4834 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
ZNF554Q86TJ5 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
ZNF554Q86TJ5 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ZNF554Q86TJ5 IL21R-AS1-201ENST00000563191 2615 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
ZNF554Q86TJ5 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
ZNF554Q86TJ5 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ZNF554Q86TJ5 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ZNF554Q86TJ5 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
ZNF554Q86TJ5 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ZNF554Q86TJ5 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ZNF554Q86TJ5 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC15.03■□□□□ -0
ZNF554Q86TJ5 XRRA1-202ENST00000340360 5681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
ZNF554Q86TJ5 ISLR-202ENST00000395118 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ZNF554Q86TJ5 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ZNF554Q86TJ5 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
ZNF554Q86TJ5 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC15.03■□□□□ -0
ZNF554Q86TJ5 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ZNF554Q86TJ5 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
ZNF554Q86TJ5 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms