Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z3S7

CACNA2D4, Voltage-dependent calcium channel subunit alpha-2/delta-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,137 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA2D4Q7Z3S7 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CACNA2D4Q7Z3S7 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CACNA2D4Q7Z3S7 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CACNA2D4Q7Z3S7 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CACNA2D4Q7Z3S7 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
CACNA2D4Q7Z3S7 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CACNA2D4Q7Z3S7 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CACNA2D4Q7Z3S7 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CACNA2D4Q7Z3S7 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CACNA2D4Q7Z3S7 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CACNA2D4Q7Z3S7 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CACNA2D4Q7Z3S7 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
CACNA2D4Q7Z3S7 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CACNA2D4Q7Z3S7 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CACNA2D4Q7Z3S7 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CACNA2D4Q7Z3S7 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CACNA2D4Q7Z3S7 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
CACNA2D4Q7Z3S7 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CACNA2D4Q7Z3S7 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CACNA2D4Q7Z3S7 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CACNA2D4Q7Z3S7 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CACNA2D4Q7Z3S7 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CACNA2D4Q7Z3S7 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CACNA2D4Q7Z3S7 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CACNA2D4Q7Z3S7 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CACNA2D4Q7Z3S7 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CACNA2D4Q7Z3S7 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CACNA2D4Q7Z3S7 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CACNA2D4Q7Z3S7 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CACNA2D4Q7Z3S7 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CACNA2D4Q7Z3S7 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CACNA2D4Q7Z3S7 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CACNA2D4Q7Z3S7 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CACNA2D4Q7Z3S7 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CACNA2D4Q7Z3S7 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CACNA2D4Q7Z3S7 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
CACNA2D4Q7Z3S7 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CACNA2D4Q7Z3S7 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CACNA2D4Q7Z3S7 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CACNA2D4Q7Z3S7 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CACNA2D4Q7Z3S7 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CACNA2D4Q7Z3S7 USP45-201ENST00000327681 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CACNA2D4Q7Z3S7 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CACNA2D4Q7Z3S7 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CACNA2D4Q7Z3S7 ARL5B-201ENST00000377275 7196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CACNA2D4Q7Z3S7 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CACNA2D4Q7Z3S7 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CACNA2D4Q7Z3S7 RUFY2-203ENST00000388768 4502 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CACNA2D4Q7Z3S7 AC063926.3-201ENST00000624734 5658 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
CACNA2D4Q7Z3S7 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CACNA2D4Q7Z3S7 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CACNA2D4Q7Z3S7 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CACNA2D4Q7Z3S7 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CACNA2D4Q7Z3S7 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CACNA2D4Q7Z3S7 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CACNA2D4Q7Z3S7 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CACNA2D4Q7Z3S7 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CACNA2D4Q7Z3S7 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CACNA2D4Q7Z3S7 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CACNA2D4Q7Z3S7 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CACNA2D4Q7Z3S7 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CACNA2D4Q7Z3S7 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CACNA2D4Q7Z3S7 LZTS1-201ENST00000265801 5459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CACNA2D4Q7Z3S7 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CACNA2D4Q7Z3S7 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CACNA2D4Q7Z3S7 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CACNA2D4Q7Z3S7 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CACNA2D4Q7Z3S7 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CACNA2D4Q7Z3S7 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CACNA2D4Q7Z3S7 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CACNA2D4Q7Z3S7 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
CACNA2D4Q7Z3S7 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CACNA2D4Q7Z3S7 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CACNA2D4Q7Z3S7 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CACNA2D4Q7Z3S7 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CACNA2D4Q7Z3S7 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
CACNA2D4Q7Z3S7 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CACNA2D4Q7Z3S7 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CACNA2D4Q7Z3S7 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CACNA2D4Q7Z3S7 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CACNA2D4Q7Z3S7 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CACNA2D4Q7Z3S7 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CACNA2D4Q7Z3S7 RB1CC1-202ENST00000435644 6614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CACNA2D4Q7Z3S7 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CACNA2D4Q7Z3S7 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CACNA2D4Q7Z3S7 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CACNA2D4Q7Z3S7 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CACNA2D4Q7Z3S7 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CACNA2D4Q7Z3S7 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CACNA2D4Q7Z3S7 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CACNA2D4Q7Z3S7 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CACNA2D4Q7Z3S7 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CACNA2D4Q7Z3S7 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CACNA2D4Q7Z3S7 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CACNA2D4Q7Z3S7 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CACNA2D4Q7Z3S7 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CACNA2D4Q7Z3S7 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CACNA2D4Q7Z3S7 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CACNA2D4Q7Z3S7 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CACNA2D4Q7Z3S7 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.8 ms