Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTX7

CATSPER4, Cation channel sperm-associated protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CATSPER4Q7RTX7 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CATSPER4Q7RTX7 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CATSPER4Q7RTX7 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CATSPER4Q7RTX7 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CATSPER4Q7RTX7 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CATSPER4Q7RTX7 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CATSPER4Q7RTX7 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CATSPER4Q7RTX7 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CATSPER4Q7RTX7 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CATSPER4Q7RTX7 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC18■□□□□ 0.47
CATSPER4Q7RTX7 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CATSPER4Q7RTX7 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CATSPER4Q7RTX7 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CATSPER4Q7RTX7 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CATSPER4Q7RTX7 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CATSPER4Q7RTX7 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CATSPER4Q7RTX7 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CATSPER4Q7RTX7 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
CATSPER4Q7RTX7 HNRNPA1P40-201ENST00000426371 1278 ntBASIC18■□□□□ 0.47
CATSPER4Q7RTX7 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC18■□□□□ 0.47
CATSPER4Q7RTX7 AL022316.1-201ENST00000428765 572 ntTSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
CATSPER4Q7RTX7 U52111.1-201ENST00000434284 914 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
CATSPER4Q7RTX7 AL512638.1-201ENST00000457493 794 ntBASIC18■□□□□ 0.47
CATSPER4Q7RTX7 NDUFAF2-203ENST00000511107 586 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CATSPER4Q7RTX7 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CATSPER4Q7RTX7 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CATSPER4Q7RTX7 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CATSPER4Q7RTX7 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CATSPER4Q7RTX7 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CATSPER4Q7RTX7 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CATSPER4Q7RTX7 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CATSPER4Q7RTX7 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CATSPER4Q7RTX7 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CATSPER4Q7RTX7 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CATSPER4Q7RTX7 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CATSPER4Q7RTX7 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CATSPER4Q7RTX7 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CATSPER4Q7RTX7 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CATSPER4Q7RTX7 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
CATSPER4Q7RTX7 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CATSPER4Q7RTX7 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CATSPER4Q7RTX7 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CATSPER4Q7RTX7 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CATSPER4Q7RTX7 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CATSPER4Q7RTX7 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CATSPER4Q7RTX7 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CATSPER4Q7RTX7 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CATSPER4Q7RTX7 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CATSPER4Q7RTX7 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CATSPER4Q7RTX7 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CATSPER4Q7RTX7 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CATSPER4Q7RTX7 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CATSPER4Q7RTX7 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
CATSPER4Q7RTX7 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CATSPER4Q7RTX7 CALY-203ENST00000368558 825 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CATSPER4Q7RTX7 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CATSPER4Q7RTX7 RBM43-202ENST00000409092 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CATSPER4Q7RTX7 AL365255.1-202ENST00000413887 363 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CATSPER4Q7RTX7 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CATSPER4Q7RTX7 AC092580.3-201ENST00000430932 139 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
CATSPER4Q7RTX7 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CATSPER4Q7RTX7 TMEM176B-205ENST00000450753 1006 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CATSPER4Q7RTX7 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
CATSPER4Q7RTX7 TMEM120B-206ENST00000540377 962 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CATSPER4Q7RTX7 GREM1-201ENST00000560677 623 ntTSL 4 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CATSPER4Q7RTX7 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CATSPER4Q7RTX7 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CATSPER4Q7RTX7 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CATSPER4Q7RTX7 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CATSPER4Q7RTX7 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CATSPER4Q7RTX7 CLN3-229ENST00000567963 1452 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CATSPER4Q7RTX7 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CATSPER4Q7RTX7 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CATSPER4Q7RTX7 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CATSPER4Q7RTX7 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CATSPER4Q7RTX7 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CATSPER4Q7RTX7 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CATSPER4Q7RTX7 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CATSPER4Q7RTX7 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CATSPER4Q7RTX7 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CATSPER4Q7RTX7 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CATSPER4Q7RTX7 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CATSPER4Q7RTX7 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CATSPER4Q7RTX7 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
CATSPER4Q7RTX7 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CATSPER4Q7RTX7 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CATSPER4Q7RTX7 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CATSPER4Q7RTX7 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CATSPER4Q7RTX7 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CATSPER4Q7RTX7 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CATSPER4Q7RTX7 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CATSPER4Q7RTX7 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CATSPER4Q7RTX7 EIF5A-201ENST00000336452 1256 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CATSPER4Q7RTX7 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CATSPER4Q7RTX7 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CATSPER4Q7RTX7 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CATSPER4Q7RTX7 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
CATSPER4Q7RTX7 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CATSPER4Q7RTX7 FBXO4-206ENST00000509134 1284 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CATSPER4Q7RTX7 MTFR1L-218ENST00000526894 733 ntTSL 4 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.2 ms