Protein–RNA interactions for Protein: Q70EL4

USP43, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 43, humanhuman

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Length 1,123 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP43Q70EL4 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
USP43Q70EL4 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
USP43Q70EL4 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
USP43Q70EL4 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
USP43Q70EL4 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
USP43Q70EL4 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
USP43Q70EL4 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
USP43Q70EL4 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
USP43Q70EL4 ARHGAP45-212ENST00000590577 3218 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
USP43Q70EL4 NFATC1-218ENST00000592223 2531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
USP43Q70EL4 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
USP43Q70EL4 KRT85-201ENST00000257901 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
USP43Q70EL4 CMTM6-201ENST00000205636 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
USP43Q70EL4 LRP10-201ENST00000359591 6886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
USP43Q70EL4 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
USP43Q70EL4 TMEM25-206ENST00000442938 2228 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
USP43Q70EL4 CDH24-202ENST00000397359 3552 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
USP43Q70EL4 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
USP43Q70EL4 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
USP43Q70EL4 SPEG-205ENST00000396698 3379 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
USP43Q70EL4 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
USP43Q70EL4 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
USP43Q70EL4 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
USP43Q70EL4 EPOP-201ENST00000621654 3719 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
USP43Q70EL4 LEMD3-201ENST00000308330 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
USP43Q70EL4 TAF4B-203ENST00000578121 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
USP43Q70EL4 DDX59-206ENST00000447706 2900 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
USP43Q70EL4 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
USP43Q70EL4 MVK-207ENST00000539575 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
USP43Q70EL4 CNTNAP3-202ENST00000358144 4885 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
USP43Q70EL4 WBP4-201ENST00000379487 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
USP43Q70EL4 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
USP43Q70EL4 LIMS2-205ENST00000409455 2500 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
USP43Q70EL4 INPP5B-202ENST00000373023 4694 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
USP43Q70EL4 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
USP43Q70EL4 NOS1AP-205ENST00000493151 5559 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
USP43Q70EL4 BRD2-202ENST00000374831 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
USP43Q70EL4 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
USP43Q70EL4 DUOX1-201ENST00000321429 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
USP43Q70EL4 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
USP43Q70EL4 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
USP43Q70EL4 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
USP43Q70EL4 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
USP43Q70EL4 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
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USP43Q70EL4 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
USP43Q70EL4 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
USP43Q70EL4 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
USP43Q70EL4 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
USP43Q70EL4 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
USP43Q70EL4 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
USP43Q70EL4 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
USP43Q70EL4 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
USP43Q70EL4 TBC1D2-203ENST00000375064 3174 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
USP43Q70EL4 AKT1S1-205ENST00000391833 3640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
USP43Q70EL4 AC087164.1-202ENST00000583062 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
USP43Q70EL4 RNF11-201ENST00000242719 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
USP43Q70EL4 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
USP43Q70EL4 AC138035.3-201ENST00000622706 2791 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
USP43Q70EL4 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
USP43Q70EL4 C3orf67-201ENST00000295966 2650 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
USP43Q70EL4 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
USP43Q70EL4 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
USP43Q70EL4 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
USP43Q70EL4 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
USP43Q70EL4 PRDM6-201ENST00000407847 9267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
USP43Q70EL4 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
USP43Q70EL4 IPO8-201ENST00000256079 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
USP43Q70EL4 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
USP43Q70EL4 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
USP43Q70EL4 MYH14-204ENST00000440075 4247 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
USP43Q70EL4 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
USP43Q70EL4 AC073264.3-201ENST00000636941 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
USP43Q70EL4 TMEM237-202ENST00000409444 5592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
USP43Q70EL4 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
USP43Q70EL4 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
USP43Q70EL4 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
USP43Q70EL4 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
USP43Q70EL4 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
USP43Q70EL4 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
USP43Q70EL4 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
USP43Q70EL4 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
USP43Q70EL4 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
USP43Q70EL4 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
USP43Q70EL4 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
USP43Q70EL4 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
USP43Q70EL4 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
USP43Q70EL4 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
USP43Q70EL4 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
USP43Q70EL4 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
USP43Q70EL4 ARL8B-208ENST00000611208 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
USP43Q70EL4 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
USP43Q70EL4 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
USP43Q70EL4 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
USP43Q70EL4 SBF1-201ENST00000348911 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
USP43Q70EL4 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
USP43Q70EL4 DIAPH2-204ENST00000373054 3376 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
USP43Q70EL4 CES4A-207ENST00000540947 2284 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
USP43Q70EL4 AC027601.1-201ENST00000575922 4506 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
USP43Q70EL4 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
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