Protein–RNA interactions for Protein: Q6UWL2

SUSD1, Sushi domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 747 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUSD1Q6UWL2 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
SUSD1Q6UWL2 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SUSD1Q6UWL2 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
SUSD1Q6UWL2 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SUSD1Q6UWL2 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SUSD1Q6UWL2 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SUSD1Q6UWL2 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SUSD1Q6UWL2 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SUSD1Q6UWL2 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SUSD1Q6UWL2 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SUSD1Q6UWL2 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SUSD1Q6UWL2 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SUSD1Q6UWL2 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SUSD1Q6UWL2 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SUSD1Q6UWL2 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SUSD1Q6UWL2 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SUSD1Q6UWL2 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SUSD1Q6UWL2 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SUSD1Q6UWL2 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SUSD1Q6UWL2 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SUSD1Q6UWL2 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SUSD1Q6UWL2 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SUSD1Q6UWL2 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SUSD1Q6UWL2 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SUSD1Q6UWL2 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SUSD1Q6UWL2 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SUSD1Q6UWL2 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SUSD1Q6UWL2 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SUSD1Q6UWL2 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SUSD1Q6UWL2 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SUSD1Q6UWL2 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SUSD1Q6UWL2 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SUSD1Q6UWL2 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SUSD1Q6UWL2 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
SUSD1Q6UWL2 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SUSD1Q6UWL2 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SUSD1Q6UWL2 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SUSD1Q6UWL2 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SUSD1Q6UWL2 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SUSD1Q6UWL2 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SUSD1Q6UWL2 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SUSD1Q6UWL2 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
SUSD1Q6UWL2 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SUSD1Q6UWL2 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SUSD1Q6UWL2 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SUSD1Q6UWL2 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SUSD1Q6UWL2 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SUSD1Q6UWL2 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SUSD1Q6UWL2 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SUSD1Q6UWL2 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SUSD1Q6UWL2 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
SUSD1Q6UWL2 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SUSD1Q6UWL2 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SUSD1Q6UWL2 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SUSD1Q6UWL2 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
SUSD1Q6UWL2 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
SUSD1Q6UWL2 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
SUSD1Q6UWL2 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SUSD1Q6UWL2 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SUSD1Q6UWL2 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SUSD1Q6UWL2 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SUSD1Q6UWL2 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SUSD1Q6UWL2 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SUSD1Q6UWL2 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SUSD1Q6UWL2 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SUSD1Q6UWL2 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SUSD1Q6UWL2 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SUSD1Q6UWL2 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SUSD1Q6UWL2 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SUSD1Q6UWL2 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SUSD1Q6UWL2 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
SUSD1Q6UWL2 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SUSD1Q6UWL2 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SUSD1Q6UWL2 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SUSD1Q6UWL2 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SUSD1Q6UWL2 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SUSD1Q6UWL2 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SUSD1Q6UWL2 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SUSD1Q6UWL2 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SUSD1Q6UWL2 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SUSD1Q6UWL2 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SUSD1Q6UWL2 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SUSD1Q6UWL2 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SUSD1Q6UWL2 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SUSD1Q6UWL2 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SUSD1Q6UWL2 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SUSD1Q6UWL2 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
SUSD1Q6UWL2 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SUSD1Q6UWL2 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SUSD1Q6UWL2 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SUSD1Q6UWL2 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SUSD1Q6UWL2 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SUSD1Q6UWL2 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SUSD1Q6UWL2 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SUSD1Q6UWL2 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SUSD1Q6UWL2 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SUSD1Q6UWL2 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SUSD1Q6UWL2 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SUSD1Q6UWL2 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SUSD1Q6UWL2 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms