Protein–RNA interactions for Protein: Q6R2W3

ZBED9, SCAN domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,325 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED9Q6R2W3 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ZBED9Q6R2W3 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ZBED9Q6R2W3 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ZBED9Q6R2W3 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ZBED9Q6R2W3 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ZBED9Q6R2W3 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
ZBED9Q6R2W3 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
ZBED9Q6R2W3 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ZBED9Q6R2W3 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ZBED9Q6R2W3 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
ZBED9Q6R2W3 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ZBED9Q6R2W3 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ZBED9Q6R2W3 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ZBED9Q6R2W3 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ZBED9Q6R2W3 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ZBED9Q6R2W3 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ZBED9Q6R2W3 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ZBED9Q6R2W3 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ZBED9Q6R2W3 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ZBED9Q6R2W3 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ZBED9Q6R2W3 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ZBED9Q6R2W3 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ZBED9Q6R2W3 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ZBED9Q6R2W3 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ZBED9Q6R2W3 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ZBED9Q6R2W3 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ZBED9Q6R2W3 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ZBED9Q6R2W3 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ZBED9Q6R2W3 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ZBED9Q6R2W3 AC091100.1-201ENST00000558424 2354 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ZBED9Q6R2W3 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
ZBED9Q6R2W3 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ZBED9Q6R2W3 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ZBED9Q6R2W3 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ZBED9Q6R2W3 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ZBED9Q6R2W3 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ZBED9Q6R2W3 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ZBED9Q6R2W3 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ZBED9Q6R2W3 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ZBED9Q6R2W3 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ZBED9Q6R2W3 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
ZBED9Q6R2W3 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
ZBED9Q6R2W3 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ZBED9Q6R2W3 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ZBED9Q6R2W3 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
ZBED9Q6R2W3 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ZBED9Q6R2W3 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ZBED9Q6R2W3 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ZBED9Q6R2W3 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ZBED9Q6R2W3 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ZBED9Q6R2W3 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ZBED9Q6R2W3 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ZBED9Q6R2W3 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ZBED9Q6R2W3 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ZBED9Q6R2W3 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ZBED9Q6R2W3 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ZBED9Q6R2W3 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ZBED9Q6R2W3 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ZBED9Q6R2W3 ZNF197-203ENST00000383744 1989 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ZBED9Q6R2W3 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ZBED9Q6R2W3 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ZBED9Q6R2W3 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ZBED9Q6R2W3 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ZBED9Q6R2W3 AHCY-201ENST00000217426 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ZBED9Q6R2W3 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ZBED9Q6R2W3 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ZBED9Q6R2W3 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ZBED9Q6R2W3 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ZBED9Q6R2W3 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ZBED9Q6R2W3 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ZBED9Q6R2W3 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ZBED9Q6R2W3 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ZBED9Q6R2W3 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
ZBED9Q6R2W3 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ZBED9Q6R2W3 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ZBED9Q6R2W3 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ZBED9Q6R2W3 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ZBED9Q6R2W3 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ZBED9Q6R2W3 ZNF302-207ENST00000505365 2955 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ZBED9Q6R2W3 ANKS6-202ENST00000375019 2586 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ZBED9Q6R2W3 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ZBED9Q6R2W3 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ZBED9Q6R2W3 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ZBED9Q6R2W3 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ZBED9Q6R2W3 TSSC2-204ENST00000529482 2337 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ZBED9Q6R2W3 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ZBED9Q6R2W3 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ZBED9Q6R2W3 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ZBED9Q6R2W3 AC073347.1-201ENST00000421633 2643 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
ZBED9Q6R2W3 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ZBED9Q6R2W3 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ZBED9Q6R2W3 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ZBED9Q6R2W3 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ZBED9Q6R2W3 ARHGAP45-212ENST00000590577 3218 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ZBED9Q6R2W3 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ZBED9Q6R2W3 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ZBED9Q6R2W3 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
ZBED9Q6R2W3 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
ZBED9Q6R2W3 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC21.77■■□□□ 1.07
ZBED9Q6R2W3 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.07
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