Protein–RNA interactions for Protein: Q6P435

Putative uncharacterized SMG1-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 159 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q6P435 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Q6P435 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Q6P435 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Q6P435 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Q6P435 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Q6P435 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Q6P435 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Q6P435 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Q6P435 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Q6P435 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Q6P435 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Q6P435 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Q6P435 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Q6P435 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Q6P435 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Q6P435 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Q6P435 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Q6P435 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Q6P435 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Q6P435 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Q6P435 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Q6P435 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Q6P435 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Q6P435 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Q6P435 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Q6P435 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Q6P435 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Q6P435 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Q6P435 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Q6P435 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Q6P435 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Q6P435 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Q6P435 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Q6P435 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Q6P435 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Q6P435 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Q6P435 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Q6P435 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Q6P435 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Q6P435 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Q6P435 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Q6P435 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Q6P435 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Q6P435 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Q6P435 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Q6P435 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Q6P435 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Q6P435 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Q6P435 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Q6P435 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Q6P435 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Q6P435 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Q6P435 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Q6P435 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Q6P435 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Q6P435 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Q6P435 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Q6P435 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Q6P435 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Q6P435 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Q6P435 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Q6P435 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Q6P435 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Q6P435 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Q6P435 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Q6P435 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Q6P435 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Q6P435 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Q6P435 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Q6P435 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Q6P435 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Q6P435 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Q6P435 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Q6P435 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Q6P435 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Q6P435 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Q6P435 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Q6P435 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Q6P435 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Q6P435 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Q6P435 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Q6P435 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Q6P435 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Q6P435 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Q6P435 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.19
Q6P435 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Q6P435 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.19
Q6P435 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Q6P435 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Q6P435 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Q6P435 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Q6P435 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Q6P435 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Q6P435 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Q6P435 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Q6P435 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Q6P435 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Q6P435 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Q6P435 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Q6P435 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
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