Protein–RNA interactions for Protein: Q6NT76

HMBOX1, Homeobox-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMBOX1Q6NT76 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HMBOX1Q6NT76 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HMBOX1Q6NT76 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HMBOX1Q6NT76 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HMBOX1Q6NT76 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HMBOX1Q6NT76 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HMBOX1Q6NT76 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
HMBOX1Q6NT76 TPBG-202ENST00000535040 3392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HMBOX1Q6NT76 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HMBOX1Q6NT76 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HMBOX1Q6NT76 NPY5R-203ENST00000515560 3183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HMBOX1Q6NT76 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HMBOX1Q6NT76 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HMBOX1Q6NT76 TMED7-TICAM2-202ENST00000333314 3453 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HMBOX1Q6NT76 ZNF367-201ENST00000375256 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HMBOX1Q6NT76 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HMBOX1Q6NT76 EPS8L2-223ENST00000533256 3266 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HMBOX1Q6NT76 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HMBOX1Q6NT76 SYBU-208ENST00000440310 3072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HMBOX1Q6NT76 TFAP2C-201ENST00000201031 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HMBOX1Q6NT76 RER1-209ENST00000605895 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HMBOX1Q6NT76 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HMBOX1Q6NT76 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HMBOX1Q6NT76 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
HMBOX1Q6NT76 PLAGL1-208ENST00000437412 2640 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HMBOX1Q6NT76 NUP88-207ENST00000573584 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HMBOX1Q6NT76 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HMBOX1Q6NT76 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HMBOX1Q6NT76 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HMBOX1Q6NT76 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HMBOX1Q6NT76 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HMBOX1Q6NT76 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
HMBOX1Q6NT76 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
HMBOX1Q6NT76 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HMBOX1Q6NT76 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
HMBOX1Q6NT76 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
HMBOX1Q6NT76 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HMBOX1Q6NT76 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HMBOX1Q6NT76 JAKMIP1-204ENST00000409831 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HMBOX1Q6NT76 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HMBOX1Q6NT76 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HMBOX1Q6NT76 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HMBOX1Q6NT76 AC003986.2-201ENST00000419944 1711 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HMBOX1Q6NT76 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HMBOX1Q6NT76 STXBP5-207ENST00000546097 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HMBOX1Q6NT76 AC087164.1-202ENST00000583062 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HMBOX1Q6NT76 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HMBOX1Q6NT76 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HMBOX1Q6NT76 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HMBOX1Q6NT76 HNRNPA1-202ENST00000340913 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HMBOX1Q6NT76 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HMBOX1Q6NT76 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HMBOX1Q6NT76 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HMBOX1Q6NT76 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HMBOX1Q6NT76 VWA2-202ENST00000392982 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HMBOX1Q6NT76 IMPDH1-202ENST00000348127 2479 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HMBOX1Q6NT76 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HMBOX1Q6NT76 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HMBOX1Q6NT76 PODN-201ENST00000312553 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HMBOX1Q6NT76 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HMBOX1Q6NT76 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HMBOX1Q6NT76 VTN-201ENST00000226218 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HMBOX1Q6NT76 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HMBOX1Q6NT76 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HMBOX1Q6NT76 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HMBOX1Q6NT76 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
HMBOX1Q6NT76 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HMBOX1Q6NT76 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HMBOX1Q6NT76 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
HMBOX1Q6NT76 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HMBOX1Q6NT76 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
HMBOX1Q6NT76 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HMBOX1Q6NT76 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HMBOX1Q6NT76 TNFRSF14-AS1-201ENST00000416860 3522 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HMBOX1Q6NT76 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
HMBOX1Q6NT76 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HMBOX1Q6NT76 UBAC2-202ENST00000376440 2525 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HMBOX1Q6NT76 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HMBOX1Q6NT76 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HMBOX1Q6NT76 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HMBOX1Q6NT76 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HMBOX1Q6NT76 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HMBOX1Q6NT76 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HMBOX1Q6NT76 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HMBOX1Q6NT76 GTF3C4-201ENST00000372146 9043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HMBOX1Q6NT76 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HMBOX1Q6NT76 ZNF252P-AS1-201ENST00000527067 3236 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
HMBOX1Q6NT76 DDX55-201ENST00000238146 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HMBOX1Q6NT76 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
HMBOX1Q6NT76 ZNF662-201ENST00000328199 3186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
HMBOX1Q6NT76 BRF1-205ENST00000440513 2368 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
HMBOX1Q6NT76 ELFN1-201ENST00000424383 3845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
HMBOX1Q6NT76 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HMBOX1Q6NT76 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
HMBOX1Q6NT76 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HMBOX1Q6NT76 LINC02551-202ENST00000533812 2203 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
HMBOX1Q6NT76 POM121-203ENST00000434423 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
HMBOX1Q6NT76 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HMBOX1Q6NT76 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
HMBOX1Q6NT76 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.6 ms