Protein–RNA interactions for Protein: Q6KF10

GDF6, Growth/differentiation factor 6, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 455 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDF6Q6KF10 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GDF6Q6KF10 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GDF6Q6KF10 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GDF6Q6KF10 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GDF6Q6KF10 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GDF6Q6KF10 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GDF6Q6KF10 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GDF6Q6KF10 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GDF6Q6KF10 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GDF6Q6KF10 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GDF6Q6KF10 POMK-203ENST00000614426 1527 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GDF6Q6KF10 KLK8-211ENST00000600767 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GDF6Q6KF10 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
GDF6Q6KF10 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
GDF6Q6KF10 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
GDF6Q6KF10 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GDF6Q6KF10 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GDF6Q6KF10 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
GDF6Q6KF10 LINC00221-202ENST00000619530 1499 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
GDF6Q6KF10 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GDF6Q6KF10 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GDF6Q6KF10 FLYWCH2-201ENST00000293981 915 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
GDF6Q6KF10 NAA10-201ENST00000370009 837 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GDF6Q6KF10 NAA10-203ENST00000370015 1002 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
GDF6Q6KF10 MFAP2-201ENST00000375534 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
GDF6Q6KF10 AC079776.1-201ENST00000401540 1152 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
GDF6Q6KF10 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
GDF6Q6KF10 HLA-V-201ENST00000429037 534 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
GDF6Q6KF10 HSPB7-207ENST00000487046 844 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GDF6Q6KF10 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
GDF6Q6KF10 TPRX2P-201ENST00000535362 881 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
GDF6Q6KF10 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GDF6Q6KF10 RHBDL2-203ENST00000540558 697 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GDF6Q6KF10 GABARAPL2-202ENST00000563744 791 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GDF6Q6KF10 AC244517.11-204ENST00000624424 760 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
GDF6Q6KF10 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GDF6Q6KF10 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
GDF6Q6KF10 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GDF6Q6KF10 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GDF6Q6KF10 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
GDF6Q6KF10 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
GDF6Q6KF10 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GDF6Q6KF10 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GDF6Q6KF10 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GDF6Q6KF10 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GDF6Q6KF10 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GDF6Q6KF10 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
GDF6Q6KF10 ZNF789-201ENST00000331410 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
GDF6Q6KF10 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
GDF6Q6KF10 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
GDF6Q6KF10 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
GDF6Q6KF10 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
GDF6Q6KF10 KLK15-201ENST00000326856 1389 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
GDF6Q6KF10 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
GDF6Q6KF10 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
GDF6Q6KF10 WDR38-201ENST00000373574 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
GDF6Q6KF10 ESPNP-202ENST00000414828 571 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
GDF6Q6KF10 RAD18-204ENST00000418463 563 ntTSL 4 BASIC17.96■□□□□ 0.47
GDF6Q6KF10 RAD18-205ENST00000421052 582 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
GDF6Q6KF10 DNAJB6-209ENST00000443280 1159 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
GDF6Q6KF10 APOA1-AS-201ENST00000444200 563 ntTSL 4 BASIC17.96■□□□□ 0.47
GDF6Q6KF10 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
GDF6Q6KF10 AC011495.1-201ENST00000498085 584 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
GDF6Q6KF10 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
GDF6Q6KF10 MIR6069-201ENST00000620069 79 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
GDF6Q6KF10 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
GDF6Q6KF10 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
GDF6Q6KF10 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
GDF6Q6KF10 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
GDF6Q6KF10 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
GDF6Q6KF10 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
GDF6Q6KF10 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.46
GDF6Q6KF10 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
GDF6Q6KF10 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
GDF6Q6KF10 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
GDF6Q6KF10 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
GDF6Q6KF10 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
GDF6Q6KF10 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
GDF6Q6KF10 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
GDF6Q6KF10 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
GDF6Q6KF10 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
GDF6Q6KF10 RABEPK-206ENST00000628863 1537 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
GDF6Q6KF10 FTH1-201ENST00000273550 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
GDF6Q6KF10 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
GDF6Q6KF10 PIR-201ENST00000380420 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
GDF6Q6KF10 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
GDF6Q6KF10 TMEM161B-AS1-212ENST00000513011 833 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
GDF6Q6KF10 FAM92A-214ENST00000522324 1072 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
GDF6Q6KF10 FTH1-202ENST00000526640 786 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
GDF6Q6KF10 AP001995.1-201ENST00000531784 1157 ntTSL 4 BASIC17.95■□□□□ 0.46
GDF6Q6KF10 ZNF586-205ENST00000598885 578 ntTSL 4 BASIC17.95■□□□□ 0.46
GDF6Q6KF10 AL162274.1-201ENST00000617191 1098 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
GDF6Q6KF10 LMF1-AS1-202ENST00000569574 1408 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
GDF6Q6KF10 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
GDF6Q6KF10 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
GDF6Q6KF10 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
GDF6Q6KF10 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
GDF6Q6KF10 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
GDF6Q6KF10 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
GDF6Q6KF10 NCAPH2-202ENST00000395698 1388 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms