Protein–RNA interactions for Protein: Q6IPX1

TBC1D3C, TBC1 domain family member 3C, humanhuman

Predictions only

Length 549 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TBC1D3CQ6IPX1 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TBC1D3CQ6IPX1 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TBC1D3CQ6IPX1 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TBC1D3CQ6IPX1 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TBC1D3CQ6IPX1 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TBC1D3CQ6IPX1 AL031717.1-201ENST00000569670 565 ntTSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TBC1D3CQ6IPX1 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TBC1D3CQ6IPX1 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TBC1D3CQ6IPX1 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
TBC1D3CQ6IPX1 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TBC1D3CQ6IPX1 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TBC1D3CQ6IPX1 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TBC1D3CQ6IPX1 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TBC1D3CQ6IPX1 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TBC1D3CQ6IPX1 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TBC1D3CQ6IPX1 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TBC1D3CQ6IPX1 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TBC1D3CQ6IPX1 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TBC1D3CQ6IPX1 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TBC1D3CQ6IPX1 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TBC1D3CQ6IPX1 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TBC1D3CQ6IPX1 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TBC1D3CQ6IPX1 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TBC1D3CQ6IPX1 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TBC1D3CQ6IPX1 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TBC1D3CQ6IPX1 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TBC1D3CQ6IPX1 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TBC1D3CQ6IPX1 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TBC1D3CQ6IPX1 ENDOV-201ENST00000323854 1226 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TBC1D3CQ6IPX1 CRYGN-201ENST00000337323 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TBC1D3CQ6IPX1 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
TBC1D3CQ6IPX1 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TBC1D3CQ6IPX1 RAC2-204ENST00000406508 893 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TBC1D3CQ6IPX1 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TBC1D3CQ6IPX1 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TBC1D3CQ6IPX1 MIR210HG-203ENST00000533920 816 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TBC1D3CQ6IPX1 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TBC1D3CQ6IPX1 LINC02560-201ENST00000596379 459 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
TBC1D3CQ6IPX1 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TBC1D3CQ6IPX1 AL590560.3-201ENST00000623350 461 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
TBC1D3CQ6IPX1 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TBC1D3CQ6IPX1 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TBC1D3CQ6IPX1 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TBC1D3CQ6IPX1 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TBC1D3CQ6IPX1 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TBC1D3CQ6IPX1 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TBC1D3CQ6IPX1 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TBC1D3CQ6IPX1 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TBC1D3CQ6IPX1 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TBC1D3CQ6IPX1 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TBC1D3CQ6IPX1 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TBC1D3CQ6IPX1 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TBC1D3CQ6IPX1 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
TBC1D3CQ6IPX1 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TBC1D3CQ6IPX1 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TBC1D3CQ6IPX1 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TBC1D3CQ6IPX1 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TBC1D3CQ6IPX1 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TBC1D3CQ6IPX1 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TBC1D3CQ6IPX1 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
TBC1D3CQ6IPX1 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TBC1D3CQ6IPX1 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TBC1D3CQ6IPX1 AL035456.1-201ENST00000456064 1369 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
TBC1D3CQ6IPX1 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TBC1D3CQ6IPX1 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TBC1D3CQ6IPX1 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TBC1D3CQ6IPX1 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TBC1D3CQ6IPX1 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TBC1D3CQ6IPX1 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TBC1D3CQ6IPX1 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TBC1D3CQ6IPX1 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TBC1D3CQ6IPX1 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TBC1D3CQ6IPX1 PNPO-202ENST00000434554 1196 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TBC1D3CQ6IPX1 AC016735.2-201ENST00000438736 569 ntTSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TBC1D3CQ6IPX1 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
TBC1D3CQ6IPX1 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TBC1D3CQ6IPX1 CCDC159-201ENST00000458408 1062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TBC1D3CQ6IPX1 TOMM5-205ENST00000544379 635 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TBC1D3CQ6IPX1 AC190387.1-201ENST00000551683 408 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
TBC1D3CQ6IPX1 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TBC1D3CQ6IPX1 AC015712.4-202ENST00000558641 1007 ntTSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TBC1D3CQ6IPX1 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TBC1D3CQ6IPX1 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TBC1D3CQ6IPX1 AC116003.1-201ENST00000578340 536 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TBC1D3CQ6IPX1 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TBC1D3CQ6IPX1 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TBC1D3CQ6IPX1 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TBC1D3CQ6IPX1 FAM92A-219ENST00000620645 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TBC1D3CQ6IPX1 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TBC1D3CQ6IPX1 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TBC1D3CQ6IPX1 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TBC1D3CQ6IPX1 AC100757.3-201ENST00000622361 1406 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
TBC1D3CQ6IPX1 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TBC1D3CQ6IPX1 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TBC1D3CQ6IPX1 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TBC1D3CQ6IPX1 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TBC1D3CQ6IPX1 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TBC1D3CQ6IPX1 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TBC1D3CQ6IPX1 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TBC1D3CQ6IPX1 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.3 ms