Protein–RNA interactions for Protein: Q6IPU0

CENPP, Centromere protein P, humanhuman

Predictions only

Length 288 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPPQ6IPU0 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CENPPQ6IPU0 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CENPPQ6IPU0 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CENPPQ6IPU0 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CENPPQ6IPU0 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CENPPQ6IPU0 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CENPPQ6IPU0 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CENPPQ6IPU0 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CENPPQ6IPU0 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CENPPQ6IPU0 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
CENPPQ6IPU0 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
CENPPQ6IPU0 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CENPPQ6IPU0 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CENPPQ6IPU0 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
CENPPQ6IPU0 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CENPPQ6IPU0 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CENPPQ6IPU0 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CENPPQ6IPU0 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CENPPQ6IPU0 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CENPPQ6IPU0 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CENPPQ6IPU0 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CENPPQ6IPU0 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CENPPQ6IPU0 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CENPPQ6IPU0 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CENPPQ6IPU0 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
CENPPQ6IPU0 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CENPPQ6IPU0 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CENPPQ6IPU0 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CENPPQ6IPU0 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CENPPQ6IPU0 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CENPPQ6IPU0 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CENPPQ6IPU0 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CENPPQ6IPU0 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CENPPQ6IPU0 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CENPPQ6IPU0 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CENPPQ6IPU0 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CENPPQ6IPU0 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CENPPQ6IPU0 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CENPPQ6IPU0 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CENPPQ6IPU0 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
CENPPQ6IPU0 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CENPPQ6IPU0 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
CENPPQ6IPU0 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CENPPQ6IPU0 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CENPPQ6IPU0 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CENPPQ6IPU0 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CENPPQ6IPU0 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CENPPQ6IPU0 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CENPPQ6IPU0 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CENPPQ6IPU0 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CENPPQ6IPU0 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CENPPQ6IPU0 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CENPPQ6IPU0 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
CENPPQ6IPU0 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CENPPQ6IPU0 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CENPPQ6IPU0 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CENPPQ6IPU0 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CENPPQ6IPU0 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CENPPQ6IPU0 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CENPPQ6IPU0 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CENPPQ6IPU0 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CENPPQ6IPU0 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CENPPQ6IPU0 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CENPPQ6IPU0 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CENPPQ6IPU0 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CENPPQ6IPU0 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CENPPQ6IPU0 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CENPPQ6IPU0 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CENPPQ6IPU0 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CENPPQ6IPU0 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CENPPQ6IPU0 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CENPPQ6IPU0 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CENPPQ6IPU0 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
CENPPQ6IPU0 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CENPPQ6IPU0 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CENPPQ6IPU0 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CENPPQ6IPU0 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CENPPQ6IPU0 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
CENPPQ6IPU0 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CENPPQ6IPU0 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CENPPQ6IPU0 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CENPPQ6IPU0 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CENPPQ6IPU0 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CENPPQ6IPU0 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CENPPQ6IPU0 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CENPPQ6IPU0 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CENPPQ6IPU0 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CENPPQ6IPU0 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CENPPQ6IPU0 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CENPPQ6IPU0 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CENPPQ6IPU0 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CENPPQ6IPU0 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CENPPQ6IPU0 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CENPPQ6IPU0 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CENPPQ6IPU0 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
CENPPQ6IPU0 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CENPPQ6IPU0 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CENPPQ6IPU0 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
CENPPQ6IPU0 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CENPPQ6IPU0 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms