Protein–RNA interactions for Protein: Q68CZ2

TNS3, Tensin-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,445 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNS3Q68CZ2 UROS-203ENST00000368786 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TNS3Q68CZ2 KLK4-202ENST00000431178 481 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TNS3Q68CZ2 AL669970.3-201ENST00000435284 428 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TNS3Q68CZ2 FAM86LP-201ENST00000478302 853 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
TNS3Q68CZ2 PLEKHB1-206ENST00000535129 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TNS3Q68CZ2 AP001453.3-201ENST00000545800 853 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TNS3Q68CZ2 MIR3615-201ENST00000581999 87 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
TNS3Q68CZ2 SCGB1C2-201ENST00000595228 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TNS3Q68CZ2 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TNS3Q68CZ2 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TNS3Q68CZ2 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TNS3Q68CZ2 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TNS3Q68CZ2 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TNS3Q68CZ2 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TNS3Q68CZ2 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TNS3Q68CZ2 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TNS3Q68CZ2 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TNS3Q68CZ2 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TNS3Q68CZ2 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TNS3Q68CZ2 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TNS3Q68CZ2 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TNS3Q68CZ2 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TNS3Q68CZ2 RHD-204ENST00000417538 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TNS3Q68CZ2 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TNS3Q68CZ2 BCS1L-203ENST00000392110 1525 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TNS3Q68CZ2 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TNS3Q68CZ2 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TNS3Q68CZ2 IGHV3-16-201ENST00000390604 425 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TNS3Q68CZ2 AZGP1P1-201ENST00000411909 902 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
TNS3Q68CZ2 AC074338.1-201ENST00000416825 156 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
TNS3Q68CZ2 GPAA1P2-201ENST00000417923 928 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
TNS3Q68CZ2 C2orf69P2-201ENST00000562032 1123 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
TNS3Q68CZ2 AC010491.1-202ENST00000567048 528 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TNS3Q68CZ2 AC087741.1-202ENST00000573346 801 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TNS3Q68CZ2 ARL16-210ENST00000574938 751 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TNS3Q68CZ2 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
TNS3Q68CZ2 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TNS3Q68CZ2 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TNS3Q68CZ2 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TNS3Q68CZ2 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TNS3Q68CZ2 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TNS3Q68CZ2 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TNS3Q68CZ2 FBP1-203ENST00000415431 1487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TNS3Q68CZ2 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TNS3Q68CZ2 AL355864.2-201ENST00000447420 863 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
TNS3Q68CZ2 PFN1P12-201ENST00000455938 534 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
TNS3Q68CZ2 FTH1P14-201ENST00000482930 551 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
TNS3Q68CZ2 MTUS1-215ENST00000519066 567 ntTSL 4 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TNS3Q68CZ2 KRT90P-201ENST00000549264 1064 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
TNS3Q68CZ2 TSR1-204ENST00000576112 1290 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TNS3Q68CZ2 ZNF180-204ENST00000586637 1023 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TNS3Q68CZ2 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TNS3Q68CZ2 ZNF711-201ENST00000276123 2887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TNS3Q68CZ2 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TNS3Q68CZ2 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TNS3Q68CZ2 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TNS3Q68CZ2 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TNS3Q68CZ2 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TNS3Q68CZ2 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TNS3Q68CZ2 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TNS3Q68CZ2 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TNS3Q68CZ2 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TNS3Q68CZ2 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TNS3Q68CZ2 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TNS3Q68CZ2 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TNS3Q68CZ2 CSHL1-203ENST00000346606 659 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TNS3Q68CZ2 PKIG-203ENST00000372887 769 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TNS3Q68CZ2 PEMT-203ENST00000395782 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TNS3Q68CZ2 YBX1P6-201ENST00000442962 1002 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
TNS3Q68CZ2 METTL21A-209ENST00000448823 869 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TNS3Q68CZ2 LINC01248-201ENST00000458264 468 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TNS3Q68CZ2 HOXC-AS3-201ENST00000509870 544 ntTSL 4 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TNS3Q68CZ2 AC009720.1-201ENST00000511867 586 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TNS3Q68CZ2 ACYP1-206ENST00000555694 565 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TNS3Q68CZ2 AC129510.1-201ENST00000579979 555 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TNS3Q68CZ2 C19orf38-203ENST00000592854 1060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TNS3Q68CZ2 LINC01663-201ENST00000614596 535 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TNS3Q68CZ2 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TNS3Q68CZ2 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TNS3Q68CZ2 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TNS3Q68CZ2 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TNS3Q68CZ2 MAP2K6-209ENST00000613873 1509 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
TNS3Q68CZ2 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC21.83■■□□□ 1.08
TNS3Q68CZ2 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
TNS3Q68CZ2 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
TNS3Q68CZ2 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
TNS3Q68CZ2 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
TNS3Q68CZ2 RMND1-205ENST00000622845 1484 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
TNS3Q68CZ2 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TNS3Q68CZ2 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TNS3Q68CZ2 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TNS3Q68CZ2 CAPZB-204ENST00000375144 1568 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TNS3Q68CZ2 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TNS3Q68CZ2 B9D2-201ENST00000243578 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TNS3Q68CZ2 TSFM-201ENST00000323833 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TNS3Q68CZ2 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TNS3Q68CZ2 ATP5D-202ENST00000395633 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TNS3Q68CZ2 AC127070.2-201ENST00000424075 555 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TNS3Q68CZ2 AP000552.1-208ENST00000452952 576 ntTSL 4 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TNS3Q68CZ2 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms